PLSCR1 - PLSCR1 - Wikipedia

PLSCR1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Y2A
Идентификаторы
Псевдонимы	PLSCR1, MMTRA1B, фосфолипидная скрамблаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 604170 MGI: 893575 ГомолоГен: 41418 Генные карты: PLSCR1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q24 Начинать 146,515,180 бп[1] Конец 146,544,856 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 E3.3 Начинать 92,249,750 бп[2] Конец 92,272,278 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность фосфолипидной скрамблазы • Связывание ДНК • связывание ионов кальция • Связывание с рецептором CD4 • Привязка домена SH3 • связывание рецептора эпидермального фактора роста • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • цитозоль • аппарат Гольджи • мембрана • внеклеточный матрикс • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • ядрышко • мембранный плот • внеклеточная экзосома • ядро клетки • цитоплазма • перинуклеарная область цитоплазмы • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • процесс биосинтеза фосфатидилсерина • регуляция активации тучных клеток • скремблирование фосфолипидов • положительная регуляция активности ДНК-топоизомеразы (АТФ-гидролизирующая) • ответ на интерферон-бета • регуляция стимулирующего сигнального пути, опосредованного рецептором Fc • активация тромбоцитов • отрицательная регуляция репликации вирусного генома • положительная регуляция экспрессии генов • защитный ответ на вирус • острофазовый ответ • положительная регуляция врожденного иммунного ответа • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • апоптотический процесс • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5359	22038
Ансамбль	ENSG00000188313	ENSMUSG00000032369
UniProt	O15162	Q9JJ00
RefSeq (мРНК)	NM_021105 NM_001363872 NM_001363874	NM_011636
RefSeq (белок)	NP_066928 NP_001350801 NP_001350803	NP_035766
Расположение (UCSC)	Chr 3: 146,52 - 146,54 Мб	Chr 9: 92,25 - 92,27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фосфолипид скрамблаза 1 является фермент что у людей кодируется PLSCR1 ген.^[5][6]

Взаимодействия

PLSCR1 показал взаимодействовать с:

• CPSF6,^[7]
• Рецептор эпидермального фактора роста,^[8]
• NEU4,^[7]
• SHC1,^[8][9]
• SLPI,^[10] и
• TFG.^[7]

Смотрите также

• Scramblase

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000188313 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032369 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжоу К., Чжао Дж., Стаут Дж. Г., Лум Р. А., Видмер Т., Симс П. Дж. (Август 1997 г.). «Молекулярное клонирование фосфолипидной скрамблазы плазматической мембраны человека. Белок, опосредующий трансбислойное перемещение фосфолипидов плазматической мембраны». J Biol Chem. 272 (29): 18240–4. Дои:10.1074 / jbc.272.29.18240. PMID  9218461.
6. «Ген Entrez: фосфолипидная скрамблаза 1 PLSCR1».
7. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
8. Сан Дж., Нанджундан М., Пайк Л. Дж., Видмер Т., Симс П. Дж. (Май 2002 г.). «Фосфолипидная скрамблаза 1 плазматической мембраны обогащена липидными рафтами и взаимодействует с рецептором эпидермального фактора роста». Биохимия. 41 (20): 6338–45. Дои:10.1021 / bi025610l. PMID  12009895.
9. Nanjundan M, Sun J, Zhao J, Zhou Q, Sims PJ, Wiedmer T. (сентябрь 2003 г.). «Фосфолипидная скрамблаза 1 плазматической мембраны способствует EGF-зависимой активации c-Src через рецептор эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem. 278 (39): 37413–8. Дои:10.1074 / jbc.M306182200. PMID  12871937.
10. Цзэн ЦК, Цзэн Ц.П. (июнь 2000 г.). «Идентификация нового секреторного белка, связывающего ингибитор протеазы лейкоцитов, участвующего в движении мембранных фосфолипидов». FEBS Lett. 475 (3): 232–6. Дои:10.1016 / s0014-5793 (00) 01700-2. PMID  10869562. S2CID  35688498.

дальнейшее чтение

• Бассе Ф, Стаут Дж. Г., Симс П. Дж., Видмер Т. (1996). «Выделение мембранного белка эритроцита, который опосредует Ca2 + -зависимое трансбислойное перемещение фосфолипида». J. Biol. Chem. 271 (29): 17205–10. Дои:10.1074 / jbc.271.29.17205. PMID  8663431.
• Чжоу К., Симс П.Дж., Видмер Т. (1998). «Идентичность консервативного мотива в фосфолипидной скрамблазе, который необходим для Ca2 + -ускоренного трансбислойного движения мембранных фосфолипидов». Биохимия. 37 (8): 2356–60. Дои:10.1021 / bi972625o. PMID  9485382.
• Чжао Дж., Чжоу К., Видмер Т., Симс П.Дж. (1998). «Пальмитоилирование фосфолипидной скрамблазы необходимо для нормальной функции по стимулированию Ca2 + -активированного трансбислойного движения мембранных фосфолипидов». Биохимия. 37 (18): 6361–6. Дои:10.1021 / bi980218m. PMID  9572851.
• Касукабе Т, Кобаяси Х, Канеко Й, Окабе-Кадо Дж, Хонма Й (1998). «Идентичность человеческого нормального аналога (MmTRA1b) продукта гена, ассоциированного с лейкемогенезом (MmTRA1a) мыши, в качестве фосфолипидной скрамблазы плазматической мембраны и картирование хромосом гена MmTRA1b / фосфолипидной скрамблазы человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 249 (2): 449–55. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9190. PMID  9712717.
• Чжоу К., Чжао Дж., Аль-Зогайби Ф., Чжоу А., Видмер Т., Сильверман Р. Х., Симс П. Дж. (2000). «Транскрипционный контроль гена фосфолипидной скрамблазы 1 плазматической мембраны человека опосредуется интерфероном-альфа». Кровь. 95 (8): 2593–9. Дои:10.1182 / кровь.V95.8.2593. PMID  10753839.
• Frasch SC, Henson PM, Kailey JM, Richter DA, Janes MS, Fadok VA, Bratton DL (2000). «Регулирование активности фосфолипидной скрамблазы во время апоптоза и активации клеток протеинкиназой Cdelta». J. Biol. Chem. 275 (30): 23065–73. Дои:10.1074 / jbc.M003116200. PMID  10770950.
• Цзэн CC, Цзэн CP (2000). «Идентификация нового секреторного белка, связывающего ингибитор протеазы лейкоцитов, участвующего в движении мембранных фосфолипидов». FEBS Lett. 475 (3): 232–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01700-2. PMID  10869562. S2CID  35688498.
• Wiedmer T, Zhou Q, Kwoh DY, Sims PJ (2000). «Идентификация трех новых членов семейства генов фосфолипид скрамблазы». Биохим. Биофиз. Acta. 1467 (1): 244–53. Дои:10.1016 / S0005-2736 (00) 00236-4. PMID  10930526.
• Сунь Дж., Чжао Дж., Шварц М.А., Ван Дж.Й., Видмер Т., Симс П.Дж. (2001). «c-Abl тирозинкиназа связывает и фосфорилирует фосфолипид скрамблазу 1». J. Biol. Chem. 276 (31): 28984–90. Дои:10.1074 / jbc.M102505200. PMID  11390389.
• Сильверман Р.Х., Халлум А., Чжоу А., Донг Б., Аль-Зогайби Ф., Кушнер Д., Чжоу К., Чжао Дж., Видмер Т., Симс П.Дж. (2002). «Подавление роста клеток карциномы яичников in vivo с помощью интерферон-индуцируемого белка плазматической мембраны, фосфолипидной скрамблазы 1». Рак Res. 62 (2): 397–402. PMID  11809687.
• Сан Дж., Нанджундан М., Пайк Л. Дж., Видмер Т., Симс П. Дж. (2002). «Фосфолипидная скрамблаза 1 плазматической мембраны обогащена липидными рафтами и взаимодействует с рецептором эпидермального фактора роста». Биохимия. 41 (20): 6338–45. Дои:10.1021 / bi025610l. PMID  12009895.
• Чжоу К., Чжао Дж., Видмер Т., Симс П.Дж. (2002). «Нормальный гемостаз, но дефектный гемопоэтический ответ на факторы роста у мышей с дефицитом фосфолипидной скрамблазы 1». Кровь. 99 (11): 4030–8. Дои:10.1182 / кровь-2001-12-0271. PMID  12010804.
• Сюй YC, Wu RF, Gu Y, Yang YS, Yang MC, Nwariaku FE, Terada LS (2002). «Участие TRAF4 в окислительной активации N-концевой киназы c-Jun». J. Biol. Chem. 277 (31): 28051–7. Дои:10.1074 / jbc.M202665200. PMID  12023963.
• Накамаки Т., Окабе-Кадо Дж., Ямамото-Ямагути Ю., Хино Ки, Томоясу С., Хонма Й, Касукабе Т. (2002). «Роль экспрессии гена MmTRA1b / фосфолипидной скрамблазы1 в индукции дифференцировки клеток миелоидного лейкоза человека в гранулоциты». Exp. Гематол. 30 (5): 421–9. Дои:10.1016 / S0301-472X (02) 00779-8. PMID  12031648.
• Wiedmer T, Zhao J, Nanjundan M, Sims PJ (2003). «Пальмитоилирование фосфолипидной скрамблазы 1 контролирует ее распределение между ядром и плазматической мембраной». Биохимия. 42 (5): 1227–33. Дои:10.1021 / bi026679w. PMID  12564925.
• Каметака С., Шибата М., Морое К., Канамори С., Осава Й., Вагури С., Симс П.Дж., Эмото К., Умеда М., Учияма Ю. (2003). «Идентификация фосфолипидной скрамблазы 1 как новой молекулы, взаимодействующей с бета-секретазой (фермент, расщепляющий бета-сайт белка-предшественника амилоида (АРР) (ВАСЕ))». J. Biol. Chem. 278 (17): 15239–45. Дои:10.1074 / jbc.M208611200. PMID  12586838.
• Рами А., Симс Дж., Ботез Дж., Винклер Дж. (2003). «Пространственное разрешение фосфолипидной скрамблазы 1 (PLSCR1), активация каспазы-3 и фрагментация ДНК в гиппокампе человека после церебральной ишемии». Neurochem. Int. 43 (1): 79–87. Дои:10.1016 / S0197-0186 (02) 00194-8. PMID  12605885. S2CID  44845123.
• Nanjundan M, Sun J, Zhao J, Zhou Q, Sims PJ, Wiedmer T (2003). «Фосфолипидная скрамблаза 1 плазматической мембраны способствует EGF-зависимой активации c-Src через рецептор эпидермального фактора роста». J. Biol. Chem. 278 (39): 37413–8. Дои:10.1074 / jbc.M306182200. PMID  12871937.