PDE8A - PDE8A

PDE8A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3ECM, 3ECN
Идентификаторы
Псевдонимы	PDE8A, HsT19550, фосфодиэстераза 8A
Внешние идентификаторы	OMIM: 602972 MGI: 1277116 ГомолоГен: 1957 Генные карты: PDE8A
Номер ЕС	3.1.4.53
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q25.3 Начинать 84,980,440 бп[1] Конец 85,139,145 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 D3 Начинать 81,213,596 бп[2] Конец 81,334,533 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гидролазы сложного диэфира фосфорной кислоты • гидролазная активность • Активность 3 ', 5'-циклических нуклеотидов фосфодиэстеразы • связывание ионов металлов • Активность 3 ', 5'-циклического АМФ фосфодиэстеразы • связывание киназы • Активность 3 ', 5'-циклической-GMP фосфодиэстеразы Сотовый компонент • цитозоль • внеклеточная экзосома Биологический процесс • процесс метаболизма циклических нуклеотидов • катаболический процесс цАМФ • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • преобразование сигнала • положительная регуляция фосфорилирования белков • отрицательная регуляция гибели клеток • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • отрицательная регуляция гибели клеток, вызванной перекисью водорода • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5151	18584
Ансамбль	ENSG00000073417	ENSMUSG00000025584
UniProt	O60658	O88502
RefSeq (мРНК)	NM_001243137 NM_002605 NM_173454 NM_173455 NM_173456 NM_173457	NM_008803
RefSeq (белок)	NP_001230066 NP_002596 NP_775656	NP_032829
Расположение (UCSC)	Chr 15: 84.98 - 85.14 Мб	Chr 7: 81.21 - 81.33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Высокоаффинная цАМФ-специфическая и нечувствительная к IBMX 3 ', 5'-циклическая фосфодиэстераза 8A является фермент что у людей кодируется PDE8A ген.^[5][6] Работа Себастьяна Бола и др. показал, что 5 разных варианты расшифровки и их соответствующие изоформы находятся выразил в человеческом макрофаги, и предполагает, что этот белок может потребоваться ВИЧ-1 для своего репликация.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000073417 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025584 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фишер Д.А., Смит Д.Ф., Pillar JS, Сен-Дени С.Х., Ченг Дж.Б. (июль 1998 г.). «Выделение и характеристика PDE8A, новой цАМФ-специфической фосфодиэстеразы человека». Biochem Biophys Res Commun. 246 (3): 570–577. Дои:10.1006 / bbrc.1998.8684. PMID  9618252.
6. «Ген Entrez: PDE8A фосфодиэстераза 8A».
7. Бол С.М., Бойман Т., Банник Е.М., Мёрланд П.Д., ван Дорт К., Штраус Дж.Ф. III, Зиберер М., Шуйтемакер Х., Коотстра Н.А., ван 'т Ваут А.Б. «Полиморфизм фактора зависимости от ВИЧ-1 PDE8A влияет на уровень мРНК и репликацию ВИЧ-1 в первичных макрофагах». Вирусология. 420 (1): 32–42. Дои:10.1016 / j.virol.2011.08.013. PMID  21920574.

дальнейшее чтение

• Бас БЛ (2002). «Редактирование РНК аденозиндезаминазами, действующими на РНК». Анну. Преподобный Biochem. 71: 817–846. Дои:10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135501. ЧВК  1823043. PMID  12045112.
• Заули Г., Милани Д., Мирандола П. и др. (2001). «Белок Tat ВИЧ-1 подавляет экспрессию фактора транскрипции CREB в нейрональных клетках PC12 посредством пути фосфатидилинозитол-3-киназы / AKT / циклической нуклеозидфосфодиэстеразы». FASEB J. 15 (2): 483–491. Дои:10.1096 / fj.00-0354com. PMID  11156964.
• Главас Н.А., Остенсон С., Шефер Дж. Б. и др. (2001). «Активация Т-клеток активирует циклические нуклеотидные фосфодиэстеразы 8A1 и 7A3». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (11): 6319–6324. Дои:10.1073 / pnas.101131098. ЧВК  33466. PMID  11371644.
• Ван П., Ву П., Иган Р. В., Билла М. М. (2002). «Варианты сплайсинга человеческой фосфодиэстеразы 8A: клонирование, генная организация и распределение в тканях». Ген. 280 (1–2): 183–194. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00783-1. PMID  11738832.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Гаманума М., Юаса К., Сасаки Т. и др. (2003). «Сравнение ферментативной характеристики и генной организации семейства циклических нуклеотидов фосфодиэстеразы 8 у людей». Клетка. Сигнал. 15 (6): 565–574. Дои:10.1016 / S0898-6568 (02) 00146-8. PMID  12681444.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ву П, Ван П (2005). "Per-Arnt-Sim домен-зависимая ассоциация цАМФ-фосфодиэстеразы 8A1 с белками IkappaB". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (51): 17634–17639. Дои:10.1073 / pnas.0407649101. ЧВК  539753. PMID  15596729.