PPP1R15A - PPP1R15A

PPP1R15A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4XPN
Идентификаторы
Псевдонимы	PPP1R15A, GADD34, регуляторная субъединица протеинфосфатазы 1 15A
Внешние идентификаторы	OMIM: 611048 MGI: 1927072 ГомолоГен: 8639 Генные карты: PPP1R15A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.33 Начните 48,872,421 бп[1] Конец 48,876,058 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B3 Начните 45,522,916 бп[2] Конец 45,526,268 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • связывание протеинфосфатазы 1 • активность активатора протеинфосфатазы • активность регулятора протеинфосфатазы Сотовый компонент • аппарат Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • митохондриальная наружная мембрана • комплекс протеинфосфатазы 1 типа • эндоплазматический ретикулум • митохондрия • цитозоль • цитоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция дефосфорилирования белков • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • положительная регуляция дефосфорилирования eIF2 альфа, вызванного стрессом эндоплазматического ретикулума • положительная регуляция инициации трансляции в ответ на стресс • положительная регуляция активности фосфопротеинфосфатазы • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на стресс эндоплазматического ретикулума • остановка клеточного цикла • отрицательная регуляция активности фосфопротеинфосфатазы • локализация белка в эндоплазматическом ретикулуме • регуляция инициации трансляции дефосфорилированием eIF2 альфа • отрицательная регуляция PERK-опосредованного ответа развернутого белка • регулирование перевода • апоптотический процесс • реакция на стресс эндоплазматического ретикулума • положительная регуляция дефосфорилирования пептидил-серина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23645	17872
Ансамбль	ENSG00000087074	ENSMUSG00000040435
UniProt	O75807	P17564
RefSeq (мРНК)	NM_014330	NM_008654
RefSeq (белок)	NP_055145	NP_032680
Расположение (UCSC)	Chr 19: 48,87 - 48,88 Мб	Chr 7: 45,52 - 45,53 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Регуляторная субъединица протеинфосфатазы 1 15А также известен как задержка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD34 это белок что у людей кодируется PPP1R15A ген.^[5][6][7]

Ген Gadd34 / MyD116 был первоначально обнаружен как член набора генов млекопитающих gadd и MyD, кодирующих кислотные белки, которые синергетически подавляют рост клеток.^[8] Позже он был охарактеризован как ген, играющий роль в ER вызванная стрессом гибель клеток, являющихся целью ATF4 который играет роль в ER-опосредованной гибели клеток через промотирование белка дефосфорилирование из eIF2 α и обратное ингибирование трансляции.^[9]

Функция

Этот ген является членом группы генов, уровни транскриптов которых повышаются после стрессовых условий остановки роста и лечения агентами, повреждающими ДНК. Индукция этого гена ионизирующим излучением происходит в определенных клеточных линиях независимо от p53 статус, и его белковая реакция коррелирует с апоптозом после ионизирующего излучения.^[7]

Взаимодействия

PPP1R15A показал себя взаимодействовать с участием:

• BAG1^[10]
• LYN,^[11]
• MLL,^[12]
• PPP1CA,^[10][13][14]
• PPP1CB,^[13][14]
• PPP1CC,^[13][14]
• SMARCB1,^[12][13] и
• ТСН.^[15]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000087074 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040435 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Холландер М.С., Чжан К., Бэ И., Форнас А.Дж. мл. (Июль 1997 г.). «GADD34 млекопитающих, ген, индуцируемый апоптозом и повреждением ДНК». J Biol Chem. 272 (21): 13731–7. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13731. PMID  9153226.
6. Корабёвска М., Бетке Х., Келлнер С., Стахура Дж., Шауэр А. (январь 1998 г.). «Дифференциальная экспрессия остановки роста, генов повреждения ДНК и гена супрессора опухолей р53 в невусах и злокачественных меланомах». Противораковый Res. 17 (5A): 3697–700. PMID  9413226.
7. «Ген Entrez: протеинфосфатаза 1 PPP1R15A, регуляторная (ингибиторная) субъединица 15A».
8. Жан К., Лорд К.А., Аламо И., Холландер М.С., Карриер Ф., Рон Д., Кон К.В., Хоффман Б., Либерманн Д.А., Форнас А.Дж. (апрель 1994 г.). «Гены gadd и MyD определяют новый набор генов млекопитающих, кодирующих кислые белки, которые синергетически подавляют рост клеток». Мол. Cell. Биол. 14 (4): 2361–71. Дои:10.1128 / mcb.14.4.2361. ЧВК  358603. PMID  8139541.
9. Сано Р., Рид Дж. С. (июль 2013 г.). "Механизмы гибели клеток, вызванной стрессом ER". Биохим. Биофиз. Acta. 1833 (12): 3460–70. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2013.06.028. ЧВК  3834229. PMID  23850759.
10. Хунг В.Дж., Роберсон Р.С., Тафт Дж., Ву Д.Й. (2003). «Белки BAG-1 человека связываются с белком клеточной реакции на стресс GADD34 и мешают функциям GADD34». Мол. Cell. Биол. 23 (10): 3477–86. Дои:10.1128 / MCB.23.10.3477-3486.2003. ЧВК  164759. PMID  12724406.
11. Гришин А.В., Ажипа О., Семенов И., Кори С.Дж. (2001). «Взаимодействие между белком 34, вызывающим остановку роста ДНК, и киназой Lyn Src негативно регулирует генотоксический апоптоз». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (18): 10172–7. Bibcode:2001PNAS ... 9810172G. Дои:10.1073 / пнас.191130798. ЧВК  56934. PMID  11517336.
12. Адлер Х.Т., Чинери Р., Ву Д.Й., Куссик С.Дж., Пейн Дж.М., Форнас А.Дж., Ткачук, округ Колумбия (1999). «Лейкемические слитые белки HRX ингибируют апоптоз, индуцированный GADD34, и связываются с белками GADD34 и hSNF5 / INI1». Мол. Cell. Биол. 19 (10): 7050–60. Дои:10.1128 / mcb.19.10.7050. ЧВК  84700. PMID  10490642.
13. Ву Д.Ю., Ткачук, округ Колумбия, Роберсон Р.С., Шубах WH (2002). «Белок SNF5 / INI1 человека способствует функции остановки роста и белка, индуцируемого повреждением ДНК (GADD34), и модулирует активность GADD34-связанной протеинфосфатазы-1». J. Biol. Chem. 277 (31): 27706–15. Дои:10.1074 / jbc.M200955200. PMID  12016208.
14. Коннор Дж. Х., Вейзер Д. К., Ли С., Халленбек Дж. М., Шеноликар С. (2001). «Остановка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD34 собирает новый сигнальный комплекс, содержащий протеинфосфатазу 1 и ингибитор 1». Мол. Cell. Биол. 21 (20): 6841–50. Дои:10.1128 / MCB.21.20.6841-6850.2001. ЧВК  99861. PMID  11564868.
15. Хасегава Т., Исобе К. (1999). «Доказательства взаимодействия между Translin и GADD34 в клетках млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta. 1428 (2–3): 161–8. Дои:10.1016 / с0304-4165 (99) 00060-4. PMID  10434033.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хасегава Т., Исобе К. (1999). «Доказательства взаимодействия между Translin и GADD34 в клетках млекопитающих». Биохим. Биофиз. Acta. 1428 (2–3): 161–8. Дои:10.1016 / с0304-4165 (99) 00060-4. PMID  10434033.
• Адлер Х.Т., Чинери Р., Ву Д.Й. и др. (2000). «Лейкемические слитые белки HRX ингибируют апоптоз, индуцированный GADD34, и связываются с белками GADD34 и hSNF5 / INI1». Мол. Cell. Биол. 19 (10): 7050–60. Дои:10.1128 / mcb.19.10.7050. ЧВК  84700. PMID  10490642.
• Хасэгава Т., Яги А., Исобэ К. (2000). «Взаимодействие между GADD34 и суперсемейством кинезинов, KIF3A». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 267 (2): 593–6. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1991. PMID  10631107.
• Хасэгава Т., Сяо Х, Хамадзима Ф, Исобэ К. (2001). «Взаимодействие между повреждающим ДНК белком GADD34 и новым членом семейства белков теплового шока Hsp40, которое индуцируется повреждающим ДНК реагентом». Biochem. J. 352 (3): 795–800. Дои:10.1042/0264-6021:3520795. ЧВК  1221519. PMID  11104688.
• Гришин А.В., Ажипа О., Семенов И., Кори С.Дж. (2001). «Взаимодействие между протеином 34, вызывающим остановку роста ДНК, и киназой Lyn Src негативно регулирует генотоксический апоптоз». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (18): 10172–7. Bibcode:2001PNAS ... 9810172G. Дои:10.1073 / пнас.191130798. ЧВК  56934. PMID  11517336.
• Коннор Дж. Х., Вейзер Д. К., Ли С. и др. (2001). «Остановка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD34 собирает новый сигнальный комплекс, содержащий протеинфосфатазу 1 и ингибитор 1». Мол. Cell. Биол. 21 (20): 6841–50. Дои:10.1128 / MCB.21.20.6841-6850.2001. ЧВК  99861. PMID  11564868.
• Ву Д.Ю., Ткачук Д.К., Роберсон Р.С., Шубах WH (2002). «Белок SNF5 / INI1 человека способствует функции остановки роста и белка, индуцируемого повреждением ДНК (GADD34), и модулирует активность GADD34-связанной протеинфосфатазы-1». J. Biol. Chem. 277 (31): 27706–15. Дои:10.1074 / jbc.M200955200. PMID  12016208.
• Корабёвская М, Кордон-Кардо C, Betke H, et al. (2003). «GADD153 - независимый прогностический фактор при меланоме: иммуногистохимический и молекулярно-генетический анализ». Histol. Гистопатол. 17 (3): 805–11. PMID  12168790.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кисть MH, Weiser DC, Shenolikar S (2003). «Остановка роста и индуцируемый повреждением ДНК белок GADD34 нацеливает протеинфосфатазу 1 альфа на эндоплазматический ретикулум и способствует дефосфорилированию альфа-субъединицы фактора инициации трансляции 2 эукариот». Мол. Cell. Биол. 23 (4): 1292–303. Дои:10.1128 / MCB.23.4.1292-1303.2003. ЧВК  141149. PMID  12556489.
• Хунг В.Дж., Роберсон Р.С., Тафт Дж., Ву Д.Й. (2003). «Белки BAG-1 человека связываются с белком клеточной реакции на стресс GADD34 и мешают функциям GADD34». Мол. Cell. Биол. 23 (10): 3477–86. Дои:10.1128 / MCB.23.10.3477-3486.2003. ЧВК  164759. PMID  12724406.
• Холландер М.С., Пула-Келла С., Форнас А.Дж. (2003). «Функциональные домены Gadd34, участвующие в подавлении роста и апоптозе». Онкоген. 22 (25): 3827–32. Дои:10.1038 / sj.onc.1206567. PMID  12813455.
• Powolny A, Takahashi K, Hopkins RG, Loo G (2004). «Индукция экспрессии гена GADD фенэтилизотиоцианатом в клетках аденокарциномы толстой кишки человека». J. Cell. Биохим. 90 (6): 1128–39. Дои:10.1002 / jcb.10733. PMID  14635187. S2CID  33081723.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ши В., Сунь Ц., Хе Б и др. (2004). «GADD34-PP1c, рекрутируемый Smad7, дефосфорилирует рецептор TGFbeta типа I». J. Cell Biol. 164 (2): 291–300. Дои:10.1083 / jcb.200307151. ЧВК  2172339. PMID  14718519.
• Колланд Ф., Жак Х, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.