POLR3C - POLR3C

POLR3C
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2XUB, 2XV4, 5AFQ
Идентификаторы
Псевдонимы	POLR3C, RPC3, RPC62, субъединица C полимеразы (РНК) III, субъединица C РНК-полимеразы III, C82
Внешние идентификаторы	OMIM: 617454 MGI: 1921664 ГомолоГен: 38185 Генные карты: POLR3C
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.1 Начинать 145,824,088 бп[1] Конец 145,844,402 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.1 Начинать 96,711,490 бп[2] Конец 96,727,628 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • ДНК-направленная активность 5'-3 'РНК-полимеразы • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Активность РНК-полимеразы III • связывание одноцепочечной ДНК Сотовый компонент • ДНК-направленный комплекс РНК-полимеразы III • цитозоль • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • положительное регулирование выработки интерферона-бета • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы III • защитный ответ на вирус • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция врожденного иммунного ответа • иммунная система • врожденная иммунная система • транскрипция с промотора РНК-полимеразы III • положительное регулирование выработки интерферона I типа Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10623	74414
Ансамбль	ENSG00000186141	ENSMUSG00000028099
UniProt	Q9BUI4	Q9D483
RefSeq (мРНК)	NM_001303456 NM_006468	NM_028925
RefSeq (белок)	NP_001290385 NP_006459	NP_083201
Расположение (UCSC)	Chr 1: 145,82 - 145,84 Мб	Chr 3: 96.71 - 96.73 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-направленная субъединица РНК-полимеразы III RPC3 является фермент что у людей кодируется POLR3C ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

POLR3C был показан взаимодействовать с GTF3C4.^[8][9]

Связанные генные проблемы

• Синдром TAR^[10]
• Синдром делеции 1q21.1
• Синдром дупликации 1q21.1

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186141 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028099 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ван З., Рёдер Р.Г. (май 1997 г.). «Три субъединицы, специфичные для РНК-полимеразы III человека, образуют субкомплекс с селективной функцией в специфической инициации транскрипции». Гены и развитие. 11 (10): 1315–26. Дои:10.1101 / gad.11.10.1315. PMID  9171375.
6. Ху П, Ву С., Сунь Й., Юань СС, Кобаяши Р., Майерс МП, Эрнандес Н. (ноябрь 2002 г.). «Характеристика человеческой РНК-полимеразы III позволяет определить ортологи субъединиц РНК-полимеразы III Saccharomyces cerevisiae» (PDF). Молекулярная и клеточная биология. 22 (22): 8044–55. Дои:10.1128 / MCB.22.22.8044-8055.2002. ЧВК  134740. PMID  12391170.
7. "Ген Entrez: полипептид C полимеразы (РНК) III (ДНК-направленный) POLR3C (ДНК-направленный) (62 кДа)".
8. Се Й.Дж., Ван З., Ковельман Р., Рёдер Р.Г. (июль 1999 г.). «Клонирование и характеристика двух эволюционно консервативных субъединиц (TFIIIC102 и TFIIIC63) человеческого TFIIIC и их участие в функциональных взаимодействиях с TFIIIB и РНК-полимеразой III». Молекулярная и клеточная биология. 19 (7): 4944–52. Дои:10.1128 / mcb.19.7.4944. ЧВК  84305. PMID  10373544.
9. Се Й.Дж., Кунду Т.К., Ван З., Ковельман Р., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Субъединица TFIIIC90 TFIIIC взаимодействует с множеством компонентов механизма РНК-полимеразы III и обладает гистон-специфической ацетилтрансферазной активностью». Молекулярная и клеточная биология. 19 (11): 7697–704. Дои:10.1128 / mcb.19.11.7697. ЧВК  84812. PMID  10523658.
10. Klopocki E, Schulze H, Strauss G, Ott CE, Hall J, Trotier F, et al. (Февраль 2007 г.). «Сложный образец наследования, напоминающий аутосомно-рецессивное наследование, включающее микроделецию при синдроме тромбоцитопении-отсутствующей лучевой кости». Американский журнал генетики человека. 80 (2): 232–40. Дои:10.1086/510919. ЧВК  1785342. PMID  17236129.

дальнейшее чтение

• Джанг К.Л., Коллинз М.К., Лачман Д.С. (1992). «Белок tat вируса иммунодефицита человека увеличивает транскрипцию повторяющихся последовательностей Alu человека за счет увеличения активности клеточного фактора транскрипции TFIIIC». Журнал синдромов приобретенного иммунодефицита. 5 (11): 1142–7. PMID  1403646.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Се Й.Дж., Ван З., Ковельман Р., Рёдер Р.Г. (июль 1999 г.). «Клонирование и характеристика двух эволюционно консервативных субъединиц (TFIIIC102 и TFIIIC63) человеческого TFIIIC и их участие в функциональных взаимодействиях с TFIIIB и РНК-полимеразой III». Молекулярная и клеточная биология. 19 (7): 4944–52. Дои:10.1128 / mcb.19.7.4944. ЧВК  84305. PMID  10373544.
• Се Й.Дж., Кунду Т.К., Ван З., Ковельман Р., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Субъединица TFIIIC90 TFIIIC взаимодействует с множеством компонентов механизма РНК-полимеразы III и обладает гистон-специфической ацетилтрансферазной активностью». Молекулярная и клеточная биология. 19 (11): 7697–704. Дои:10.1128 / mcb.19.11.7697. ЧВК  84812. PMID  10523658.
• Кувана М., Кимура К., Каваками И. (октябрь 2002 г.). «Идентификация иммунодоминантного эпитопа на РНК-полимеразе III, распознаваемой сыворотками системного склероза: применение для иммуноферментного анализа». Артрит и ревматизм. 46 (10): 2742–7. Дои:10.1002 / арт.10521. PMID  12384934.