RAB3D - RAB3D

RAB3D
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2GF9
Идентификаторы
Псевдонимы	RAB3D, D2-2, GOV, RAB16, RAD3D, член семейства онкогенов RAS
Внешние идентификаторы	OMIM: 604350 MGI: 97844 ГомолоГен: 20902 Генные карты: RAB3D
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.2 Начните 11,322,068 бп[1] Конец 11,346,270 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A3 Начните 21,907,491 бп[2] Конец 21,918,192 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание GTP • связывание миозина V • GTP-зависимое связывание с белками • ГТФазная активность Сотовый компонент • гранула зимогена • цитоплазматическая микротрубочка • секреторный пузырь • внеклеточная экзосома • транспортная везикула • митохондрия • мембрана • клеточная мембрана • мембрана азурофильных гранул • эндосома • синаптический пузырек • везикул Биологический процесс • регуляция экзоцитоза • транспорт белка • метилирование пептидил-цистеина • резорбция кости • положительная регуляция регулируемого секреторного пути • экзоцитоз • дегрануляция нейтрофилов • транспорт • внутриклеточный транспорт белка • стыковка пузырьков, участвующих в экзоцитозе • секреция белка • Передача сигнала белка Rab • локализация белка на плазматической мембране Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9545	19340
Ансамбль	ENSG00000105514	ENSMUSG00000019066
UniProt	O95716	P35276
RefSeq (мРНК)	NM_004283	NM_031874 NM_001324531
RefSeq (белок)	NP_004274	NP_001311460 NP_114080
Расположение (UCSC)	Chr 19: 11.32 - 11.35 Мб	Chr 9: 21.91 - 21.92 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ras-родственный белок Rab-3D это белок что у людей кодируется RAB3D ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105514 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019066 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нисио Х., Суда Т., Савада К., Миямото Т., Коике Т., Ямагути Ю. (март 1999 г.). «Молекулярное клонирование кДНК, кодирующей человеческий Rab3D, экспрессия которого повышается при миелоидной дифференцировке». Biochim Biophys Acta. 1444 (2): 283–90. Дои:10.1016 / s0167-4781 (98) 00279-6. PMID  10023084.
6. Чен XN, Ши З.Й., Коренберг-младший, Сегал А. (март 1999 г.). «Присвоение гена GOV (сверхэкспрессия глиобластомы) полосе хромосомы человека 19p13.2 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Cytogenet Cell Genet. 83 (3–4): 230–1. Дои:10.1159/000015187. PMID  10072586. S2CID  24430172.
7. «Ген Entrez: RAB3D RAB3D, член семейства онкогенов RAS».

дальнейшее чтение

• Brondyk WH, McKiernan CJ, Fortner KA и др. (1995). «Клонирование взаимодействия Rabin3, нового белка, который связывается с Ras-подобной GTPase Rab3A». Мол. Клетка. Биол. 15 (3): 1137–43. Дои:10.1128 / MCB.15.3.1137. ЧВК  230335. PMID  7532276.
• Сегал А., Кинер С., Бойнтон А.Л. и др. (1997). «Выделение и характеристика нового гена из мультиформной опухолевой ткани глиобластомы человека». Int. J. Рак. 71 (4): 565–72. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19970516) 71: 4 <565 :: AID-IJC10> 3.0.CO; 2-B. PMID  9178809.
• Раффаниелло Р.Д., Рауфман Дж. П. (1999). «Цитозольный RAB3D связан с белком сопровождения RAB (REP), а не с ингибитором диссоциации RAB-GDP (GDI), в диспергированных главных клетках желудка морской свинки». J. Cell. Биохим. 72 (4): 540–8. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19990315) 72: 4 <540 :: AID-JCB9> 3.0.CO; 2-D. PMID  10022613.
• Картель Нью-Джерси, Ван Дж., Пост M (2002). «Тромбоцитарный фактор роста-BB-опосредованный синтез гликозаминогликанов трансдуцируется через Akt». Biochem. J. 363 (Pt 1): 19–28. Дои:10.1042/0264-6021:3630019. ЧВК  1222446. PMID  11903042.
• Ридель Д., Антонин В., Фернандес-Чакон Р. и др. (2002). «Rab3D не требуется для экзокринного экзоцитоза, но для поддержания секреторных гранул нормального размера». Мол. Клетка. Биол. 22 (18): 6487–97. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6487-6497.2002. ЧВК  135623. PMID  12192047.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Фукуда М (2003). «Отчетливая Rab-специфичность связывания Rim1, Rim2, рабфилина и Noc2. Идентификация критической детерминанты распознавания Rab3A / Rab27A с помощью Rim2». J. Biol. Chem. 278 (17): 15373–80. Дои:10.1074 / jbc.M212341200. PMID  12578829.
• Нгуен Д., Джонс А., Оджакян Г. К. и др. (2003). «Перераспределение Rab3D и функция в ацинусах околоушной железы крысы». J. Cell. Физиол. 197 (3): 400–8. Дои:10.1002 / jcp.10373. PMID  14566969. S2CID  33152672.
• Мацумото М., Мики Т., Шибасаки Т. и др. (2004). «Noc2 необходим для нормальной регуляции экзоцитоза в эндокринных и экзокринных клетках». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (22): 8313–8. Дои:10.1073 / pnas.0306709101. ЧВК  420391. PMID  15159548.
• Кноп M, Aareskjold E, Bode G, Gerke V (2005). «Rab3D и аннексин А2 играют роль в регулируемой секреции vWF, но не tPA из эндотелиальных клеток». EMBO J. 23 (15): 2982–92. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600319. ЧВК  514934. PMID  15257287.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.