RAE1 - RAE1

RAE1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3ММГ, 4OWR
Идентификаторы
Псевдонимы	RAE1, MIG14, MRNP41, Mnrp41, dJ481F12.3, dJ800J21.1, экспорт рибонуклеиновой кислоты 1, Gle2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603343 MGI: 1913929 ГомолоГен: 2676 Генные карты: RAE1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.31 Начните 57,351,223 бп[1] Конец 57,379,211 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H3 | 2 95,66 см Начните 173,000,117 бп[2] Конец 173,015,739 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание микротрубочек • Связывание РНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание убиквитина Сотовый компонент • цитоплазма • ядерная пора • ядро клетки • ядерная оболочка • фибриллярный центр • полюс митотического веретена • полюс шпинделя • цитоскелет • клетка-хозяин Биологический процесс • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • GO: 0022415 вирусный процесс • регуляция организации митотического веретена • транскрипционно-зависимое связывание ДНК гена РНК-полимеразы II на периферии ядра • Экспорт РНК из ядра • импорт белка в ядро • клеточный цикл • деление клеток • экспорт мРНК из ядра • регулирование гликолитического процесса • экспорт тРНК из ядра • белковое сумоилирование • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8480	66679
Ансамбль	ENSG00000101146	ENSMUSG00000027509
UniProt	P78406	Q8C570
RefSeq (мРНК)	NM_001015885 NM_003610	NM_175112
RefSeq (белок)	NP_001015885 NP_003601	NP_780321
Расположение (UCSC)	Chr 20: 57.35 - 57.38 Мб	Chr 2: 173 - 173,02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

фактор экспорта мРНК это белок что у людей кодируется RAE1 ген.^[5][6][7]

Было показано, что мутации в генах Schizosaccharomyces pombe Rae1 и Saccharomyces cerevisiae Gle2 приводят к накоплению поли (A) -содержащей мРНК в ядре, что позволяет предположить, что кодируемые белки участвуют в экспорте РНК. Белок, кодируемый этим геном, является гомологом дрожжевого Rae1. Он содержит четыре мотива WD40 и, как было показано, локализуется в различных фокусах в нуклеоплазме, на ядерном крае и в сетчатых структурах по всей цитоплазме. Считается, что этот ген участвует в ядерно-цитоплазматическом транспорте и в прямом или косвенном присоединении цитоплазматических мРНП к цитоскелету. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие тот же белок.^[7]

Взаимодействия

RAE1 был показан взаимодействовать с участием NUP98.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101146 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027509 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бхарати А., Гош А., Уэлен В.А., Юн Дж. Х., Пу Р., Дассо М., Дхар Р. (декабрь 1997 г.). «Ген RAE1 человека является функциональным гомологом гена rae1 Schizosaccharomyces pombe, участвующего в ядерном экспорте Poly (A) + РНК». Ген. 198 (1–2): 251–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00322-3. PMID  9370289.
6. Kraemer D, Blobel G (сентябрь 1997 г.). «мРНК-связывающий белок mrnp 41 локализуется как в ядре, так и в цитоплазме». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (17): 9119–24. Bibcode:1997PNAS ... 94.9119K. Дои:10.1073 / пнас.94.17.9119. ЧВК  23064. PMID  9256445.
7. «Ген Entrez: RAE1, гомолог экспорта 1 РНК RAE1 (S. pombe)».
8. Причард, С. Э .; Fornerod M; Каспер Л. Х; ван Дерсен Дж. М. (апрель 1999 г.). «RAE1 представляет собой фактор экспорта мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерной поры через несколько доменов». J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. Дои:10.1083 / jcb.145.2.237. ISSN  0021-9525. ЧВК  2133102. PMID  10209021.

дальнейшее чтение

• Nomura M, Zou Z, Joh T и др. (1997). «Геномные структуры и характеристика членов семейства Rae1, кодирующих GPI-заякоренные поверхностные белки клеток и экспрессируемых преимущественно в эмбриональном мозге мыши». J. Biochem. 120 (5): 987–95. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021517. PMID  8982867.
• Юн Дж. Х., Уэлен В. А., Бхарати А. и др. (1997). «Npp106p, нуклеопорин Schizosaccharomyces pombe, подобный Saccharomyces cerevisiae Nic96p, функционально взаимодействует с Rae1p при экспорте мРНК». Мол. Cell. Биол. 17 (12): 7047–60. Дои:10.1128 / MCB.17.12.7047. ЧВК  232561. PMID  9372936.
• Мацуока Ю., Такаги М., Бан Т. и др. (1999). «Идентификация и характеристика субкомплексов ядерных пор в митотическом экстракте соматических клеток человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 254 (2): 417–23. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9953. PMID  9918853.
• Притчард К.Э., Форнерод М., Каспер Л.Х., ван Дерсен Дж. М. (1999). «RAE1 представляет собой фактор экспорта мРНК, который связывается с GLEBS-подобным мотивом NUP98 в комплексе ядерной поры через несколько доменов».. J. Cell Biol. 145 (2): 237–54. Дои:10.1083 / jcb.145.2.237. ЧВК  2133102. PMID  10209021.
• Бачи А., Браун И.С., Родригес Дж. П. и др. (2000). «C-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов». РНК. 6 (1): 136–58. Дои:10.1017 / S1355838200991994. ЧВК  1369901. PMID  10668806.
• Юн Дж. Х., Лав Д. К., Гухатакурта А. и др. (2000). «Mex67p Schizosaccharomyces pombe взаимодействует с Rae1p, опосредуя экспорт мРНК». Мол. Cell. Биол. 20 (23): 8767–82. Дои:10.1128 / MCB.20.23.8767-8782.2000. ЧВК  86506. PMID  11073978.
• Сабри N, Visa N (2000 г.). «Белок Ct-RAE1 взаимодействует с частицами РНП кольца Бальбиани в ядерной поре». РНК. 6 (11): 1597–609. Дои:10.1017 / S1355838200001138. ЧВК  1370029. PMID  11105759.
• Ван Х, Бабу Дж. Р., Харден Дж. М. и др. (2001). «Белок митотической контрольной точки hBUB3 и фактор экспорта мРНК hRAE1 взаимодействуют с белками, содержащими GLE2p-связывающую последовательность (GLEBS)». J. Biol. Chem. 276 (28): 26559–67. Дои:10.1074 / jbc.M101083200. PMID  11352911.
• O'Callaghan CA, Cerwenka A, Willcox BE и др. (2001). «Молекулярная конкуренция за NKG2D: H60 и RAE1 неравно конкурируют за NKG2D с доминированием H60». Иммунитет. 15 (2): 201–11. Дои:10.1016 / S1074-7613 (01) 00187-X. PMID  11520456.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Bibcode:2001Натура.414..865D. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Kraemer D, Dresbach T, Drenckhahn D (2002). «Mrnp41 (Rae 1p) связывается с микротрубочками в клетках HeLa и в нейронах». Евро. J. Cell Biol. 80 (12): 733–40. Дои:10.1078/0171-9335-00216. PMID  11831386.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Фариа П.А., Чакраборти П., Левай А. и др. (2005). «VSV нарушает путь ядерного экспорта мРНК Rae1 / mrnp41». Мол. Ячейка. 17 (1): 93–102. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.11.023. PMID  15629720.
• Бензингер А., Мустер Н., Кох HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, обычно подавляемого при раке». Мол. Cell. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Blower MD, Nachury M, Heald R, Weis K (2005). «Рибонуклеопротеиновый комплекс, содержащий Rae1, необходим для сборки митотического веретена». Ячейка. 121 (2): 223–34. Дои:10.1016 / j.cell.2005.02.016. PMID  15851029. S2CID  242561.
• Вонг RW, Блобель G, Coutavas E (2007). «Взаимодействие Rae1 с NuMA необходимо для формирования биполярного веретена». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (52): 19783–7. Bibcode:2006PNAS..10319783W. Дои:10.1073 / pnas.0609582104. ЧВК  1750899. PMID  17172455.