PRKRA - PRKRA

PRKRA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DIX
Идентификаторы
Псевдонимы	PRKRA, DYT16, PACT, RAX, HSD14, белковый активатор интерферон-индуцированной протеинкиназы EIF2AK2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603424 MGI: 1344375 ГомолоГен: 2738 Генные карты: PRKRA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q31.2 Начните 178,431,414 бп[1] Конец 178,451,512 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 C3 Начните 76,629,898 бп[2] Конец 76,648,015 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание ферментов • связывание двухцепочечной РНК • GO: 0010577 активность активатора фермента • Связывание РНК • связывание пре-миРНК Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • внутриклеточный • нуклеоплазма • перинуклеарная область цитоплазмы • цитозоль • RISC-погрузочный комплекс Биологический процесс • морфогенез скелетной системы • ответ на вирус • морфогенез наружного уха • пре-miRNA процессинг • фосфорилирование белков • иммунная реакция • морфогенез среднего уха • клеточный ответ на окислительный стресс • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути • отрицательное регулирование пролиферации клеток • производство miRNA, участвующих в подавлении генов с помощью miRNA • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности • стабилизация белка • miRNA метаболический процесс • производство миРНК, участвующей в РНК-интерференции • подавление гена с помощью РНК • GO: 0022415 вирусный процесс • развитие уха Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8575	23992
Ансамбль	ENSG00000180228	ENSMUSG00000002731
UniProt	O75569	Q9WTX2
RefSeq (мРНК)	NM_001139517 NM_001139518 NM_001316362 NM_003690	NM_011871
RefSeq (белок)	NP_001132989 NP_001132990 NP_001303291 NP_003681	NP_036001
Расположение (UCSC)	Chr 2: 178.43 - 178.45 Мб	Chr 2: 76.63 - 76.65 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеинкиназа, интерферон-индуцируемый двухцепочечный зависимый активатор РНК, также известен как интерферон-индуцируемый активатор двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы A или пRotein ACTиватор интерферон-индуцированной протеинкиназы (ПАКТ) это белок что у людей кодируется PRKRA ген.^[5][6][7] PACT гетеродимеризуется и активирует протеинкиназа R.^[6][8]Мутации PRKRA связаны с редкой формой паркинсонической дистонии.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000180228 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002731 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: протеинкиназа PRKRA, интерферон-индуцируемый двухцепочечный зависимый активатор РНК».
6. Пател Р.К., Сен GC (август 1998 г.). «PACT, белковый активатор интерферон-индуцированной протеинкиназы PKR». EMBO J. 17 (15): 4379–90. Дои:10.1093 / emboj / 17.15.4379. ЧВК  1170771. PMID  9687506.
7. Ито Т., Ян М., Мэй В.С. (май 1999 г.). «RAX, клеточный активатор двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы во время передачи сигналов стресса». J. Biol. Chem. 274 (22): 15427–32. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15427. PMID  10336432.
8. Хуанг X, Хатчинс Б., Пател Р.С. (август 2002 г.). «С-концевой, третий консервативный мотив белкового активатора PACT играет важную роль в активации двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы (PKR)». Biochem. J. 366 (Pt 1): 175–86. Дои:10.1042 / BJ20020204. ЧВК  1222748. PMID  11985496.
9. Камаргос С., Шольц С., Симон-Санчес Дж., Паисан-Руис К., Льюис П., Эрнандес Д., Динг Дж., Гиббс Дж. Р., Куксон М. Р., Бра Дж., Геррейро Р., Оливейра С. Р., Лис А., Харди Дж., Кардосо Ф, Синглтон AB (март 2008 г.). «DYT16, новое заболевание паркинсонизм с дистонией с началом в молодом возрасте: идентификация сегрегационной мутации в белке реакции на стресс PRKRA». Ланцет Неврология. 7 (3): 207–215. Дои:10.1016 / S1474-4422 (08) 70022-X. PMID  18243799. S2CID  206157913.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Петерс Г.А., Хартманн Р., Цинь Дж. И др. (2001). «Модульная структура PACT: отдельные домены для связывания и активации PKR». Mol Cell Biol. 21 (6): 1908–20. Дои:10.1128 / MCB.21.6.1908-1920.2001. ЧВК  86773. PMID  11238927.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Хорнг Т., Бартон Г.М., Меджитов Р. (2001). «TIRAP: адаптерная молекула в пути передачи сигналов Toll». Nat. Иммунол. 2 (9): 835–41. Дои:10.1038 / ni0901-835. PMID  11526399. S2CID  7296195.
• Хуанг X, Хатчинс Б., Патель Р.К. (2002). «С-концевой, третий консервативный мотив белкового активатора PACT играет важную роль в активации двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы (PKR)». Biochem. J. 366 (Pt 1): 175–86. Дои:10.1042 / BJ20020204. ЧВК  1222748. PMID  11985496.
• Петерс Г.А., Кху Д., Мор И., Сен Г.К. (2002). «Ингибирование PACT-опосредованной активации PKR белком Us11 вируса простого герпеса 1 типа». Дж. Вирол. 76 (21): 11054–64. Дои:10.1128 / JVI.76.21.11054-11064.2002. ЧВК  136652. PMID  12368348.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ян М., Ито Т., Май WS (2003). «Новая роль RAX, клеточного активатора PKR, в синергетическом стимулировании экспрессии большого Т-антиген-зависимого гена SV40». J. Biol. Chem. 278 (40): 38325–32. Дои:10.1074 / jbc.M303420200. PMID  12874289.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Беннетт Р.Л., Блэлок В.Л., Мэй В.С. (2004). «Фосфорилирование серина 18 RAX, активатора PKR, необходимо для активации PKR и последующего ингибирования трансляции». J. Biol. Chem. 279 (41): 42687–93. Дои:10.1074 / jbc.M403321200. PMID  15299031.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Петерс Г.А., Ли С., Сен Г.К. (2006). «Фосфорилирование специфических остатков серина в PKR-активационном домене PACT необходимо для его способности опосредовать апоптоз». J Biol Chem. 281 (46): 35129–36. Дои:10.1074 / jbc.M607714200. PMID  16982605.
• Роу TM, Рицци М., Хиросе К., Петерс Г.А. и др. (2006). «Роль двухцепочечного РНК-связывающего белка PACT в развитии уха и слухе мышей». Proc Natl Acad Sci USA. 103 (15): 5823–8. Дои:10.1073 / pnas.0601287103. ЧВК  1458657. PMID  16571658.
• Ли С., Петерс Г.А., Динг К. и др. (2006). «Молекулярная основа активации PKR с помощью PACT или дцРНК». Proc Natl Acad Sci USA. 103 (26): 10005–10. Дои:10.1073 / pnas.0602317103. ЧВК  1502496. PMID  16785445.
• Ли Y, Hur I, Park SY и др. (2006). «Роль PACT в пути подавления РНК». EMBO J. 25 (3): 522–32. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600942. ЧВК  1383527. PMID  16424907.
• Беннетт Р.Л., Блэлок В.Л., Абтахи Д.М. и др. (2006). «RAX, активатор PKR, сенсибилизирует клетки к воспалительным цитокинам, отмене сыворотки, химиотерапии и вирусным инфекциям». Кровь. 108 (3): 821–9. Дои:10.1182 / кровь-2005-11-006817. ЧВК  1617065. PMID  16861340.
• Петерс Г.А., Сикрист Д.Д., Кери Р.А. и др. (2009). «Двухцепочечный РНК-связывающий белок, PACT, необходим для постнатальной пролиферации передней доли гипофиза». Proc Natl Acad Sci USA. 106 (26): 10696–701. Дои:10.1073 / pnas.0900735106. ЧВК  2705576. PMID  19541653.