ПДЗРН3 - PDZRN3

ПДЗРН3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1UHP, 1WH1
Идентификаторы
Псевдонимы	ПДЗРН3, LNX3, SEMACAP3, SEMCAP3, домен PDZ, содержащий безымянный палец 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 609729 MGI: 1933157 ГомолоГен: 10328 Генные карты: ПДЗРН3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п13 Начинать 73,382,431 бп[1] Конец 73,624,941 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 D3 Начинать 101,149,609 бп[2] Конец 101,377,897 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность Сотовый компонент • нервномышечное соединение • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • цитоплазма • соединение клеток • синапс Биологический процесс • развитие нервно-мышечного соединения • убиквитинирование белков Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23024	55983
Ансамбль	ENSG00000121440	ENSMUSG00000035357
UniProt	Q9UPQ7	Q69ZS0
RefSeq (мРНК)	NM_015009 NM_001303139 NM_001303140 NM_001303141 NM_001303142	NM_018884
RefSeq (белок)	NP_001290068 NP_001290069 NP_001290070 NP_001290071 NP_055824	NP_061372
Расположение (UCSC)	Chr 3: 73,38 - 73,62 Мб	Chr 6: 101,15 - 101,38 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

PDZ-домен, содержащий RING-finger белок 3 это белок что у людей кодируется ПДЗРН3 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000121440 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035357 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (октябрь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (3): 197–205. Дои:10.1093 / днарес / 6.3.197. PMID  10470851.
6. «Ген Entrez: PDZRN3 PDZ домен, содержащий RING finger 3».

дальнейшее чтение

• Бах I, Родригес-Эстебан С, Каррьер С и др. (1999). «RLIM ингибирует функциональную активность факторов транскрипции гомеодомена LIM посредством рекрутирования комплекса гистондеацетилазы». Nat. Genet. 22 (4): 394–9. Дои:10.1038/11970. PMID  10431247. S2CID  22326394.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Като М, Като М (2004). «Идентификация и характеристика генов PDZRN3 и PDZRN4 in silico». Int. J. Mol. Med. 13 (4): 607–13. Дои:10.3892 / ijmm.13.4.607. PMID  15010864.
• Хассель С., Эйхнер А., Якимович М. и др. (2004). «Белки, связанные с рецептором морфогенетического белка кости типа II (BMPR-II) и идентифицированные с помощью двумерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии». Протеомика. 4 (5): 1346–58. Дои:10.1002 / pmic.200300770. PMID  15188402. S2CID  6773754.
• Сантин А.Д., Жан Ф., Беллоне С. и др. (2004). «Профили экспрессии генов в первичных серозных папиллярных опухолях яичников и нормальном эпителии яичников: идентификация потенциальных молекулярных маркеров для диагностики и лечения рака яичников». Int. J. Рак. 112 (1): 14–25. Дои:10.1002 / ijc.20408. PMID  15305371. S2CID  29845339.
• Мейер Г., Варокё Ф., Ниб А. и др. (2005). «Сложность опосредованных PDZ-доменом взаимодействий в глутаматергических синапсах: тематическое исследование нейролигина». Нейрофармакология. 47 (5): 724–33. Дои:10.1016 / j.neuropharm.2004.06.023. PMID  15458844. S2CID  11771522.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.