PPIL2 - PPIL2

PPIL2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ZKC
Идентификаторы
Псевдонимы	PPIL2, CYC4, CYP60, Cyp-60, UBOX7, hCyP-60, пептидилпролилизомераза, подобная 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607588 MGI: 2447857 ГомолоГен: 8643 Генные карты: PPIL2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q11.21 Начинать 21,666,009 бп[1] Конец 21,700,015 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 A3 Начинать 17,086,555 бп[2] Конец 17,111,257 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность убиквитин-убиквитинлигазы • GO: 0001948 связывание с белками • изомеразная активность • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность • активность пептидил-пролил цис-транс-изомеразы • связывание циклоспорина А Сотовый компонент • цитоплазма • Просвет Гольджи • клеточная мембрана • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • полиубиквитинирование белков • локализация белка на плазматической мембране • сворачивание белка • убиквитинирование белков • миграция лейкоцитов • изомеризация пептидил-пролила белков Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23759	66053
Ансамбль	ENSG00000100023	ENSMUSG00000022771
UniProt	Q13356	Q9D787
RefSeq (мРНК)	NM_014337 NM_148175 NM_148176 NM_001317996	NM_001252444 NM_001252445 NM_144954 NM_001356386
RefSeq (белок)	NP_001304925 NP_055152 NP_680480 NP_680481	NP_001239373 NP_001239374 NP_659203 NP_001343315
Расположение (UCSC)	Chr 22: 21.67 - 21.7 Мб	Chr 16: 17.09 - 17.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Пептидил-пролил цис-транс-изомеразоподобный 2 является фермент что у людей кодируется PPIL2 ген.^[5][6]

Этот ген является членом циклофилин семейство пептидилпролилизомераз. Циклофилины представляют собой высококонсервативное повсеместное семейство, члены которого играют важную роль в сворачивание белка, иммуносупрессия к циклоспорин А, и заражение ВИЧ-1 вирионы. Этот белок взаимодействует с ингибитор протеиназы eglin c и локализуется в ядре. Множественные варианты транскрипции, кодирующие разные изоформы были обнаружены для этого гена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100023 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022771 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бизли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен К.П. и др. (Декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
6. «Ген Entrez: пептидилпролилизомераза (циклофилин) 2 PPIL2».

дальнейшее чтение

• Ван BB, Хайенга KJ, Паян Д.Г., Фишер JM (1996). «Идентификация ядерно-специфического циклофилина, который взаимодействует с ингибитором протеиназы эглином с». Biochem. J. 314 (1): 313–9. ЧВК  1217042. PMID  8660300.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геном Биол. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Пушкарский Т., Юрченко В., Ванпуй С. и др. (2005). «Экспрессия CD147 / EMMPRIN на клеточной поверхности регулируется циклофилином 60». J. Biol. Chem. 280 (30): 27866–71. Дои:10.1074 / jbc.M503770200. PMID  15946952.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Дэвис Т.Л., Уокер-младший, Кампанья-Слейтер V и др. (2010). «Структурная и биохимическая характеристика семейства пептидил-пролилизомераз циклофилина человека». PLoS Biol. 8 (7): e1000439. Дои:10.1371 / journal.pbio.1000439. ЧВК  2911226. PMID  20676357.