PEX14 - PEX14

PEX14
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2W84, 2W85, 4BXU
Идентификаторы
Псевдонимы	PEX14, NAPP2, PBD13A, Pex14p, dJ734G22.2, фактор пероксисомального биогенеза 14
Внешние идентификаторы	OMIM: 601791 MGI: 1927868 ГомолоГен: 37936 Генные карты: PEX14
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.22 Начните 10,472,288 бп[1] Конец 10,630,758 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 E2 Начните 148,960,535 бп[2] Конец 149,099,876 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание с N-концом белка • связывание микротрубочек • GO: 0001948 связывание с белками • связывание бета-тубулина • рецепторное связывание Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • пероксисомальная мембрана • пероксисома • внутриклеточный • ядро клетки • фибриллярный центр • пероксисомальный импортомерный комплекс • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • пероксисомная организация • отрицательная регуляция гомотетрамеризации белков • транспорт пероксисом по микротрубочкам • отрицательная регуляция связывания белков • отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • закрепление микротрубочек • импорт белка в матрикс пероксисом • импорт белка в матрикс пероксисом, высвобождение субстрата • транспорт белка • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • гомоолигомеризация белков • импорт белка в матрикс пероксисом, транслокация • транспорт • белок нацелен на пероксисому • импорт белка в матрицу пероксисом, докинг • убиквитинирование белков • сборка макромолекулярного комплекса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5195	56273
Ансамбль	ENSG00000142655	ENSMUSG00000028975
UniProt	O75381	Q9R0A0
RefSeq (мРНК)	NM_004565	NM_019781
RefSeq (белок)	NP_004556	NP_062755
Расположение (UCSC)	Chr 1: 10.47 - 10.63 Мб	Chr 4: 148.96 - 149.1 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Консервативная область якорного белка пероксисомальной мембраны (Pex14p)
Идентификаторы
Символ	Pex14_N
Pfam	PF04695
ИнтерПро	IPR006785
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Белок пероксисомальной мембраны PEX14 это белок что у людей кодируется PEX14 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует важный компонент механизма импорта пероксисом. Белок интегрирован в мембраны пероксисом, его С-конец открыт для цитозоля, и он взаимодействует с цитозольным рецептором для белков, содержащих PTS1. пероксисомальный целевой сигнал. Белок также функционирует как корепрессор транскрипции и взаимодействует с гистондеацетилазой. Мутация в этом гене приводит к одной из форм Синдром Зеллвегера.^[6]

Взаимодействия

PEX14 был показан взаимодействовать с участием

• PEX5,^{[7][8][9][10]}
• PEX7,^[10] и
• PEX13.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142655 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028975 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Франсен М., Терлеки С. Р., Субрамани С. (июль 1998 г.). «Идентификация стыковочного белка рецептора PTS1 человека, необходимого для импорта пероксисомального белка». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (14): 8087–92. Дои:10.1073 / пнас.95.14.8087. ЧВК  20933. PMID  9653144.
6. «Ген Entrez: фактор пероксисомного биогенеза 14 PEX14».
7. Отера Х., Сетогучи К., Хамасаки М., Кумаширо Т., Симидзу Н., Фудзики Й. (март 2002 г.). «Рецептор пероксисомного нацеленного сигнала Pex5p взаимодействует с грузами и импортируемыми компонентами оборудования пространственно-временным дифференцированным образом: консервативные мотивы Pex5p WXXXF / Y имеют решающее значение для импорта матричного белка». Молекулярная и клеточная биология. 22 (6): 1639–55. Дои:10.1128 / MCB.22.6.1639-1655.2002. ЧВК  135613. PMID  11865044.
8. Окумото К., Абэ И., Фудзики Ю. (август 2000 г.). «Молекулярная анатомия пероксина Pex12p: домен безымянного пальца необходим для функции Pex12p и взаимодействует с рецептором Pex5p типа 1 нацеливания на пероксисомы и кольцевым пероксином Pex10p». Журнал биологической химии. 275 (33): 25700–10. Дои:10.1074 / jbc.M003303200. PMID  10837480.
9. Симидзу Н., Ито Р., Хироно Й., Отера Х., Гаеди К., Татейши К., Тамура С., Окумото К., Харано Т., Мукаи С., Фудзики Й. (апрель 1999 г.). «Клонирование кДНК пероксина Pex14p. Путем функциональной комплементации на мутантных клетках яичников китайского хомячка, характеристика и функциональный анализ». Журнал биологической химии. 274 (18): 12593–604. Дои:10.1074 / jbc.274.18.12593. PMID  10212238.
10. Managadze D, Würtz C, Sichting M, Niehaus G, Veenhuis M, Rottensteiner H (июнь 2007 г.). «Пероксин PEX14 Neurospora crassa необходим для биогенеза как глиоксисом, так и тел воронина» (PDF). Движение. 8 (6): 687–701. Дои:10.1111 / j.1600-0854.2007.00560.x. PMID  17461798.

дальнейшее чтение

• Альбертини М., Релинг П., Эрдманн Р., Гирзальский В., Киль Дж. А., Винхейс М., Кунау WH (апрель 1997 г.). «Pex14p, белок пероксисомальной мембраны, связывающий оба рецептора двух PTS-зависимых путей импорта» (PDF). Ячейка. 89 (1): 83–92. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80185-3. PMID  9094717.
• Хузе Б., Релинг П., Альбертини М., Бланк Л., Меллер К., Кунау WH (январь 1998 г.). «Pex17p из Saccharomyces cerevisiae - новый пероксин и компонент механизма транслокации пероксисомального белка». Журнал клеточной биологии. 140 (1): 49–60. Дои:10.1083 / jcb.140.1.49. ЧВК  2132588. PMID  9425153.
• Will GK, Soukupova M, Hong X, Erdmann KS, Kiel JA, Dodt G, Kunau WH, Erdmann R (март 1999 г.). «Идентификация и характеристика человеческого ортолога дрожжей Pex14p». Молекулярная и клеточная биология. 19 (3): 2265–77. Дои:10.1128 / mcb.19.3.2265. ЧВК  84019. PMID  10022913.
• Гирзальский В., Релинг П., Стейн К., Киппер Дж., Бланк Л., Кунау В.Х., Эрдманн Р. (март 1999 г.). «Участие Pex13p в локализации Pex14p и пероксисомный нацеленный сигнал 2-зависимого импорта белка в пероксисомы». Журнал клеточной биологии. 144 (6): 1151–62. Дои:10.1083 / jcb.144.6.1151. ЧВК  2150583. PMID  10087260.
• Симидзу Н., Ито Р., Хироно Й., Отера Х., Гаеди К., Татейши К., Тамура С., Окумото К., Харано Т., Мукаи С., Фудзики Ю. (апрель 1999 г.). «Клонирование кДНК пероксина Pex14p. Путем функциональной комплементации на мутантных клетках яичников китайского хомячка, характеристика и функциональный анализ». Журнал биологической химии. 274 (18): 12593–604. Дои:10.1074 / jbc.274.18.12593. PMID  10212238.
• Сакстедер К.А., Джонс Дж. М., Саут-СТ, Ли Х, Лю Y, Гулд С.Дж. (март 2000 г.). «PEX19 связывает несколько белков пероксисомальной мембраны, является преимущественно цитоплазматическим и требуется для синтеза пероксисомальной мембраны». Журнал клеточной биологии. 148 (5): 931–44. Дои:10.1083 / jcb.148.5.931. ЧВК  2174547. PMID  10704444.
• Гавва Н.Р., Вэнь С.К., Дафтари П., Монива М., Ян В.М., Ян-Фэн Л.П., Сето Э., Дэви-младший, Шен К.К. (март 2002 г.). «NAPP2, белок пероксисомальной мембраны, также является корепрессором транскрипции». Геномика. 79 (3): 423–31. Дои:10.1006 / geno.2002.6714. PMID  11863372.
• Отера Х., Сетогучи К., Хамасаки М., Кумаширо Т., Симидзу Н., Фудзики Й. (март 2002 г.). «Рецептор пероксисомного нацеленного сигнала Pex5p взаимодействует с грузами и импортируемыми компонентами оборудования пространственно-временным дифференцированным образом: консервативные мотивы Pex5p WXXXF / Y имеют решающее значение для импорта матричного белка». Молекулярная и клеточная биология. 22 (6): 1639–55. Дои:10.1128 / MCB.22.6.1639-1655.2002. ЧВК  135613. PMID  11865044.
• Алланд Л., Дэвид Дж., Шен-Ли Х, Потес Дж., Мюле Р., Ли ХК, Хоу Х, Чен К., ДеПиньо Р. А. (апрель 2002 г.). «Идентификация Sds3 млекопитающих как неотъемлемого компонента корепрессорного комплекса Sin3 / гистондеацетилазы». Молекулярная и клеточная биология. 22 (8): 2743–50. Дои:10.1128 / MCB.22.8.2743-2750.2002. ЧВК  133736. PMID  11909966.
• Fransen M, Brees C, Ghys K, Amery L, Mannaerts GP, Ladant D, Van Veldhoven PP (март 2002 г.). «Анализ пероксиновых взаимодействий млекопитающих с использованием не основанного на транскрипции бактериального двухгибридного анализа». Молекулярная и клеточная протеомика. 1 (3): 243–52. Дои:10.1074 / mcp.M100025-MCP200. PMID  12096124.
• Oliveira ME, Reguenga C, Gouveia AM, Guimarães CP, Schliebs W., Kunau WH, Silva MT, Sá-Miranda C, Azevedo JE (декабрь 2002 г.). «Pex14p млекопитающих: топология мембраны и характеристика взаимодействия Pex14p-Pex14p». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны. 1567 (1–2): 13–22. Дои:10.1016 / с0005-2736 (02) 00635-1. PMID  12488033.
• Fransen M, Vastiau I, Brees C., Brys V, Mannaerts GP, Van Veldhoven PP (март 2004 г.). «Возможная роль Pex19p в сборке стыковочных комплексов PTS-рецептора». Журнал биологической химии. 279 (13): 12615–24. Дои:10.1074 / jbc.M304941200. PMID  14715663.
• Симозава Н., Цукамото Т., Нагасе Т., Такемото Ю., Кояма Н., Сузуки Ю., Комори М., Осуми Т., Жаннетт Г., Вандерс Р.Дж., Кондо Н. (июнь 2004 г.). «Идентификация новой группы комплементации нарушений биогенеза пероксисом и PEX14 как мутированного гена». Человеческая мутация. 23 (6): 552–8. Дои:10.1002 / humu.20032. PMID  15146459.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г.) ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Нгуен Т., Бьоркман Дж., Патон Б.К., Крейн Д.И. (февраль 2006 г.). «Неспособность опосредованного микротрубочками деления пероксисом и торговля нарушениями со сниженным изобилием пероксисом». Журнал клеточной науки. 119 (Pt 4): 636–45. Дои:10.1242 / jcs.02776. PMID  16449325.

внешние ссылки

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о нарушениях биогенеза пероксисом, спектре синдрома Зеллвегера
• Записи OMIM о нарушениях биогенеза пероксисом, спектре синдрома Зеллвегера
• Ресурс Eukaryotic Linear Motif класс мотива TRG_PEX_1
• Ресурс Eukaryotic Linear Motif класс мотива TRG_PEX_2
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: O75381 (Белок пероксисомальной мембраны PEX14) на PDBe-KB.