Белок, связанный с патогенезом - Pathogenesis-related protein

Белки, связанные с патогенезом (PR) находятся белки произведено в растения в случае возбудитель атака.^[1] Они есть индуцированный как часть системная приобретенная резистентность. Инфекции активируют гены, производящие белки PR. Некоторые из этих белков являются антимикробными и атакуют молекулы клеточной стенки бактерии или грибка. Другие могут действовать как сигналы, которые распространяют «новости» об инфекции в соседние клетки. Инфекции также стимулируют сшивание молекул в клеточной стенке и отложение лигнин, ответные меры, которые создают локальную баррикаду, которая замедляет распространение патогена на другие части растения.^[2]

Салициловая кислота играет роль в сопротивление к патогенам, индуцируя производство белков, связанных с патогенезом.^[3] Много белки в вине являются белками, связанными с патогенами винограда.^[4] К ним относятся тауматин -подобные белки и хитиназы.

Многие семейства белков, связанных с патогенезом, также совпадают с группами аллергенов человека, хотя аллергия может не иметь ничего общего с защитной функцией белков.^[5] Группирование этих белков по признакам их последовательностей позволяет находить потенциально аллергенные белки из секвенированных геномов растений, область исследований, получившая название "аллергеномика ".^[6]

Классификация

По состоянию на 2014 г.^{[Обновить]}, Названы 17 семейств PR белков:^[5]

Идентифицированы различные семейства PR-белков и аллергены

Семья	Классификация доменов	Белки	Функции	Аллергены
PR-1	IPR034111 IPR001283	ПР-1 а, ПР-1 б и ПР-1 в	Противогрибковое (КОЛПАЧОК )	Cuc m 3 (дыня; P83834) - синдром оральной аллергии.
PR-2	(GH17 )	β-1,3-глюканазы	Расщепляет β-1,3-глюканы	Hev b 2 (латекс; P52407) - контактный дерматит Оле е 9 (оливковое) - респираторная аллергия. Mus a 5 (банан) - синдром оральной аллергии.
PR-3	IPR016283	Типы хитиназы I, II, IV, V, VI и VII	Эндохитиназа	Pers a 1 (авокадо) - воспаление глаз или носа, астма, отек и т. Д. Mus a 2 (банан) - пищевая аллергия, например отек губ, анафилаксия и т. Д.
PR-4	IPR001153	Домен Барвин хитиназа I / II	Противогрибковые и хитиназы	Pro-heveins: Hev b 6 - контактный дерматит.
PR-5	IPR001938	Тауматин -подобно	Противогрибковый	Jun a 3 (горный кедр), Cry j 1 (японский кедр) и Cup a 3 (аризонский кипарис) - ринит, конъюнктивит и астма. Pru av 2 (вишня), Mal d 2 (яблоко), Cap a 1 (болгарский перец), Act d 2 (киви) и Mus a 4 (банан) - синдром оральной аллергии.
PR-6	IPR000864	Картофельная протеаза I	Ингибитор протеиназы
PR-7	(Субтилизин -подобно)	Эндопротеиназа томата P69 (O82007)	Эндопротеиназа
PR-8	(GH18 )	Хитиназа огурца	Хитиназа III	Гевамин (латекс, P23472) - контактный дерматит. Ziz m 1 (мармелад индийский, Q2VST0) - синдром оральной аллергии. Cof a 1 (кофе, D7REL9) - аллергия на глаза и дыхательные пути
PR-9	(Пероксидаза гема III)	Табачная лигнин-образующая пероксидаза (P11965)	Пероксидаза
PR-10	IPR024949 IPR000916	Петрушка "ПР-1"	Рибонуклеазоподобный	Bet v 1 (пыльца березы) - аллергический риноконъюнктивит и астма Pru av 1 (вишня), Mal d 1 (яблоко), Api g 1 (сельдерей) и Dau c 1 (морковь) - синдром оральной аллергии. Gly m 4 (соя), Vig r 1 (маш), Cor a 1 (лесной орех) и Cas s 1 (каштан), Act c 8 (золотой киви), Act d 8 (зеленый плод киви) - оральная аллергия синдром
PR-11	(GH18 )	Табачная хитиназа V (Q43576)	Хитиназа
PR-12	IPR008176	Редис Rs-AFP3 (O24332)	Растительный дефенсин
PR-13	IPR001010	Arabidopsis THI2.1 (Q42596)	Тионин
PR-14	IPR000528	Белки-переносчики липидов	Перемещение фосфолипидов и жирных кислот	Par j 1 (сорняк; P43217) - ринит и астма Pru p 3 (персик), Mal d 3 (яблоко), Pru av 3 (вишня), Pru ar 3 (абрикос), Cor a 8 (лесной орех), Cas s 8 (каштан) и Zea m 14 (кукуруза) - синдром оральной аллергии
PR-15	IPR001929	Ячмень OxOa (P45850)	росток; Оксалатоксидаза
PR-16	IPR001929	OxOLP ячменя (O49871)	зародышевый
PR-17	IPR007541	Табак NtPRp27 (Q9XIY9)	фитофтороз (?)[7]

Идентификация

Поскольку белки PR продуцируются при стрессе растительной ткани, используются различные способы передачи сигналов стресса, чтобы «приманить» растение к экспрессии генов PR для идентификации. Полезные факторы стресса включают фактическую инфекцию или просто защитные сигналы, такие как салицилат и метилжасмонат. Белки могут быть идентифицированы путем выделения, расщепления пептидов и сопоставления с геномными последовательностями (секвенирование белков ). Затем полученные последовательности можно проверить на соответствие известным семействам белков PR для категоризации.^[8][9]

Смотрите также

• Ацибензолар-S-метил
• Глоссарий фитопатологии
• Ген R, неродственные белки устойчивости

Рекомендации

1. Loon LC (1985). «Белки, связанные с патогенезом». Молекулярная биология растений. 4 (2–3): 111–116. Дои:10.1007 / BF02418757. PMID  24310747.
2. Кэмпбелл, Н.А. и Рис, Дж. Б. (2005). Биология (7-е изд). Сан-Франциско: Бенджамин Каммингс.
3. Van Huijsduijnen RAMH; Alblas SW; Де Райк Р.Х .; Бол Дж. Ф. (1986). «Индукция салициловой кислотой белков, связанных с патогенезом, и устойчивость к инфекции вируса мозаики люцерны у различных видов растений». Журнал общей вирусологии. 67 (10): 2135–2143. Дои:10.1099/0022-1317-67-10-2135.
4. Уотерс EJ, Ширли NJ, Уильямс PJ (1996). «Мешающие белки вина являются белками, связанными с патогенезом винограда». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии. 44 (1): 3–5. Дои:10.1021 / jf9505584.
5. Синха, Мау; Сингх, Рашми Прабха; Кушваха, Гаджрадж Сингх; Икбал, Насир; Сингх, Авинаш; Кошик, Санкет; Каур, Пунит; Шарма, Суджата; Сингх, Тедж П. (2014). «Текущий обзор аллергенов семейств белков, связанных с патогенезом растений». Научный мировой журнал. 2014: 543195. Дои:10.1155/2014/543195. ЧВК  3947804. PMID  24696647. Эта статья содержит цитаты из этого источника, который доступен под Лицензия Creative Commons Attribution 3.0 (CC BY 3.0) лицензия.
6. Ди Джироламо, Ф; Muraca, M; Маццина, О; Ланте, я; Дахда, Л. (июнь 2015 г.). «Протеомные приложения при пищевой аллергии: пищевая аллергеномика». Текущее мнение в области аллергии и клинической иммунологии. 15 (3): 259–66. Дои:10.1097 / ACI.0000000000000160. PMID  25899690.
7. Ши, X; Тиан, Z; Лю, Дж; ван дер Фоссен, EA; Се, К. (февраль 2012 г.). «Ген белка, связанного с патогенезом картофеля, StPRp27, вносит вклад в расовую неспецифическую устойчивость против Phytophthora infestans». Отчеты по молекулярной биологии. 39 (2): 1909–16. Дои:10.1007 / s11033-011-0937-5. PMID  21667110.
8. Эльвира, М. И .; Гальдеано, М. М .; Gilardi, P .; Гарсия-Луке, I .; Серра, М. Т. (19 марта 2008 г.). «Протеомный анализ белков, связанных с патогенезом (PR), индуцированных совместимыми и несовместимыми взаимодействиями вируса легкой крапчатости перца (PMMoV) в растениях Capsicum chinense L3». Журнал экспериментальной ботаники. 59 (6): 1253–1265. Дои:10.1093 / jxb / ern032. PMID  18375936.
9. Sabater-Jara, AB; Альмагро, Л; Бельчи-Наварро, S; Barceló, AR; Педреньо, Массачусетс (март 2011 г.). «Метилжасмонат индуцирует внеклеточные белки, связанные с патогенезом, в культурах клеток Capsicum chinense». Сигнализация и поведение растений. 6 (3): 440–2. Дои:10.4161 / psb.6.3.14451. ЧВК  3142433. PMID  21346408.

дальнейшее чтение

• Мутукришнан С., Датта С.П. (1999). Белки, связанные с патогенезом растений. Бока-Ратон: CRC Press. стр.291. ISBN  0-8493-0697-3.
• «Защитные белки высших растений». dmd.nihs.go.jp.

Эта статья включает текст Мау Синха, Рашми Прабха Сингх, Гаджрадж Сингх Кушваха, Насир Икбал, Авинаш Сингх, Санкет Кошик, Пунит Каур, Суджата Шарма и Тедж П. Сингх, доступные под CC BY 3.0 лицензия.

внешняя ссылка

• Номенклатура аллергенов ВОЗ для преобразования аллергенов в определенные последовательности.
• UniProt ключевое слово: KW-0568
• Генная онтология отображение: ИДТИ: 0009607, GO: 0006952