RAB1B - RAB1B

RAB1B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3JZA, 3НКВ, 4HLQ, 4I1O
Идентификаторы
Псевдонимы	RAB1B, член семейства онкогенов РАН
Внешние идентификаторы	OMIM: 612565 MGI: 1923558 ГомолоГен: 128838 Генные карты: RAB1B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.2 Начните 66,268,590 бп[1] Конец 66,277,492 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начните 5,099,205 бп[2] Конец 5,107,072 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание GTP • GO: 0001948 связывание с белками • ГТФазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана преаутофагосомальной структуры • аппарат Гольджи • мембрана • Мембрана Гольджи • транспортная везикула • митохондрия • внеклеточная экзосома • эндоплазматический ретикулум - мембрана промежуточного отсека Гольджи • эндоплазматический ретикулум-промежуточный компартмент Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • цитозоль • перинуклеарная область цитоплазмы Биологический процесс • установление эндотелиального кишечного барьера • положительная регуляция процесса обмена гликопротеинов • аутофагия • регуляция сборки аутофагосом • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • Покрытие везикул COPII • транспорт белка • ретроградный везикулярный транспорт, Гольджи в ER • посттрансляционная модификация • транспорт • внутриклеточный транспорт белка • Передача сигнала белка Rab Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	81876	76308
Ансамбль	ENSG00000174903	ENSMUSG00000024870
UniProt	Q9H0U4	Q9D1G1
RefSeq (мРНК)	NM_030981	NM_029576
RefSeq (белок)	NP_112243	NP_083852
Расположение (UCSC)	Chr 11: 66,27 - 66,28 Мб	Chr 19: 5.1 - 5.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Родственный Ras белок Rab-1B это белок что у людей кодируется RAB1B ген.^[5][6]

Взаимодействия

RAB1B был показан взаимодействовать с участием ГОЛГА2.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000174903 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000024870 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чен Д., Го Дж., Гал В.А. (март 1997 г.). «RAB GTPases, экспрессируемые в клетках меланомы человека». Biochim Biophys Acta. 1355 (1): 1–6. Дои:10.1016 / S0167-4889 (96) 00169-3. PMID  9030196.
6. «Ген Entrez: RAB1B RAB1B, член семейства онкогенов RAS».
7. Weide, T; Bayer M; Köster M; Siebrasse J P; Peters R; Барнеков А. (апрель 2001 г.). "Белок матрикса Гольджи GM130: специфический взаимодействующий партнер малой GTPase rab1b". EMBO Rep. Англия. 2 (4): 336–41. Дои:10.1093 / embo-reports / kve065. ISSN  1469-221X. ЧВК  1083862. PMID  11306556.

дальнейшее чтение

• Плутнер Х., Кокс А.Д., Пинд С. и др. (1991). «Rab1b регулирует везикулярный транспорт между эндоплазматическим ретикулумом и последовательными компартментами Гольджи». J. Cell Biol. 115 (1): 31–43. Дои:10.1083 / jcb.115.1.31. ЧВК  2289927. PMID  1918138.
• Soldati T, Rancaño C, Geissler H, Pfeffer SR (1995). «Rab7 и Rab9 рекрутируются в поздние эндосомы с помощью биохимически различимых процессов». J. Biol. Chem. 270 (43): 25541–8. Дои:10.1074 / jbc.270.43.25541. PMID  7592724.
• Уилсон А.Л., Шеридан К.М., Эрдман Р.А., Мальтийский штат Вашингтон (1996). «Пренилирование мутанта Rab1B с измененной активностью GTPase нарушается в бесклеточных системах, но не в интактных клетках млекопитающих». Biochem. J. 318 (Pt 3): 1007–14. Дои:10.1042 / bj3181007. ЧВК  1217717. PMID  8836150.
• Овермейер Дж. Х., Уилсон А. Л., Эрдман Р. А., Мальтийский Вашингтон (1998). "Предполагаемый" переключатель 2 "домена Ras-связанной GTPазы, Rab1B, играет важную роль во взаимодействии с Rab Escort Protein". Мол. Биол. Ячейка. 9 (1): 223–35. Дои:10.1091 / mbc.9.1.223. ЧВК  25245. PMID  9437002.
• Вайде Т., Костер М., Барнеков А. (1999). «Неактивные и активные мутанты rab1b плохо интегрированы в мембраны-мишени». Int. Дж. Онкол. 15 (4): 727–36. Дои:10.3892 / ijo.15.4.727. PMID  10493955.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Вайде Т., Байер М., Кёстер М. и др. (2001). "Белок матрикса Гольджи GM130: специфический взаимодействующий партнер малой GTPase rab1b". EMBO Rep. 2 (4): 336–41. Дои:10.1093 / embo-reports / kve065. ЧВК  1083862. PMID  11306556.
• Чжао Х., Эттала О, Вяэнянен Х.К. (2002). «Пути внутриклеточного переноса мембран в остеокластах, резорбирующих кость, выявленные путем клонирования и исследований субклеточной локализации малых GTP-связывающих белков кролика». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 293 (3): 1060–5. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00326-1. PMID  12051767.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Фишер Дж, Вайде Т., Барнеков А. (2005). «Белки MICAL и rab1: возможная связь с цитоскелетом?». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 328 (2): 415–23. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.12.182. PMID  15694364.
• Байер М., Фишер Дж., Кремерскотен Дж. И др. (2006). «Идентификация и характеристика ипорина как нового партнера по взаимодействию для rab1». BMC Cell Biol. 6 (1): 15. Дои:10.1186/1471-2121-6-15. ЧВК  1079803. PMID  15796781.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Монетта П., Славин I, Ромеро Н., Альварес С. (2007). «Rab1b взаимодействует с GBF1 и модулирует динамику ARF1 и ассоциацию COPI». Мол. Биол. Ячейка. 18 (7): 2400–10. Дои:10.1091 / mbc.E06-11-1005. ЧВК  1924811. PMID  17429068.
• Махнер М.П., ​​Исберг Р.Р. (2007). «Бифункциональный бактериальный белок связывает смещение GDI с активацией Rab1». Наука. 318 (5852): 974–7. Bibcode:2007Научный ... 318..974M. Дои:10.1126 / science.1149121. PMID  17947549. S2CID  21889766.