POLR2K - POLR2K

POLR2K
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5FLM, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Идентификаторы
Псевдонимы	POLR2K, ABC10-альфа, RPABC4, RPB10alpha, RPB12, RPB7.0, hRPB7.0, hsRPB10a, субъединица K полимеразы (РНК) II, субъединица K РНК-полимеразы II, РНК-полимераза II, субъединица I и III K
Внешние идентификаторы	OMIM: 606033 MGI: 102725 ГомолоГен: 86049 Генные карты: POLR2K
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q22.2 Начинать 100,150,623 бп[1] Конец 100,154,003 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 B3.1 Начинать 36,174,010 бп[2] Конец 36,177,010 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание ионов цинка • Активность РНК-полимеразы II • связывание ионов металлов • Активность РНК-полимеразы III • ДНК-направленная активность 5'-3 'РНК-полимеразы • Активность РНК-полимеразы I Сотовый компонент • цитозоль • нуклеоплазма • ДНК-направленный комплекс РНК-полимеразы I • ДНК-направленный комплекс РНК-полимеразы III • ДНК-направленная РНК-полимераза II, основной комплекс • ядро клетки Биологический процесс • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Кеппинг мРНК 7-метилгуанозина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы III • транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов • Метаболический процесс РНК • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • транскрипция, ДНК-шаблон • удлинение транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • положительное регулирование выработки интерферона I типа • поддержание популяции соматических стволовых клеток • положительная регуляция вирусной транскрипции Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5440	17749
Ансамбль	ENSG00000147669	ENSMUSG00000045996
UniProt	P53803	Q63871
RefSeq (мРНК)	NM_005034	NM_001039368 NM_023127
RefSeq (белок)	NP_005025	NP_001034457 NP_075616
Расположение (UCSC)	Chr 8: 100.15 - 100.15 Мб	Chr 15: 36.17 - 36.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-направленные РНК-полимеразы I, II и III субъединицы RPABC4 это белок что у людей кодируется POLR2K ген.

Этот ген кодирует одну из мельчайших субъединиц РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез информационной РНК у эукариот. Эта субъединица является общей для двух других ДНК-направленных РНК-полимераз.^[5]

Взаимодействия

POLR2K был показан взаимодействовать с POLR2C.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000147669 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045996 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: полипептид K полимеразы (РНК) II (ДНК-направленный) POLR2K, 7,0 кДа».
6. Акер Дж., Де Грааф М., Чейнел И., Хазак В., Кединджер С., Виньерон М. (июль 1997 г.). «Взаимодействие между субъединицами РНК-полимеразы II человека». Журнал биологической химии. 272 (27): 16815–21. Дои:10.1074 / jbc.272.27.16815. PMID  9201987.

дальнейшее чтение

• Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». Журнал биомедицинских наук. 5 (1): 24–7. Дои:10.1007 / BF02253352. PMID  9570510.
• Янкулов К., Бентли Д. (июнь 1998 г.). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции». Текущая биология. 8 (13): R447-9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID  9651670. S2CID  15480646.
• Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж., Микели П., Халили К., Джордано А. (декабрь 1999 г.). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». Журнал клеточной биохимии. 75 (3): 357–68. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID  10536359.
• Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (март 2001 г.). «Множественные способы регуляции транскрипции трансактиватором HIV-1 Tat». IUBMB Life. 51 (3): 175–81. Дои:10.1080/152165401753544241. PMID  11547919. S2CID  10931640.
• Хоу К.Дж. (сентябрь 2002 г.). «РНК-полимераза II выполняет симфонию процессов обработки пре-мРНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1577 (2): 308–24. Дои:10.1016 / s0167-4781 (02) 00460-8. PMID  12213660.
• Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (Сентябрь 2006 г.). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства». Обзоры медицинских исследований. 26 (5): 595–625. Дои:10.1002 / med.20081. ЧВК  7168390. PMID  16838299.
• Харрич Д., Макмиллан Н., Муньос Л., Аполлони А., Мередит Л. (декабрь 2006 г.). «Приведут ли разнообразные взаимодействия Tat к новым мишеням для антиретровирусных препаратов?». Текущие цели в отношении лекарств. 7 (12): 1595–606. Дои:10.2174/138945006779025338. PMID  17168834.
• Джанг К.Л., Коллинз М.К., Лачман Д.С. (1992). «Белок tat вируса иммунодефицита человека увеличивает транскрипцию повторяющихся последовательностей Alu человека за счет увеличения активности клеточного фактора транскрипции TFIIIC». Журнал синдромов приобретенного иммунодефицита. 5 (11): 1142–7. PMID  1403646.
• Като Х., Сумимото Х., Погнонек П., Чен СН, Розен К.А., Рёдер Р.Г. (апрель 1992 г.). «ВИЧ-1 Tat действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточного удлинения». Гены и развитие. 6 (4): 655–66. Дои:10.1101 / gad.6.4.655. PMID  1559613.
• Саутгейт С., Зэпп М.Л., Грин М.Р. (июнь 1990 г.). «Активация транскрипции с помощью белка Tat ВИЧ-1, связанного с формирующейся РНК через другой белок». Природа. 345 (6276): 640–2. Bibcode:1990Натура.345..640С. Дои:10.1038 / 345640a0. PMID  2190099. S2CID  4233742.
• Ву-Бэр Ф., Сигман Д., Гейнор РБ (август 1995 г.). «Специфическое связывание РНК-полимеразы II с РНК трансактивирующей области вируса иммунодефицита человека регулируется клеточными кофакторами и Tat». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (16): 7153–7. Bibcode:1995PNAS ... 92.7153W. Дои:10.1073 / пнас.92.16.7153. ЧВК  41297. PMID  7638159.
• Шпаковский Г.В., Акер Дж., Винцерит М., Лакруа Дж. Ф., Тюрио П., Виньерон М. (сентябрь 1995 г.). «Четыре субъединицы, которые являются общими для трех классов РНК-полимераз, функционально взаимозаменяемы между Homo sapiens и Saccharomyces cerevisiae». Молекулярная и клеточная биология. 15 (9): 4702–10. Дои:10.1128 / mcb.15.9.4702. ЧВК  230713. PMID  7651387.
• Herrmann CH, Rice AP (март 1995 г.). «Белки Tat лентивируса специфически связываются с клеточной протеинкиназой TAK, которая гиперфосфорилирует карбоксиконцевой домен большой субъединицы РНК-полимеразы II: кандидат в кофактор Tat». Журнал вирусологии. 69 (3): 1612–20. Дои:10.1128 / JVI.69.3.1612-1620.1995. ЧВК  188757. PMID  7853496.
• Кин Нью-Джерси, Гейт М.Дж., Карн Дж. (Март 1996 г.). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 Tat является неотъемлемым компонентом активированного комплекса транскрипции-элонгации». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (6): 2505–10. Bibcode:1996PNAS ... 93.2505K. Дои:10.1073 / пнас.93.6.2505. ЧВК  39827. PMID  8637904.
• Ян X, Herrmann CH, Rice AP (июль 1996 г.). «Белки Tat вируса иммунодефицита человека специфически связываются с TAK in vivo и требуют для функционирования карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II». Журнал вирусологии. 70 (7): 4576–84. Дои:10.1128 / JVI.70.7.4576-4584.1996. ЧВК  190394. PMID  8676484.
• Agostini I, Navarro JM, Rey F, Bouhamdan M, Spire B, Vigne R, Sire J (сентябрь 1996 г.). «Трансактиватор Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1: взаимодействие с активаторными доменами, связанными с промотором, и связывание с TFIIB». Журнал молекулярной биологии. 261 (5): 599–606. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0485. PMID  8800208.
• Чжоу Кью, Шарп, Пенсильвания (октябрь 1996 г.). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. Дои:10.1126 / science.274.5287.605. PMID  8849451. S2CID  13266489.
• Окамото Х., Шелин С.Т., Корден Д.Л., Джонс К.А., Петерлин Б.М. (октябрь 1996 г.). «Для трансактивации белка Tat вируса иммунодефицита человека требуется С-концевой домен РНК-полимеразы II». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (21): 11575–9. Bibcode:1996PNAS ... 9311575O. Дои:10.1073 / пнас.93.21.11575. ЧВК  38099. PMID  8876177.
• Чун РФ, Чжан К.Т. (ноябрь 1996 г.). «Требования к карбоксиконцевому домену РНК-полимеразы II для активированной транскрипции ретровирусов человека, лимфотропного вируса I Т-клеток человека и ВИЧ-1». Журнал биологической химии. 271 (44): 27888–94. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27888. PMID  8910388.
• Parada CA, Roeder RG (ноябрь 1996 г.). «Повышенная процессивность РНК-полимеразы II, вызванная Tat-индуцированным фосфорилированием ее карбоксиконцевого домена». Природа. 384 (6607): 375–8. Bibcode:1996Натура.384..375P. Дои:10.1038 / 384375a0. PMID  8934526. S2CID  4278432.