PCDHA3 - PCDHA3

PCDHA3
Белок PCDHA3 PDB 1wuz.png
Идентификаторы
ПсевдонимыPCDHA3, PCDH-ALPHA3, протокадгерин альфа 3
Внешние идентификаторыOMIM: 606309 MGI: 2447313 ГомолоГен: 129613 Генные карты: PCDHA3
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение PCDHA3
Геномное расположение PCDHA3
Группа5q31.3Начинать140,801,028 бп[1]
Конец141,012,347 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PCDHA3 210572 at fs.png

PBB GE PCDHA3 211870 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_031497
NM_018906

NM_138662

RefSeq (белок)

NP_061729
NP_113685

NP_619603

Расположение (UCSC)Chr 5: 140,8 - 141,01 МбChr 18: 36.95 - 37.19 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Протокадгерин альфа-3 это белок что у людей кодируется PCDHA3 ген.[5][6]

Этот ген является членом кластера генов протокадгерина альфа, одного из трех связанных кластеров генов, тандемно связанных на хромосома 5 которые демонстрируют необычную геномную организацию, похожую на В-клетка и Т-клетка кластеры рецепторных генов.

Кластер альфа-генов состоит из 15 кадгерин суперсемейство генов связано с генами CNR мыши и состоит из 13 очень похожих и 2 более отдаленно связанных кодирующих последовательностей. Тандемный массив из 15 N-терминалов экзоны, или переменные экзоны, следуют ниже по течению C-терминал экзоны, или постоянные экзоны, которые являются общими для всех генов в кластере. Большой, непрерывный N-концевой каждый из экзонов кодирует шесть эктодоменов кадгерина, в то время как C-концевые экзоны кодируют цитоплазматический домен.

Эти нейронные кадгерин-подобные белки клеточной адгезии являются неотъемлемой частью плазматическая мембрана белки, которые, скорее всего, играют решающую роль в установлении и функционировании специфических межклеточных связей в головном мозге. Наблюдалось альтернативное сращивание и предлагались дополнительные варианты, но их полноразмерный характер еще предстоит определить.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000255408 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000102312 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Wu Q, Maniatis T (июль 1999 г.). «Поразительная организация большого семейства генов адгезии нейронных кадгерин-подобных клеток». Клетка. 97 (6): 779–90. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80789-8. PMID  10380929. S2CID  6014717.
  6. ^ а б «Ген Entrez: протокол PCDHA3 альфа 3».

дальнейшее чтение