PPP1R13L - PPP1R13L

PPP1R13L
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2ВГЭ
Идентификаторы
Псевдонимы	PPP1R13L, IASPP, NKIP1, RAI, RAI4, регуляторная субъединица 13 протеинфосфатазы 1, подобная
Внешние идентификаторы	OMIM: 607463 MGI: 3525053 ГомолоГен: 84635 Генные карты: PPP1R13L
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.32 Начните 45,379,638 бп[1] Конец 45,406,349 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 A3 | 7 9,62 см Начните 19,359,749 бп[2] Конец 19,378,533 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • идентичное связывание с белками • связывание кадгерина Сотовый компонент • соединение клеток • ядро клетки • межклеточный мостик • нуклеоплазма • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • эмбриональное развитие глазного типа • цикл волос • развитие желудочковой сердечной мышцы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез правого желудочка сердца • постэмбриональное развитие • гомеостаз многоклеточного организма • сокращение сердечной мышцы • положительное регулирование дифференцировки клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • рост многоклеточного организма • апоптотический процесс • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10848	333654
Ансамбль	ENSG00000104881	ENSMUSG00000040734
UniProt	Q8WUF5	Q5I1X5
RefSeq (мРНК)	NM_006663 NM_001142502	NM_001010836
RefSeq (белок)	NP_001135974 NP_006654	NP_001010836
Расположение (UCSC)	Chr 19: 45.38 - 45.41 Мб	Chr 7: 19.36 - 19.38 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

RelA-ассоциированный ингибитор это белок что у людей кодируется PPP1R13L ген.^[5][6]

Взаимодействия

PPP1R13L показал себя взаимодействовать с участием Фактор транскрипции Sp1^[7] и РЕЛА.^[5][7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104881 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040734 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ян Дж. П., Хори М., Санда Т., Окамото Т. (май 1999 г.). «Идентификация нового ингибитора ядерного фактора-каппаВ, RelA-ассоциированного ингибитора». Журнал биологической химии. 274 (22): 15662–70. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15662. PMID  10336463.
6. «Ген Entrez: протеинфосфатаза 1 PPP1R13L, регуляторная (ингибиторная) субъединица 13 подобна».
7. Такада Н., Санда Т., Окамото Х., Ян Дж. П., Асамицу К., Сарол Л., Кимура Г., Ураниши Х., Тецука Т., Окамото Т. (август 2002 г.). «RelA-ассоциированный ингибитор блокирует транскрипцию вируса иммунодефицита человека типа 1, подавляя действия NF-kappaB и Sp1». Журнал вирусологии. 76 (16): 8019–30. Дои:10.1128 / JVI.76.16.8019-8030.2002. ЧВК  155123. PMID  12134007.

дальнейшее чтение

• Лю ZJ, Lu X, Zhong S (сентябрь 2005 г.). «ASPP - апоптотический регулятор p53». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Обзоры на рак. 1756 (1): 77–80. Дои:10.1016 / j.bbcan.2005.08.002. PMID  16139958.
• Такада Н., Санда Т., Окамото Х., Ян Дж. П., Асамицу К., Сарол Л., Кимура Г., Ураниши Х., Тецука Т., Окамото Т. (август 2002 г.). «RelA-ассоциированный ингибитор блокирует транскрипцию вируса иммунодефицита человека типа 1, подавляя действия NF-kappaB и Sp1». Журнал вирусологии. 76 (16): 8019–30. Дои:10.1128 / JVI.76.16.8019-8030.2002. ЧВК  155123. PMID  12134007.
• Bergamaschi D, Samuels Y, O'Neil NJ, Trigiante G, Crook T, Hsieh JK, O'Connor DJ, Zhong S, Campargue I, Tomlinson ML, Kuwabara PE, Lu X (февраль 2003 г.). «Онкопротеин iASPP является ключевым ингибитором p53, сохраняющимся от червя до человека». Природа Генетика. 33 (2): 162–7. Дои:10,1038 / ng1070. PMID  12524540. S2CID  22841392.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Slee EA, Gillotin S, Bergamaschi D, Royer C, Llanos S, Ali S, Jin B, Trigiante G, Lu X (декабрь 2004 г.). «N-конец новой изоформы человеческого iASPP необходим для ее цитоплазматической локализации». Онкоген. 23 (56): 9007–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1208088. PMID  15489900.
• Исаева Н., Бозко П., Энге М., Протопопова М., Верхоеф Л.Г., Масуччи М., Праманик А., Селиванова Г. (декабрь 2004 г.). «Небольшая молекула RITA связывается с p53, блокирует взаимодействие p53-HDM-2 и активирует функцию p53 в опухолях». Природа Медицина. 10 (12): 1321–8. Дои:10,1038 / нм 1146. PMID  15558054. S2CID  82043.
• Чжан X, Ван М., Чжоу С., Чен С., Ван Дж. (Февраль 2005 г.). «Экспрессия iASPP при острых лейкозах». Исследование лейкемии. 29 (2): 179–83. Дои:10.1016 / j.leukres.2004.07.001. PMID  15607367.
• Ласка MJ, Nexø BA, Vistisen K, Poulsen HE, Loft S, Vogel U (июль 2005 г.). «Полиморфизмы в RAI и в генах эксцизионной репарации нуклеотидов и оснований не связаны с риском рака яичек». Письма о раке. 225 (2): 245–51. Дои:10.1016 / j.canlet.2005.03.021. PMID  15885892.
• Skjelbred CF, Saebø M, Nexø BA, Wallin H, Hansteen IL, Vogel U, Kure EH (июль 2006 г.). «Влияние полиморфизма ERCC1, ASE-1 и RAI на риск колоректальной карциномы и аденомы: исследование случай-контроль». BMC Рак. 6: 175. Дои:10.1186/1471-2407-6-175. ЧВК  1533843. PMID  16817948.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Бергамаски Д., Сэмюэлс И., Салливан А., Звелебил М., Брейссенс Х, Биссо А., Дель Сал Дж., Сайед Н., Смит П., Гаско М., Крук Т., Лу X (октябрь 2006 г.). «iASPP предпочтительно связывает богатую пролином область р53 и модулирует апоптотическую функцию кодона 72-полиморфного р53». Природа Генетика. 38 (10): 1133–41. Дои:10,1038 / ng1879. PMID  16964264. S2CID  27662568.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Чжан Х, Дяо С., Рао Ц., Син Х, Лю Х, Ляо Х, Ван М., Ван Дж (май 2007 г.). «Идентификация новой изоформы iASPP и ее взаимодействие с p53». Журнал молекулярной биологии. 368 (4): 1162–71. Дои:10.1016 / j.jmb.2007.03.001. PMID  17391696.
• Ласка MJ, Strandbygård D, Kjeldgaard A, Mains M, Corydon TJ, Memon AA, Sørensen BS, Vogel U, Jensen UB, Nexø BA (июль 2007 г.). «Экспрессия гена RAI способствует апоптозу: исследования индукции и интерференции». Экспериментальные исследования клеток. 313 (12): 2611–21. Дои:10.1016 / j.yexcr.2007.05.006. PMID  17570360.