PPP1R9A - PPP1R9A

PPP1R9A
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WF8
Идентификаторы
Псевдонимы	PPP1R9A, NRB1, NRBI, Neurabin-I, регуляторная субъединица 9A протеинфосфатазы 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602468 MGI: 2442401 ГомолоГен: 14247 Генные карты: PPP1R9A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q21.3 Начинать 94,907,202 бп[1] Конец 95,296,415 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 A1 | 6 1.86 см Начинать 4,902,917 бп[2] Конец 5,165,661 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • специфическое связывание белкового домена • связывание протеинфосфатазы 1 • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание GTPase • связывание актина • связывание актиновой нити • связывание с С-концом белка • связывание протеинкиназы • связывание ионного канала • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • дендритный позвоночник шеи • цитозоль • филоподий • конус роста • нервномышечное соединение • дендритный позвоночник • синапс • ламеллиподиум конуса роста • соединение клеток • тело нейрональной клетки • кортикальный актиновый цитоскелет • проекция нейрона • цитоскелет • ламеллиподиум • цитоплазма • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • актиновый цитоскелет • дендрит • постсинаптический актиновый цитоскелет • глутаматергический синапс Биологический процесс • регулирование сборки филоподий • дифференциация клеток • регуляция структурной пластичности синапсов • регулирование сборки синапсов • старение • клеточный ответ на токсическое вещество • развитие нейрона • положительная регуляция развития дендритных позвонков • развитие нервной системы • развитие многоклеточного организма • регуляция полимеризации актиновых филаментов • возбуждающий постсинаптический потенциал • отрицательная регуляция долговременной синаптической потенциации • отрицательная регуляция спонтанной секреции нейромедиаторов • положительное регулирование длительной синаптической депрессии • положительная регуляция развития проекции нейронов • отрицательное регулирование сборки напряженных волокон • регуляция морфогенеза дендритного шипа • положительная регуляция активности протеинкиназы • организация актиновых филаментов • кальций-опосредованная передача сигналов • развитие проекции нейрона • модуляция химической синаптической передачи • Постсинаптическая организация актинового цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55607	243725
Ансамбль	ENSG00000158528	ENSMUSG00000032827
UniProt	Q9ULJ8	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001166160 NM_001166161 NM_001166162 NM_001166163 NM_017650	NM_181595 NM_001363809
RefSeq (белок)	NP_001159632 NP_001159633 NP_001159634 NP_001159635 NP_060120 NP_001159635.1	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 7: 94.91 - 95.3 Мб	Chr 6: 4.9 - 5.17 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нойрабин-1 это белок что у людей кодируется PPP1R9A ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158528 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032827 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р., Хиросава М., Номура Н., Охара О. (январь 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (5): 337–45. Дои:10.1093 / днарес / 6.5.337. PMID  10574462.
6. «Ген Entrez: протеинфосфатаза 1 PPP1R9A, регуляторная (ингибиторная) субъединица 9A».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Наканиши Х., Обайши Х., Сато А. и др. (1997). «Нейрабин: новый белок, специфичный для нервной ткани, связывающий актиновые нити, участвующий в образовании нейритов». J. Cell Biol. 139 (4): 951–61. Дои:10.1083 / jcb.139.4.951. ЧВК  2139968. PMID  9362513.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• МакЭвой Т., Аллен П.Б., Обайши Х. и др. (1999). «Регулирование взаимодействия нейрабина I с протеинфосфатазой 1 путем фосфорилирования». Биохимия. 38 (39): 12943–9. Дои:10.1021 / bi991227d. PMID  10504266.
• Стивенс DJ, Бантинг Дж. (1999). «Прямое взаимодействие мембранного белка транс-сети Гольджи, TGN38, с белком, связывающим F-актин, нейрабином». J. Biol. Chem. 274 (42): 30080–6. Дои:10.1074 / jbc.274.42.30080. PMID  10514494.
• Оливер С.Дж., Терри-Лоренцо Р.Т., Эллиотт Э. и др. (2002). "Нацеливание протеинфосфатазы 1 (PP1) на актиновый цитоскелет: комплекс Neurabin I / PP1 регулирует морфологию клеток". Мол. Клетка. Биол. 22 (13): 4690–701. Дои:10.1128 / MCB.22.13.4690-4701.2002. ЧВК  133892. PMID  12052877.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома 7 человека: последовательность ДНК и биология». Наука. 300 (5620): 767–72. Дои:10.1126 / science.1083423. ЧВК  2882961. PMID  12690205.
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Дои:10.1038 / природа01782. PMID  12853948.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.