PLXND1 - PLXND1

PLXND1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3H6N
Идентификаторы
Псевдонимы	PLXND1, PLEXD1, плексин D1
Внешние идентификаторы	OMIM: 604282 MGI: 2154244 ГомолоГен: 22866 Генные карты: PLXND1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q22.1 Начинать 129,555,175 бп[1] Конец 129,606,818 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 E3 Начинать 115,954,811 бп[2] Конец 115,995,005 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • специфическое связывание белкового домена • GO: 0001948 связывание с белками • активность рецептора семафорина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • ламеллиподиум • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • пластинчатая мембрана • проекция клетки • рецепторный комплекс семафорина Биологический процесс • развитие сердечной перегородки • морфогенез тракта оттока • регуляция ангиогенеза • развитие коронарной сосудистой сети • развитие многоклеточного организма • развитие аорты • ангиогенез • дихотомическое подразделение терминальных единиц, участвующих в ветвлении слюнных желез • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов • сборка синапсов • положительное регулирование связывания белков • миграция эндотелиальных клеток • семафорин-плексиновый сигнальный путь • преобразование сигнала • отрицательная регуляция клеточной адгезии • регулировка формы клеток • регулирование миграции клеток • положительная регуляция аксоногенеза • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • позитивная регуляция транскрипции мишени рецептора Notch • сигнальный путь семафорин-плексин, участвующий в ведении аксонов Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23129	67784
Ансамбль	ENSG00000004399	ENSMUSG00000030123
UniProt	Q9Y4D7	Q3UH93
RefSeq (мРНК)	NM_015103	NM_026376
RefSeq (белок)	NP_055918	NP_080652
Расположение (UCSC)	Chr 3: 129,56 - 129,61 Мб	Chr 6: 115.95 - 116 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Плексин-Д1 это белок что у людей кодируется PLXND1 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000004399 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030123 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. ван дер Цвааг Б., Хеллемонс А. Дж., Лендерс В. П., Бурбах Дж. П., Бруннер Г. Г., Падберг Г. В., Ван Боховен Н. (ноябрь 2002 г.). «ПЛЕКСИН-D1, новый член семейства плексинов, экспрессируется в эндотелии сосудов и центральной нервной системе во время эмбриогенеза мыши». Дев Дин. 225 (3): 336–43. Дои:10.1002 / dvdy.10159. PMID  12412018. S2CID  36110289.
6. "Entrez Gene: PLXND1 плексин D1".

дальнейшее чтение

• Исикава К., Нагасе Т., Суяма М. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
• Tamagnone L, Artigiani S, Chen H и др. (1999). «Плексины представляют собой большое семейство рецепторов трансмембранных, секретируемых и GPI-закрепленных семафоринов у позвоночных». Клетка. 99 (1): 71–80. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80063-X. PMID  10520995. S2CID  17386412.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (2003). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Genome Res. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Гитлер А.Д., Лу М.М., Эпштейн Дж. А. (2004). «PlexinD1 и передача сигналов семафорина необходимы в эндотелиальных клетках для развития сердечно-сосудистой системы». Dev. Клетка. 7 (1): 107–16. Дои:10.1016 / j.devcel.2004.06.002. PMID  15239958.
• ван дер Цвааг Б., Верзейл Х. Т., Вичерс К. Х. и др. (2004). «Анализ последовательности гена PLEXIN-D1 у пациентов с синдромом Мебиуса». Педиатр. Neurol. 31 (2): 114–8. Дои:10.1016 / j.pediatrneurol.2004.02.004. PMID  15301830.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии». J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. Дои:10.1021 / pr0502065. ЧВК  1850943. PMID  16335952.