Празиновирус - Prasinovirus

Празиновирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Вариднавирия
Королевство:Bamfordvirae
Тип:Nucleocytoviricota
Учебный класс:Megaviricetes
Заказ:Альгавиралес
Семья:Phycodnaviridae
Род:Празиновирус
Типовой вид
Вирус Micromonas pusilla SP1

Празиновирус это род большой двухцепочечной ДНК вирусы, в семье Phycodnaviridae это заразить фитопланктон в Prasinophyceae. В настоящее время в этом роде всего два вида, включая типовой вид. Вирус Micromonas pusilla SP1 [1][2], который заражает космополитических фотосинтетических жгутиконосцев Микромонас пустышка.[3]

Негативное окрашенное изображение MpV-SP1

Однако существует большая группа генетически разнообразных, но родственных вирусов, которые демонстрируют значительные доказательства боковой перенос гена.[4][5]

Диаграмма Венна общих кодирующих последовательностей (CDS) четырех MpV и M. pusilla UTEX LB991, основанная на кластерах по 0,5 аминокислотной идентичности. Пунктирные круги представляют гены хозяина, общие с вирусами. [5] .

Таксономия

Группа: dsDNA

[2]

Структура

Вирусы в Prasinovirus имеют оболочку с икосаэдрической и круглой геометрией и симметрией T = 169. Диаметр составляет порядка 104-118 нм.[1]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
ПразиновирусИкосаэдрТ = 169ОкутанныйЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса нуклео-цитоплазматическая. Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с использованием шаблонов ДНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяин путем лизиса через литические фосфолипиды. Природным хозяином служат водоросли. Пути передачи - пассивное распространение.[1]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ПразиновирусAlgaНиктоЭндоцитоз клеточных рецепторовЛизисЯдроЦитоплазмаПассивная диффузия

Рекомендации

  1. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  2. ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 15 июн 2015.
  3. ^ Коттрелл, Мэтью Т .; Саттл, Кертис А. (1991). «Широкое распространение и клональная изменчивость вирусов, вызывающих лизис космополитического, эукариотического морского фитопланктера», Micromonas pusilla"". Серия "Прогресс морской экологии". 78: 1–9. Bibcode:1991МЭПС ... 78 .... 1С. Дои:10.3354 / meps078001. ISSN  1616-1599.
  4. ^ Bellec, Laure; Гримсли, Найджел; Дерелль, Эвелин; Моро, Эрве; Desdevises, Ив (2010). «Численность, пространственное распространение и генетическое разнообразие вирусов Ostreococcus tauri в двух различных средах». Отчеты по микробиологии окружающей среды. 2 (2): 313–321. Дои:10.1111 / j.1758-2229.2010.00138.x. PMID  23766083.
  5. ^ а б Финке, Ян Ф; Winget, Danielle M; Чан, Эми М; Саттл, Кертис А. (2017). "Вариации в генетическом репертуаре вирусов. Micromonas pusilla отражает горизонтальный перенос генов и связь с их распределением в окружающей среде ". Вирусы. 9 (5): 116. Дои:10.3390 / v9050116. ЧВК  5454428. PMID  28534829.

внешняя ссылка