PLXNB2 - PLXNB2

PLXNB2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4E71
Идентификаторы
Псевдонимы	PLXNB2, MM1, Nbla00445, PLEXB2, dJ402G11.3, плексин B2
Внешние идентификаторы	OMIM: 604293 MGI: 2154239 ГомолоГен: 66630 Генные карты: PLXNB2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.33 Начните 50,274,979 бп[1] Конец 50,307,646 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 E3 | 15 44,68 см Начните 89,155,549 бп[2] Конец 89,180,788 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность рецептора семафорина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • поверхность клетки • внеклеточная экзосома • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • рецепторный комплекс семафорина Биологический процесс • регуляция фосфорилирования белков • отрицательная регуляция клеточной адгезии • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • положительная регуляция аксоногенеза • развитие многоклеточного организма • закрытие нервной трубки • развитие мозга • регулировка формы клеток • пролиферация нейробластов • регуляция миграции нейронов • семафорин-плексиновый сигнальный путь • преобразование сигнала • положительная регуляция развития проекции нейронов • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • регулирование миграции клеток • сигнальный путь семафорин-плексин, участвующий в ведении аксонов • сборка возбуждающих синапсов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23654	140570
Ансамбль	ENSG00000196576	ENSMUSG00000036606
UniProt	O15031	B2RXS4
RefSeq (мРНК)	NM_012401	NM_001159521 NM_001284506 NM_138749
RefSeq (белок)	NP_036533 NP_001363793 NP_001363794 NP_001363795 NP_001363796 NP_001363797 NP_001363798 NP_001363799 NP_001363800 NP_001363801 NP_001363802 NP_001363803 NP_001363804 NP_001363805 NP_001363806 NP_001363807 NP_001363808 NP_001363809 NP_001363810 NP_001363811 NP_001363812 NP_001363813 NP_001363814 NP_001363815	NP_001152993 NP_001271435 NP_620088
Расположение (UCSC)	Chr 22: 50.27 - 50.31 Мб	Chr 15: 89.16 - 89.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Плексин-В2 это белок что у людей кодируется PLXNB2 ген.^[5][6][7]

Функция

Члены класса плексинов B, такие как PLXNB2, являются трансмембранными рецепторами, которые участвуют в наведении аксонов и миграции клеток в ответ на семафорины (Perrot et al. (2002)) [предоставлено OMIM]^[7]

Взаимодействия

PLXNB2 был показан взаимодействовать с ARHGEF11.^[6][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196576 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036606 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tamagnone L, Artigiani S, Chen H, He Z, Ming GI, Song H, Chedotal A, Winberg ML, Goodman CS, Poo M, Tessier-Lavigne M, Comoglio PM (октябрь 1999 г.). «Плексины представляют собой большое семейство рецепторов трансмембранных, секретируемых и GPI-закрепленных семафоринов у позвоночных». Клетка. 99 (1): 71–80. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID  10520995.
6. Перро В., Васкес-Прадо Дж., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho через факторы обмена гуаниновых нуклеотидов, связанные с лейкемией, Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF». J Biol Chem. 277 (45): 43115–20. Дои:10.1074 / jbc.M206005200. PMID  12183458.
7. "Entrez Gene: PLXNB2 плексин B2".
8. Swiercz JM, Kuner R, Behrens J, Offermanns S (июль 2002 г.). «Plexin-B1 напрямую взаимодействует с PDZ-RhoGEF / LARG, чтобы регулировать RhoA и морфологию конуса роста». Нейрон. 35 (1): 51–63. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00750-X. PMID  12123608.

дальнейшее чтение

• Шиноура Н., Шамрадж О.И., Хугенхольц Х., Чжу Дж.Г., МакБлэк П., Варник Р., Тью Дж.Дж., Вани М.А., Менон А.Г. (1995). «Идентификация и частичная последовательность кДНК, которая дифференциально экспрессируется в опухолях головного мозга человека». Рак Lett. 89 (2): 215–21. Дои:10.1016 / 0304-3835 (95) 03690-Х. PMID  7889532.
• Трофаттер Дж. А., Лонг К. Р., Муррелл Дж. Р., Стотлер С. Дж., Гуселла Дж. Ф., Баклер А. Дж. (1996). "Независимый от экспрессии каталог генов из хромосомы 22 человека". Genome Res. 5 (3): 214–24. Дои:10.1101 / гр. 5.3.214. PMID  8593609.
• Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / днарес / 4.2.141. PMID  9205841.
• Данхэм I, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Artigiani S, Barberis D, Fazzari P, Longati P, Angelini P, van de Loo JW, Comoglio PM, Tamagnone L (2003). «Функциональная регуляция рецепторов семафорина пропротеинконвертазами». J. Biol. Chem. 278 (12): 10094–101. Дои:10.1074 / jbc.M210156200. PMID  12533544.
• Ойнума И., Като Х, Харада А, Негиси М. (2003). «Прямое взаимодействие Rnd1 с Plexin-B1 регулирует PDZ-RhoGEF-опосредованную активацию Rho с помощью Plexin-B1 и индуцирует сокращение клеток в клетках COS-7». J. Biol. Chem. 278 (28): 25671–7. Дои:10.1074 / jbc.M303047200. PMID  12730235.
• Бранденбергер Р., Вей Х, Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (2005). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197.
• Conrotto P, Corso S, Gamberini S, Comoglio PM, Giordano S (2004). «Взаимодействие между рецепторами фактора рассеяния и B-плексинами контролирует инвазивный рост». Онкоген. 23 (30): 5131–7. Дои:10.1038 / sj.onc.1207650. PMID  15184888.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т., Хаяси К., Сузуки Ю., Ямамото Дж., Вакамацу А., Кимура К., Сакамото К., Хатано Н., Кавай Ю., Исии С., Сайто К., Кодзима С., Сугияма Т., Оно Т., Окано К. , Йошикава Ю., Аотсука С., Сасаки Н., Хаттори А., Окумура К., Нагаи К., Сугано С., Исогай Т. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.