PDCD6 - PDCD6

PDCD6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2ZN8, 2ZN9, 2ZND, 2ZNE, 2ZRS, 2ZRT, 3AAJ, 3AAK, 3WXA
Идентификаторы
Псевдонимы	PDCD6, ALG-2, PEF1B, ALG2, программируемая гибель клеток 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 601057 MGI: 109283 ГомолоГен: 7880 Генные карты: PDCD6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5п15.33 Начинать 271,621 бп[1] Конец 314,974 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • активность димеризации белков • якорь белковой мембраны • кальций-зависимое связывание с белками • связывание ионов металлов • кальций-зависимая активность эндопептидазы цистеинового типа • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера • связывание ионов магния • связывание ионов кальция • активность гомодимеризации белков • связывание с белками, мостик Сотовый компонент • цитоплазма • эндосома • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • эндоплазматический ретикулум • внеклеточная экзосома • ядро клетки • Мембрана Гольджи • Покрытие везикул COPII • Cul3-RING убиквитинлигазный комплекс • место выхода эндоплазматического ретикулума • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • отрицательная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • клеточный ответ на тепло • сигнальный путь рецептора-2 фактора роста эндотелия сосудов • положительная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста эндотелия сосудов • положительная регуляция ангиогенеза • положительная регуляция миграции эндотелиальных клеток • ответ на ион кальция • отрицательная регуляция передачи сигналов TOR • положительная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • ангиогенез • апоптотический сигнальный путь • внутриклеточный транспорт белка • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • апоптотический процесс • протеолиз • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • формирование нервного гребня • развитие клеток нервного гребня • Покрытие везикул COPII • положительная регуляция моноубиквитинирования белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10016	18570
Ансамбль	ENSG00000249915	ENSMUSG00000021576
UniProt	O75340	P12815
RefSeq (мРНК)	NM_001267556 NM_001267557 NM_001267558 NM_001267559 NM_013232	NM_011051 NM_001359996
RefSeq (белок)	NP_001254485 NP_001254486 NP_001254487 NP_001254488 NP_037364	NP_035181 NP_001346925
Расположение (UCSC)	Chr 5: 0,27 - 0,31 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок запрограммированной гибели клеток 6 это белок что у людей кодируется PDCD6 ген.^[4]

Этот ген кодирует кальций-связывающий белок, принадлежащий к семейству белков penta-EF-hand. Связывание кальция важно для гомодимеризации и конформационных изменений, необходимых для связывания с другими белками-партнерами. Этот генный продукт участвует в программируемой гибели клеток, индуцированной Т-клеточными рецепторами, Fas- и глюкокортикоидами. Однако у мышей с дефицитом этого генного продукта апоптоз не блокировался, что позволяет предположить, что этот генный продукт является функционально избыточным.^[5]

Взаимодействия

PDCD6 показал себя взаимодействовать с ASK1,^[6] PDCD6IP,^[7][8] Рецептор Fas,^[9] ANXA11^[8] и PEF1.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000249915 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Вито П., Лакана Е., Д'Адамио Л. (февраль 1996 г.). «Вмешательство в апоптоз: Са (2 +) - связывающий белок ALG-2 и ген болезни Альцгеймера ALG-3». Наука. 271 (5248): 521–5. Bibcode:1996Наука ... 271..521В. Дои:10.1126 / science.271.5248.521. PMID  8560270. S2CID  22286752.
5. «Ген Entrez: PDCD6 запрограммированная гибель клеток 6».
6. Хван, Ин-Сик; Юнг Ён-Сам; Ким Ынхи (октябрь 2002 г.). «Взаимодействие ALG-2 с ASK1 влияет на локализацию ASK1 и последующую активацию JNK». FEBS Lett. Нидерланды. 529 (2–3): 183–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03329-X. ISSN  0014-5793. PMID  12372597. S2CID  9264865.
7. Вито, П; Pellegrini L; Guiet C; Д'Адамио Л. (январь 1999 г.). «Клонирование AIP1, нового белка, который связывается с геном, связанным с апоптозом ALG-2, в Ca2 + -зависимой реакции». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 274 (3): 1533–40. Дои:10.1074 / jbc.274.3.1533. ISSN  0021-9258. PMID  9880530.
8. Сато, Хирокадзу; Шибата Хидеки; Накано Йошими; Китаура Ясуюки; Маки Масатоши (март 2002 г.). «ALG-2 взаимодействует с аминоконцевым доменом аннексина XI Ca (2 +) - зависимым образом». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. Соединенные Штаты. 291 (5): 1166–72. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6600. ISSN  0006-291X. PMID  11883939.
9. Юнг, Й. С.; Kim K S; Kim K D; Lim J S; Kim J W; Ким Э (октябрь 2001 г.). «Ген 2, связанный с апоптозом, связывается с доменом гибели Fas и диссоциирует от Fas во время Fas-опосредованного апоптоза в клетках Jurkat». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. Соединенные Штаты. 288 (2): 420–6. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5769. ISSN  0006-291X. PMID  11606059.
10. Китаура, Й; Мацумото S; Satoh H; Hitomi K; Маки М (апрель 2001 г.). «Пефлин и ALG-2, члены семейства белков penta-EF-hand, образуют гетеродимер, который диссоциирует Ca2 + -зависимым образом». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 276 (17): 14053–8. Дои:10.1074 / jbc.M008649200. ISSN  0021-9258. PMID  11278427.

дальнейшее чтение

• Кребс Дж, Клеменц Р. (2001). «Комплекс ALG-2 / AIP, модулятор на границе между пролиферацией и гибелью клеток? Гипотеза». Биохим. Биофиз. Acta. 1498 (2–3): 153–61. Дои:10.1016 / S0167-4889 (00) 00091-4. PMID  11108958.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Вито П., Пеллегрини Л., Гуйет С., Д'Адамио Л. (1999). «Клонирование AIP1, нового белка, который связывается с геном, связанным с апоптозом ALG-2, в Ca2 + -зависимой реакции». J. Biol. Chem. 274 (3): 1533–40. Дои:10.1074 / jbc.274.3.1533. PMID  9880530.
• Тарабыкина С., Мёллер А.Л., Дюруссель И. и др. (2000). «Две формы апоптозного белка ALG-2 с разными аффинностями Ca (2+) и распознаванием мишеней». J. Biol. Chem. 275 (14): 10514–8. Дои:10.1074 / jbc.275.14.10514. PMID  10744743.
• Чен Б., Боринштейн С.К., Гиллис Дж. И др. (2000). «Связанный с глиомой белок SETA взаимодействует с AIP1 / Alix и ALG-2 и модулирует апоптоз в астроцитах». J. Biol. Chem. 275 (25): 19275–81. Дои:10.1074 / jbc.M908994199. PMID  10858458.
• Китаура Ю., Мацумото С., Сато Х. и др. (2001). «Пефлин и ALG-2, члены семейства белков penta-EF-hand, образуют гетеродимер, который диссоциирует Ca2 + -зависимым образом». J. Biol. Chem. 276 (17): 14053–8. Дои:10.1074 / jbc.M008649200. PMID  11278427.
• Судзуки Х., Фукуниси Ю., Кагава И. и др. (2001). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши». Genome Res. 11 (10): 1758–65. Дои:10.1101 / гр.180101. ЧВК  311163. PMID  11591653.
• Юнг Ю.С., Ким К.С., Ким К.Д. и др. (2001). «Ген 2, связанный с апоптозом, связывается с доменом гибели Fas и диссоциирует от Fas во время Fas-опосредованного апоптоза в клетках Jurkat». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 288 (2): 420–6. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5769. PMID  11606059.
• Китаура Ю., Сато Х., Такахаши Х. и др. (2002). «И ALG-2, и пефлин, белки пента-EF-руки (PEF), стабилизируются димеризацией через их пятые области EF-руки». Arch. Biochem. Биофизы. 399 (1): 12–8. Дои:10.1006 / abbi.2001.2736. PMID  11883899.
• Сато Х., Шибата Х., Накано Й. и др. (2002). «ALG-2 взаимодействует с аминоконцевым доменом аннексина XI Ca (2 +) - зависимым образом». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (5): 1166–72. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6600. PMID  11883939.
• Chatellard-Causse C, Blot B, Cristina N, et al. (2002). «Аликс (белок X, взаимодействующий с ALG-2), белок, участвующий в апоптозе, связывается с эндофилинами и индуцирует вакуолизацию цитоплазмы». J. Biol. Chem. 277 (32): 29108–15. Дои:10.1074 / jbc.M204019200. PMID  12034747.
• Хван И.С., Юнг Ю.С., Ким Э. (2002). «Взаимодействие ALG-2 с ASK1 влияет на локализацию ASK1 и последующую активацию JNK». FEBS Lett. 529 (2–3): 183–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03329-X. PMID  12372597. S2CID  9264865.
• Сато Х., Накано Й., Сибата Х., Маки М (2002). «Пента-EF-домен ALG-2 взаимодействует с аминоконцевыми доменами как аннексина VII, так и аннексина XI Са2 + -зависимым образом». Биохим. Биофиз. Acta. 1600 (1–2): 61–7. Дои:10.1016 / S1570-9639 (02) 00445-4. PMID  12445460.
• Кребс Дж, Саремаслани П., Кадафф Р. (2002). «ALG-2: белок-модулятор связывания Ca2 +, участвующий в пролиферации и гибели клеток». Биохим. Биофиз. Acta. 1600 (1–2): 68–73. Дои:10.1016 / S1570-9639 (02) 00446-6. PMID  12445461.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Томсиг Дж. Л., Снайдер С. Л., Creutz CE (2003). «Идентификация мишеней для передачи сигналов кальция через семейство белков копина. Характеристика спиралевидного копин-связывающего мотива». J. Biol. Chem. 278 (12): 10048–54. Дои:10.1074 / jbc.M212632200. PMID  12522145.
• Hansen C, Tarabykina S, la Cour JM и др. (2003). «Белки семейства PEF сорцин и гранкальцин взаимодействуют in vivo и in vitro». FEBS Lett. 545 (2–3): 151–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00518-0. PMID  12804766. S2CID  42572647.

}}

внешняя ссылка

• PDCD6 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• PDCD6 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.