PPIH - PPIH

PPIH
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1MZW, 1QOI
Идентификаторы
Псевдонимы	PPIH, CYP-20, CYPH, SnuCyp-20, USA-CYP, пептидилпролилизомераза H
Внешние идентификаторы	OMIM: 606095 MGI: 106499 ГомолоГен: 38172 Генные карты: PPIH
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п34.2 Начинать 42,658,423 бп[1] Конец 42,676,758 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 D2.1 | 4 55,34 см Начинать 119,300,010 бп[2] Конец 119,320,546 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рибонуклеопротеинового комплекса • изомеразная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность пептидил-пролил цис-транс-изомеразы • связывание циклоспорина А • развернутое связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • ядерное пятнышко • Три-snRNP комплекс U4 / U6 x U5 • сплайсосомальный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • U4 / U6 snRNP Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • положительная регуляция репликации вирусного генома • сворачивание белка • Сплайсинг РНК • сборка макромолекулярного комплекса • изомеризация пептидил-пролила белков • ангиогенез • рефолдинг белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10465	66101
Ансамбль	ENSG00000171960	ENSMUSG00000060288
UniProt	O43447	Q9D868
RefSeq (мРНК)	NM_006347 NM_001330510	NM_001110129 NM_001110130 NM_028677
RefSeq (белок)	NP_001317439 NP_006338	NP_001103599 NP_001103600 NP_082953
Расположение (UCSC)	Chr 1: 42.66 - 42.68 Мб	Chr 4: 119.3 - 119.32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Пептидил-пролил цис-транс-изомераза H является фермент что у людей кодируется PPIH ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства пептидил-пролил-цис-транс-изомераз (PPIase). PPIases катализируют цис-транс-изомеризацию имидных пептидных связей пролина в олигопептидах и ускоряют сворачивание белков. Этот белок является специфическим компонентом комплекса, который включает факторы процессинга пре-мРНК PRPF3, PRPF4 и PRPF18, а также три-snRNP U4 / U5 / U6. Было показано, что этот белок обладает активностью PPIase и может действовать как белковый шаперон, который опосредует взаимодействия между различными белками внутри сплайсосомы.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171960 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060288 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (декабрь 1997 г.). «Новый циклофилин и человеческие гомологи дрожжевого Prp3 и Prp4 образуют комплекс, связанный с snRNP U4 / U6». РНК. 3 (12): 1374–87. ЧВК  1369579. PMID  9404889.
6. Тейгелькамп С., Ахсель Т., Мундт С., Готель С.Ф., Кроншаген У., Лейн В.С., Марахиэль М., Лурманн Р. (май 1998 г.). «Белок 20 кДа три-мяРНП U4 / U6.U5 человека представляет собой новый циклофилин, который образует комплекс с U4 / U6-специфическими белками 60 кД и 90 кДа». РНК. 4 (2): 127–41. ЧВК  1369602. PMID  9570313.
7. «Ген Entrez: PPIH пептидилпролилизомераза H (циклофилин H)».

дальнейшее чтение

• Рейдт У., Рейтер К., Ахсел Т. и др. (2000). «Кристаллическая структура человеческого U4 / U6 малого ядерного рибонуклеопротеина, специфичного к частице SnuCyp-20, ядерного циклофилина» (PDF). J. Biol. Chem. 275 (11): 7439–42. Дои:10.1074 / jbc.275.11.7439. PMID  10713041.
• Горовиц Д.С., Ли Э.Дж., Мабон С.А., Мистели Т. (2002). «Циклофилин участвует в сплайсинге пре-мРНК». EMBO J. 21 (3): 470–80. Дои:10.1093 / emboj / 21.3.470. ЧВК  125845. PMID  11823439.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Reidt U, Wahl MC, Fasshauer D, et al. (2003). «Кристаллическая структура комплекса между сплайсосомальным циклофилином H человека и пептидом snRNP-60K U4 / U6». J. Mol. Биол. 331 (1): 45–56. Дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00684-3. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-F238-B. PMID  12875835.
• Ingelfinger D, Göthel SF, Marahiel MA, et al. (2004). «Два сайта белок-белкового взаимодействия на человеческом циклофилине CypH, ассоциированном со сплайсосомами». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (16): 4791–6. Дои:10.1093 / нар / гкг660. ЧВК  169899. PMID  12907720.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.