PDZD2 - PDZD2

PDZD2
Идентификаторы
ПсевдонимыPDZD2, AIPC, PAPIN, PDZK3, PIN1, домен PDZ, содержащий 2
Внешние идентификаторыOMIM: 610697 MGI: 1922394 ГомолоГен: 23393 Генные карты: PDZD2
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человек)[1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение PDZD2
Геномное расположение PDZD2
Группа5п13.3Начинать31,639,131 бп[1]
Конец32,110,932 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PDZD2 gnf1h07921 на fs.png

PBB GE PDZD2 gnf1h07922 s в формате fs.png

PBB GE PDZD2 209493 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015022
NM_178140

NM_001081064

RefSeq (белок)

NP_835260

н / д

Расположение (UCSC)Chr 5: 31.64 - 32.11 МбChr 15: 12.36 - 12.74 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

PDZ-домен-содержащий белок 2 это белок что у людей кодируется PDZD2 ген.[5][6]

Функция

Белки, содержащие PDZ домены было показано, что они часто связывают С-концы трансмембранных рецепторов или ионных каналов. Также было показано, что они связываются с другими белками домена PDZ и, возможно, участвуют во внутриклеточной передаче сигналов. Белок, кодируемый этим геном, содержит шесть доменов PDZ и имеет сходство последовательностей с проинтерлейкином-16 (про-ИЛ-16). Подобно про-ИЛ-16, кодируемый белок локализуется в эндоплазматическом ретикулуме и, как полагают, расщепляется каспазой с образованием секретируемого пептида, содержащего два домена PDZ. Кроме того, этот ген активируется в первичных опухолях простаты и может участвовать в ранних стадиях онкогенеза простаты.[6]

Взаимодействия

PDZD2 был показан взаимодействовать с ПКП4.[7][8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133401 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022197 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (сентябрь 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / днарес / 4.2.141. PMID  9205841.
  6. ^ а б «Ген Entrez: PDZD2 PDZ домен, содержащий 2».
  7. ^ Дегучи М., Иидзука Т., Хата Й, Нисимура В., Хирао К., Яо И., Кавабе Х., Такай Ю. (сентябрь 2000 г.). «ПАПИН. Новый множественный белок PSD-95 / Dlg-A / ZO-1, взаимодействующий с белком / дельта-катенином и p0071, связанным с нейральным плакофилином, связанным с повторением броненосца». J. Biol. Chem. 275 (38): 29875–80. Дои:10.1074 / jbc.M005384200. PMID  10896674.
  8. ^ Оно Х, Хирабаяси С., Иидзука Т., Охниши Х., Фудзита Т., Хата Й (октябрь 2002 г.). «Локализация белков, взаимодействующих с p0071, белка, взаимодействующего с белками броненосных повторов, связанных с плакофилином (PAPIN) и ERBIN, в эпителиальных клетках». Онкоген. 21 (46): 7042–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1205852. PMID  12370826.

дальнейшее чтение