PCGF6 - PCGF6

PCGF6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DJB
Идентификаторы
Псевдонимы	PCGF6, MBLR, RNF134, безымянный палец поликомбовой группы 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 607816 MGI: 1918291 ГомолоГен: 12378 Генные карты: PCGF6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q24.33 Начинать 103,302,796 бп[1] Конец 103,351,144 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 C3 Начинать 47,033,617 бп[2] Конец 47,050,906 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание ионов металлов Сотовый компонент • ядро клетки • Белковый комплекс PcG • нуклеоплазма • PRC1 комплекс Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • моноубиквитинирование гистона H2A-K119 • отрицательное регулирование перехода G0 на G1 • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • инактивация Х-хромосомы путем генетического импринтинга Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84108	71041
Ансамбль	ENSG00000156374	ENSMUSG00000025050
UniProt	Q9BYE7	Q99NA9
RefSeq (мРНК)	NM_001011663 NM_032154	NM_027654 NM_001360632
RefSeq (белок)	NP_001011663 NP_115530	NP_081930 NP_001347561
Расположение (UCSC)	Chr 10: 103,3 - 103,35 Мб	Chr 19: 47.03 - 47.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Polycomb group RING finger протеин 6 это белок что у людей кодируется PCGF6 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, содержит Безымянный палец мотив, который наиболее близок к мотивам белков группы поликомб (PcG) RNF110 / MEL-18 и ИМТ1. Известно, что белки PcG образуют белковые комплексы и действуют как репрессоры транскрипции. Было показано, что этот белок взаимодействует с некоторыми Белки PcG и действовать как репрессор транскрипции. Установлено, что активность этого белка регулируется зависимыми от клеточного цикла фосфорилирование. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы были идентифицированы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000156374 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000025050 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Акасака Т., Такахаши Н., Судзуки М., Косеки Х., Бодмер Р., Кога Х. (август 2002 г.). «MBLR, новый белок пальца RING, напоминающий генные продукты Polycomb млекопитающих, регулируется зависимым от клеточного цикла фосфорилированием» (PDF). Гены Клетки. 7 (8): 835–50. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2002.00565.x. HDL:2027.42/72663. PMID  12167161. S2CID  23060582.
6. «Entrez Gene: PCGF6 polycomb group безымянный палец 6».

дальнейшее чтение

• Канно М., Хасегава М., Исида А. и др. (1996). «mel-18, ген млекопитающих, относящийся к группе Polycomb, кодирует транскрипционный негативный регулятор с опухолевой супрессивной активностью». EMBO J. 14 (22): 5672–8. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00254.x. ЧВК  394682. PMID  8521824.
• Тримарчи Дж. М., Фэйрчайлд Б., Вен Дж., Лис Дж. А. (2001). «Фактор транскрипции E2F6 является компонентом Bmi1-содержащего поликомб комплекса млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (4): 1519–24. Дои:10.1073 / pnas.041597698. ЧВК  29289. PMID  11171983.
• Судзуки М., Мизутани-Косеки Ю., Фудзимура Ю. и др. (2002). «Участие гена Ring1B группы Polycomb в спецификации передне-задней оси у мышей». Разработка. 129 (18): 4171–83. PMID  12183370.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Делукас П., Earthrowl ME, Grafham DV, et al. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 10 человека». Природа. 429 (6990): 375–81. Дои:10.1038 / природа02462. PMID  15164054.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Чжун Н., Раду Г., Джу В., Браун В. Т. (2006). «Новые взаимодействующие с прогерином белки-партнеры hnRNP E1, EGF, Mel 18 и UBC9 взаимодействуют с ламином A / C». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 338 (2): 855–61. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.10.020. PMID  16248985.
• Ли М.Г., Норман Дж., Шилатифард А, Шихаттар Р. (2007). «Физическая и функциональная ассоциация деметилазы триметил H3K4 и Ring6a / MBLR, поликомб-подобного белка». Клетка. 128 (5): 877–87. Дои:10.1016 / j.cell.2007.02.004. PMID  17320162. S2CID  6519228.