POLDIP2 - POLDIP2

POLDIP2
Идентификаторы
Псевдонимы	POLDIP2, PDIP38, POLD4, p38, дельта-взаимодействующий белок 2 с полимеразой (ДНК), дельта-взаимодействующий белок 2 с ДНК-полимеразой
Внешние идентификаторы	OMIM: 611519 MGI: 1915061 ГомолоГен: 9201 Генные карты: POLDIP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.2 Начинать 28,346,633 бп[1] Конец 28,357,527 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B5 Начинать 78,512,193 бп[2] Конец 78,522,736 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • митохондриальный нуклеоид • митохондрия • ядро клетки Биологический процесс • морфогенез митохондрий • отрицательная регуляция макроаутофагии • положительная регуляция митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	26073	67811
Ансамбль	ENSG00000004142	ENSMUSG00000001100
UniProt	Q9Y2S7	Q91VA6
RefSeq (мРНК)	NM_015584 NM_001290145	NM_026389
RefSeq (белок)	NP_001277074 NP_056399	NP_080665
Расположение (UCSC)	Chr 17: 28.35 - 28.36 Мб	Chr 11: 78,51 - 78,52 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Полимеразный дельта-взаимодействующий белок 2 также известен как Полимеразный дельта-взаимодействующий белок 38 кДа (PDIP38) кодируется POLDIP2 ген в людях ^[5][6].

Этот ген кодирует белок, который взаимодействует с субъединицей ДНК-полимеразы дельта p50. Кодируемый белок также взаимодействует с ядерным антигеном пролиферирующих клеток. Некоторые транскрипты этого гена перекрываются в ориентации хвост к хвосту с геном фактора некроза опухоли, альфа-индуцированным белком 1 (TNFAIP1). ^[6]. POLDIP2 / PDIP38 - это подрабатывающий белок, который был идентифицирован в обоих ядрах ^[7] и митохондрия ^[8][9]

Взаимодействия

Было показано, что в ядре POLDIP2 взаимодействовать с PCNA ^[5], в то время как в митохондрии POLDIP2, как было показано, взаимодействует с белками, составляющими нуклеоид митохондриальной ДНК ^[10] и AAA + протеаза CLPXP ^[9][11] где он модулирует как специфичность, так и стабильность этой протеолитической машины.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000004142 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001100 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лю Л., Родригес-Бельмонте Э.М., Мазлум Н., Се Б., Ли М.Ю. (март 2003 г.). «Идентификация нового белка PDIP38, который взаимодействует с субъединицей p50 дельта ДНК-полимеразы и ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Журнал биологической химии. 278 (12): 10041–7. Дои:10.1074 / jbc.M208694200. PMID  12522211.
6. «Ген Entrez: полимераза POLDIP2 (ДНК-направленная), дельта-взаимодействующий белок 2».
7. Wong A, Zhang S, Mordue D, Wu JM, Zhang Z, Darzynkiewicz Z и др. (Октябрь 2013). «PDIP38 перемещается в сплайсосомы / ядерные спеклы в ответ на УФ-индуцированное повреждение ДНК и требуется для УФ-индуцированного альтернативного сплайсинга MDM2». Клеточный цикл. 12 (19): 3184–93. Дои:10.4161 / cc.26221. ЧВК  3865014. PMID  23989611.
8. Се Б., Ли Х, Ван Ц., Се С., Рахме А., Дай В., Ли М.И. (июнь 2005 г.). «Дальнейшая характеристика белка, взаимодействующего с дельта-дельта ДНК-полимеразой человека 38». Журнал биологической химии. 280 (23): 22375–84. Дои:10.1074 / jbc.M414597200. PMID  15811854.
9. Strack PR, Brodie EJ, Zhan H, Schuenemann VJ, Valente LJ, Saiyed T. и др. (Ноябрь 2020 г.). «Полимеразный дельта-взаимодействующий белок 38 (PDIP38) модулирует стабильность и активность митохондриальной AAA + протеазы CLPXP». Биология коммуникации. 3 (1): 646. Дои:10.1038 / с42003-020-01358-6. ЧВК  7647994. PMID  33159171.
10. Cheng X, Kanki T, Fukuoh A, Ohgaki K, Takeya R, Aoki Y и др. (Декабрь 2005 г.). «PDIP38 связывается с белками, составляющими нуклеоид митохондриальной ДНК». Журнал биохимии. 138 (6): 673–8. Дои:10.1093 / jb / mvi169. PMID  16428295.
11. Паредес Ф., Шелдон К., Лассег Б., Уильямс Х.С., Фейдли Э.А., Бенавидес Г.А. и др. (Февраль 2018). «Poldip2 - это чувствительный к кислороду белок, который контролирует липоилирование и активацию PDH и αKGDH для поддержки метаболической адаптации при гипоксии и раке». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 115 (8): 1789–1794. Дои:10.1073 / pnas.1720693115. ЧВК  5828627. PMID  29434038.

дальнейшее чтение

• Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ и др. (Октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO отчеты. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A и др. (Октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Се Б., Ли Х, Ван Цюй, Се С., Рахме А., Дай В., Ли М.И. (июнь 2005 г.). «Дальнейшая характеристика белка, взаимодействующего с дельта-дельта-ДНК ДНК человека 38». Журнал биологической химии. 280 (23): 22375–84. Дои:10.1074 / jbc.M414597200. PMID  15811854.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H и др. (Сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, et al. (Январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Klaile E, Müller MM, Kannicht C, Otto W., Singer BB, Reutter W. и др. (Сентябрь 2007 г.). «Рецептор клеточной адгезии карциноэмбриональной антиген-связанной клеточной адгезии молекула 1 регулирует ядерно-цитоплазматический перенос дельта-взаимодействующего белка ДНК-полимеразы 38». Журнал биологической химии. 282 (36): 26629–40. Дои:10.1074 / jbc.M701807200. PMID  17623671.