PCOLCE - PCOLCE - Wikipedia

PCOLCE
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1UAP
Идентификаторы
Псевдонимы	PCOLCE, PCPE, PCPE-1, PCPE1, проколлагеновый усилитель С-эндопептидазы
Внешние идентификаторы	OMIM: 600270 MGI: 105099 ГомолоГен: 1946 Генные карты: PCOLCE
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q22.1 Начинать 100,602,363 бп[1] Конец 100,608,175 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 G2 | 5 76,59 см Начинать 137,605,103 бп[2] Конец 137,613,784 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гепарина • GO: 0001948 связывание с белками • активность активатора пептидазы • связывание коллагена • структурная составляющая внеклеточного матрикса Сотовый компонент • внеклеточный матрикс • внеклеточная экзосома • внеклеточный • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • протеолиз • положительная регуляция активности пептидазы • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5118	18542
Ансамбль	ENSG00000106333	ENSMUSG00000029718
UniProt	Q15113	Q61398
RefSeq (мРНК)	NM_002593	NM_008788
RefSeq (белок)	NP_002584	NP_032814
Расположение (UCSC)	Chr 7: 100,6 - 100,61 Мб	Chr 5: 137.61 - 137.61 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Проколлагеновый усилитель С-эндопептидазы 1 является фермент что у людей кодируется PCOLCE ген.^[5][6][7]

Фибриллярный коллаген I-III типов синтезируется в виде молекул-предшественников, известных как проколлагены. Эти предшественники содержат амино- и карбоксильные концевые пептид расширения, известные как N- и C-пропептиды соответственно, которые расщепляются при секреции проколлагена из клетки с образованием зрелой тройной спирали с высокой структурой фибриллы. Этот ген кодирует гликопротеин который связывает и стимулирует ферментативное расщепление проколлагена I типа и повышает активность.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106333 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029718 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Такахара К., Осборн Л., Эллиотт Р.В., Цуй Л.К., Шерер С.В., Гринспен Д.С. (март 1997 г.). «Тонкое картирование генов человека и мыши для белка-усилителя COOH-концевой протеиназы проколлагена типа I». Геномика. 31 (2): 253–256. Дои:10.1006 / geno.1996.0043. PMID  8824813.
6. Глокнер Г., Шерер С., Шаттевой Р., Боррайт А., Вебер Дж., Цуй Л.С., Розенталь А. (декабрь 1998 г.). «Крупномасштабное секвенирование двух областей хромосомы 7q22 человека: анализ 650 т.п.н. геномной последовательности вокруг локусов EPO и CUTL1 выявил 17 генов». Genome Res. 8 (10): 1060–1073. Дои:10.1101 / гр. 8.10.1060. ЧВК  310788. PMID  9799793.
7. «Ген Entrez: усилитель проколлагеновой С-эндопептидазы PCOLCE».

дальнейшее чтение

• Такахара К., Кесслер Э., Биняминов Л. и др. (1994). «Белок-усилитель COOH-концевой протеиназы проколлагена типа I: идентификация, первичная структура и хромосомная локализация родственного гена человека (PCOLCE)». J. Biol. Chem. 269 (42): 26280–26285. PMID  7523404.
• Скотт И.С., Кларк Т.Г., Такахара К. и др. (1999). «Структурная организация и образцы экспрессии генов человека и мыши для белка-усилителя COOH-концевой протеиназы проколлагена типа I». Геномика. 55 (2): 229–234. Дои:10.1006 / geno.1998.5663. PMID  9933570.
• Мотт Дж. Д., Томас К. Л., Розенбах М. Т. и др. (2000). «Посттрансляционный протеолитический процессинг усилителя С-концевой протеиназы проколлагена высвобождает ингибитор металлопротеиназы». J. Biol. Chem. 275 (2): 1384–1390. Дои:10.1074 / jbc.275.2.1384. PMID  10625689.
• Ricard-Blum S, Bernocco S, Font B и др. (2002). «Свойства взаимодействия белка-усилителя проколлагеновой С-протеиназы проливают свет на механизм стимуляции BMP-1». J. Biol. Chem. 277 (37): 33864–33869. Дои:10.1074 / jbc.M205018200. PMID  12105202.
• Лигон А.Х., Скотт И.С., Такахара К. и др. (2002). «Анализ делеции и экспрессии PCOLCE в лейомиомах матки». Рак Генет. Цитогенет. 137 (2): 133–137. Дои:10.1016 / S0165-4608 (02) 00547-2. PMID  12393284.
• Стейглиц Б.М., Кин Д.Р., Гринспен Д.С. (2003). «PCOLCE2 кодирует функциональный энхансер C-протеиназы проколлагена (PCPE2), который представляет собой коллаген-связывающий белок, отличающийся по распределению экспрессии и посттрансляционной модификации от ранее описанного PCPE1». J. Biol. Chem. 277 (51): 49820–49830. Дои:10.1074 / jbc.M209891200. PMID  12393877.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Bernocco S, Steiglitz BM, Svergun DI и др. (2003). «Определение структуры с низким разрешением показывает, что усилитель проколлагеновой С-протеиназы представляет собой удлиненный многодоменный гликопротеин». J. Biol. Chem. 278 (9): 7199–7205. Дои:10.1074 / jbc.M210857200. PMID  12486138.
• Лиепиньш Э., Баньяи Л., Пинтакуда Г. и др. (2003). «Структура ЯМР нетриноподобного домена (NTR) усилителя С-протеиназы проколлагена I типа человека определяет структурный консенсус NTR-доменов и оценивает потенциальную ингибирующую активность протеиназы и связывание лиганда». J. Biol. Chem. 278 (28): 25982–25989. Дои:10.1074 / jbc.M302734200. PMID  12670942.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Петропулу В., Гарриг-Антар Л., Кадлер К. Э. (2005). «Идентификация минимальной доменной структуры костного морфогенетического белка-1 (BMP-1) для активности хординазы: активность хординазы не усиливается усилителем-1 проколлагеновой С-протеиназы (PCPE-1)». J. Biol. Chem. 280 (24): 22616–22623. Дои:10.1074 / jbc.M413468200. PMID  15817489.
• Ge G, Zhang Y, Steiglitz BM, Greenspan DS (2006). «Толлоид-подобный 1 млекопитающих связывает проколлагеновый белок-усилитель С-протеиназы 1 и отличается от костного морфогенетического белка 1 функциональными ролями гомологичных белковых доменов». J. Biol. Chem. 281 (16): 10786–10798. Дои:10.1074 / jbc.M511111200. PMID  16507574.
• Blanc G, Font B, Eichenberger D, et al. (2007). «Понимание того, как домены CUB могут выполнять специфические функции, разделяя общую структуру: консервативные и специфические особенности домена CUB1 вносят вклад в молекулярную основу активности усилителя-1 проколлагеновой С-протеиназы». J. Biol. Chem. 282 (23): 16924–16933. Дои:10.1074 / jbc.M701610200. PMID  17446170.