PCDHB5 - PCDHB5

PCDHB5
Идентификаторы
Псевдонимы	PCDHB5, PCDH-BETA5, протокадгерин бета 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 606331 MGI: 2136745 ГомолоГен: 88834 Генные карты: PCDHB5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q31.3 Начинать 141,135,206 бп[1] Конец 141,138,615 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны Биологический процесс • кальций-зависимая клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • сборка синапсов • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • химическая синаптическая передача • клеточная адгезия Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26167	93881
Ансамбль	ENSG00000113209	ENSMUSG00000045657
UniProt	Q9Y5E4	Q91VE5
RefSeq (мРНК)	NM_015669	NM_053135
RefSeq (белок)	NP_056484	NP_444365
Расположение (UCSC)	Chr 5: 141.14 - 141.14 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протокадгерин бета-5 это белок что у людей кодируется PCDHB5 ген.^[4][5]

Этот ген является членом протоколадгерин кластер бета-генов, один из трех связанных кластеров генов, тандемно связанных на хромосома пятая. Кластеры генов демонстрируют необычную геномную организацию, аналогичную организации В-клетка и Т-клетка кластеры рецепторных генов. Бета-кластер содержит 16 генов и 3 псевдогены, каждая из которых кодирует 6 внеклеточных кадгерин домены и цитоплазматический хвост, который отличается от других в надсемействе кадгеринов. Внеклеточные домены взаимодействуют в гомофильный способ определения дифференциальных соединений ячейка-ячейка. В отличие от альфа- и гамма-кластеров, транскрипты этих генов состоят только из одного большого экзон, не разделяя общие 3 'экзоны, как ожидалось. Эти нервный кадгерин-подобные белки клеточной адгезии являются неотъемлемой частью плазматическая мембрана белки. Их специфические функции неизвестны, но они, скорее всего, играют решающую роль в установлении и функционировании специфических межклеточных нейронных связей.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113209 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Wu Q, Maniatis T (июль 1999 г.). «Поразительная организация большого семейства генов адгезии нервных кадгерин-подобных клеток человека». Клетка. 97 (6): 779–90. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80789-8. PMID  10380929. S2CID  6014717.
5. «Ген Entrez: PCDHB5 протокол бета 5».

дальнейшее чтение

• Яги Т., Такейчи М. (2000). «Гены суперсемейства кадгеринов: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие». Genes Dev. 14 (10): 1169–80. Дои:10.1101 / gad.14.10.1169 (неактивно 11.10.2020). PMID  10817752.
• Ноллет Ф., Кулс П., Ван Рой Ф. (2000). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгеринов позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств помимо нескольких отдельных членов». J. Mol. Биол. 299 (3): 551–72. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3777. PMID  10835267.
• Франк М., Кемлер Р. (2003). «Протокадгерины». Curr. Мнение. Cell Biol. 14 (5): 557–62. Дои:10.1016 / S0955-0674 (02) 00365-4. PMID  12231349.
• Ву Кью, Маниатис Т. (2000). «Большие экзоны, кодирующие несколько эктодоменов, являются характерной чертой генов протокадгерина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3124–9. Дои:10.1073 / pnas.060027397. ЧВК  16203. PMID  10716726.
• Wu Q, Zhang T, Cheng JF и др. (2001). «Сравнительный анализ последовательности ДНК кластеров генов протокадгерина мыши и человека». Genome Res. 11 (3): 389–404. Дои:10.1101 / гр.167301. ЧВК  311048. PMID  11230163.
• Ванхалст К., Кулс П., Ванден Эйнде Э, ван Рой Ф (2001). «Семейства одноэкзонных генов протокадгерина-бета человека и мыши демонстрируют высокую эволюционную консервативность, несмотря на разницу в количестве генов». FEBS Lett. 495 (1–2): 120–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02372-9. PMID  11322959. S2CID  36671435.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039. S2CID  21903526.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.