RAB3IP - RAB3IP

RAB3IP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4LHX, 4LHY, 4LHZ, 4UJ3, 4UJ4, 4UJ5
Идентификаторы
Псевдонимы	RAB3IP, RABIN3, RABIN8, взаимодействующий белок RAB3A
Внешние идентификаторы	OMIM: 608686 MGI: 105933 ГомолоГен: 32340 Генные карты: RAB3IP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q15 Начинать 69,738,681 бп[1] Конец 69,823,204 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 D2 | 10 64,96 см Начинать 116,905,784 бп[2] Конец 116,950,769 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Раб гуанил-нуклеотидный фактор обмена активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цилиарное базальное тело • цитозоль • центросома • проекция клетки • цитоскелет • ламеллиподиум • ядро клетки Биологический процесс • локализация белка в органелле • транспорт белка • Гольджи к транспорту через плазматическую мембрану • белок направляется к мембране • морфогенез ресничек • стыковка цилиарного базального тела Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	117177	216363
Ансамбль	ENSG00000127328	ENSMUSG00000064181
UniProt	Q96QF0	Q68EF0
RefSeq (мРНК)	NM_001024647 NM_001278402 NM_022456 NM_175623 NM_175624 NM_175625 NM_175626 NM_175627	NM_001003950 NM_001359645
RefSeq (белок)	NP_001019818 NP_001265331 NP_071901 NP_783322 NP_783323 NP_783324	NP_001003950 NP_001346574
Расположение (UCSC)	Chr 12: 69,74 - 69,82 Мб	Chr 10: 116.91 - 116.95 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

RAB3A-взаимодействующий белок это белок что у людей кодируется RAB3IP ген.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000127328 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064181 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: RAB3IP, взаимодействующий с RAB3A белок (rabin3)».

дальнейшее чтение

• Ньюпорт Дж, Ремер М.И. (1975). «Сравнительная перинатальная смертность по основам медицинской помощи и другим моделям оказания помощи». Запрос: Журнал организации, предоставления и финансирования медицинской помощи. 12 (1): 10–7. PMID  123217.
• Brondyk WH, McKiernan CJ, Fortner KA и др. (1995). «Клонирование взаимодействия Rabin3, нового белка, который связывается с Ras-подобной GTPase Rab3A». Мол. Клетка. Биол. 15 (3): 1137–43. Дои:10.1128 / MCB.15.3.1137. ЧВК  230335. PMID  7532276.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• де Брюйн Д.Р., дос Сантос Н.Р., Катер-Баатс Э. и др. (2002). «Связанный с раком белок SSX2 взаимодействует с человеческим гомологом Ras-подобного интерактора GTPase, RAB3IP, и новым ядерным белком SSX2IP». Гены Хромосомы Рак. 34 (3): 285–98. Дои:10.1002 / gcc.10073. PMID  12007189. S2CID  11734893.
• Хаттула К., Фурухьельм Дж., Арффман А., Перэнен Дж. (2003). «Rab8-специфический фактор обмена GDP / GTP участвует в ремоделировании актина и переносе поляризованной мембраны». Мол. Биол. Клетка. 13 (9): 3268–80. Дои:10.1091 / mbc.E02-03-0143. ЧВК  124888. PMID  12221131.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q96QF0 (Rab-3A-взаимодействующий белок) на PDBe-KB.