PPFIBP1 - PPFIBP1

PPFIBP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3ТАД
Идентификаторы
Псевдонимы	PPFIBP1, L2, SGT2, hSGT2, hSgt2p, PPFIA-связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603141 MGI: 1914783 ГомолоГен: 2685 Генные карты: PPFIBP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12п11.23-п11.22 Начинать 27,523,431 бп[1] Конец 27,695,564 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 G3 Начинать 146,888,487 бп[2] Конец 147,032,025 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание кадгерина Сотовый компонент • клеточная мембрана • очаговая адгезия • цитозоль Биологический процесс • клеточная адгезия Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8496	67533
Ансамбль	ENSG00000110841	ENSMUSG00000016487
UniProt	Q86W92	Q8C8U0
RefSeq (мРНК)	NM_001198915 NM_001198916 NM_003622 NM_177444	NM_001170433 NM_026221 NM_001355728 NM_001355729
RefSeq (белок)	NP_001185844 NP_001185845 NP_003613 NP_803193	NP_001163904 NP_080497 NP_001342657 NP_001342658
Расположение (UCSC)	Chr 12: 27,52 - 27,7 Мб	Chr 6: 146,89 - 147,03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Липрин-бета-1 это белок что у людей кодируется PPFIBP1 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков (липрин), взаимодействующих с тирозинфосфатазой LAR. Липрины взаимодействуют с членами семейства LAR трансмембранных протеинтирозинфосфатаз, которые, как известно, важны для управления аксонами и развития молочных желез. Было высказано предположение, что липрины представляют собой поливалентные белки, которые образуют сложные структуры и действуют как каркасы для рекрутирования и закрепления семейства LAR тирозинфосфатаз. Было обнаружено, что этот белок взаимодействует с S100A4, кальций-связывающим белком, связанным с инвазивностью опухоли и метастазированием. Эксперимент in vitro продемонстрировал, что взаимодействие ингибирует фосфорилирование этого белка протеинкиназой C и протеинкиназой CK2. Сообщалось об альтернативно сплайсированных вариантах транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[7]

Взаимодействия

PPFIBP1 показал себя взаимодействовать с липрин-альфа-1.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000110841 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016487 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Serra-Pages C, Medley QG, ​​Tang M, Hart A, Streuli M (июль 1998 г.). «Липрины, семейство белков, взаимодействующих с трансмембранной протеин-тирозинфосфатазой LAR». J Biol Chem. 273 (25): 15611–20. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID  9624153.
6. Кряевская М., Фишер-Ларсен М., Мёрц Э., Ворм О., Тульчинский Э., Григорян М., Амбарцумян Н., Луканидин Э. (февраль 2002 г.). «Липрин бета 1, член семейства LAR-трансмембранных белков, взаимодействующих с тирозинфосфатазой, является новой мишенью для белка S100A4, связанного с метастазами (Mts1)». J Biol Chem. 277 (7): 5229–35. Дои:10.1074 / jbc.M110976200. PMID  11836260.
7. «Ген Entrez: белок PPFIBP1, взаимодействующий с PTPRF, связывающий белок 1 (липрин бета 1)».

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (5): 337–45. Дои:10.1093 / днарес / 6.5.337. PMID  10574462.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. CiteSeerX  10.1.1.323.5263. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Бензингер А., Мустер Н., Кох HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, обычно подавляемого при раке». Мол. Клетка. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.