PCDHGA12 - PCDHGA12
Протокадгерин гамма-A12 это белок что у людей кодируется PCDHGA12 ген.[5][6]
Этот ген является членом кластера генов протокадгерина гамма, одного из трех связанных кластеров, тандемно связанных на пятой хромосоме. Эти кластеры генов имеют иммуноглобулиноподобную организацию, что позволяет предположить, что в их регуляции и экспрессии может быть задействован новый механизм. Кластер гамма-генов включает 22 гена, разделенных на 3 подсемейства. Подсемейство A содержит 12 генов, подсемейство B содержит 7 генов и 2 псевдогена, а более отдаленное родственное подсемейство C содержит 3 гена. За тандемным массивом из 22 больших экзонов вариабельной области следует константная область, содержащая 3 экзона, общие для всех генов в кластере. Каждый экзон вариабельной области кодирует внеклеточную область, которая включает 6 эктодоменов кадгерина и трансмембранную область. Экзоны константной области кодируют общую цитоплазматическую область. Эти нейронные кадгерин-подобные белки клеточной адгезии, скорее всего, играют решающую роль в установлении и функционировании специфических межклеточных связей в головном мозге. Альтернативный сплайсинг был описан для генов гамма-кластера.[6]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000253159 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000102428 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Wu Q, Maniatis T (июль 1999 г.). «Поразительная организация большого семейства генов адгезии нейронных кадгерин-подобных клеток». Клетка. 97 (6): 779–90. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80789-8. PMID 10380929. S2CID 6014717.
- ^ а б "Entrez Gene: PCDHGA12 гамма-подсемейство A, 12".
дальнейшее чтение
- Ноллет Ф., Кулс П., Ван Рой Ф. (2000). «Филогенетический анализ суперсемейства кадгеринов позволяет идентифицировать шесть основных подсемейств помимо нескольких отдельных членов». J. Mol. Биол. 299 (3): 551–72. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3777. PMID 10835267.
- Яги Т., Такейчи М. (2000). «Гены суперсемейства кадгеринов: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие». Genes Dev. 14 (10): 1169–80. Дои:10.1101 / gad.14.10.1169 (неактивно 11.10.2020). PMID 10817752.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на октябрь 2020 г. (связь)
- Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК 403697. PMID 12975309.
- Wu Q, Zhang T, Cheng JF и др. (2001). «Сравнительный анализ последовательности ДНК кластеров генов протокадгерина мыши и человека». Genome Res. 11 (3): 389–404. Дои:10.1101 / гр.167301. ЧВК 311048. PMID 11230163.
- Ву Кью, Маниатис Т. (2000). «Большие экзоны, кодирующие несколько эктодоменов, являются характерной чертой генов протокадгерина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3124–9. Дои:10.1073 / pnas.060027397. ЧВК 16203. PMID 10716726.
- Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID 9628581.
- Мацуёси Н., Имамура С. (1997). «Множественные кадгерины экспрессируются в человеческих фибробластах». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 235 (2): 355–8. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6707. PMID 9199196.