RAP1GDS1 - RAP1GDS1 - Wikipedia

RAP1GDS1
Идентификаторы
Псевдонимы	RAP1GDS1, GDS1, SmgGDS, Rap1 Стимулятор диссоциации GTPase-GDP 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 179502 MGI: 2385189 ГомолоГен: 41422 Генные карты: RAP1GDS1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q23 Начинать 98,261,384 бп[1] Конец 98,443,861 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 H1 Начинать 138,925,902 бп[2] Конец 139,075,201 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • цитозоль • внеклеточная экзосома • эндоплазматический ретикулум • митохондрия Биологический процесс • отрицательная регуляция концентрации ионов кальция в эндоплазматическом ретикулуме • положительная регуляция концентрации ионов кальция в митохондриях • сокращение гладких мышц сосудов • сборка миозиновой нити • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5910	229877
Ансамбль	ENSG00000138698	ENSMUSG00000028149
UniProt	P52306	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001100426 NM_001100427 NM_001100428 NM_001100429 NM_001100430 NM_021159	NM_001040690 NM_001286759 NM_145544 NM_001356388
RefSeq (белок)	NP_001093896 NP_001093897 NP_001093898 NP_001093899 NP_001093900 NP_066982	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 4: 98,26 - 98,44 Мб	Chr 3: 138.93 - 139.08 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Стимулятор диссоциации Rap1 GTPase-GDP 1 является фермент что у людей кодируется RAP1GDS1 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

RAP1GDS1 был показан взаимодействовать с KIFAP3,^[8] HRAS^[9] и RHOA.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138698 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028149 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Рисс О., Эпплен С., Седлачк И., Эпплен Дж. Т. (январь 1994 г.). «Хромосомное отнесение гена стимулятора диссоциации smg человека человека к хромосоме 4q21-q25 человека». Hum Genet. 92 (6): 629–30. Дои:10.1007 / BF00420952. PMID  8262526. S2CID  21189125.
6. Тью Г.В., Лоример Е.Л., Берг Т.Дж., Чжи Х., Ли Р., Уильямс С.Л. (январь 2008 г.). «SmgGDS регулирует пролиферацию, миграцию и транскрипционную активность NF-kappaB в немелкоклеточной карциноме легкого». J Biol Chem. 283 (2): 963–76. Дои:10.1074 / jbc.M707526200. PMID  17951244.
7. «Ген Entrez: RAP1GDS1 RAP1, стимулятор диссоциации GTP-GDP 1».
8. Симидзу, К; Kawabe H; Минами S; Honda T; Такаиши К; Ширатаки H; Takai Y (октябрь 1996 г.). "SMAP, Smg GDS-ассоциированный белок, имеющий повторы плеч и фосфорилированный тирозинкиназой Src". J. Biol. Chem. 271 (43): 27013–7. Дои:10.1074 / jbc.271.43.27013. ISSN  0021-9258. PMID  8900189.
9. Vikis, Haris G; Стюарт Скотт; Гуань Кунь-Лян (апрель 2002 г.). «SmgGDS демонстрирует дифференциальную активность связывания и обмена в отношении различных изоформ Ras». Онкоген. 21 (15): 2425–32. Дои:10.1038 / sj.onc.1205306. ISSN  0950-9232. PMID  11948427.

дальнейшее чтение

• Кикучи А., Кайбути К., Хори Ю. и др. (1992). «Молекулярное клонирование кДНК человека для стимулирующего обмена GDP / GTP белка на c-Ki-ras p21 и smg p21». Онкоген. 7 (2): 289–93. PMID  1549351.
• Симидзу К., Кавабе Х., Минами С. и др. (1996). "SMAP, Smg GDS-ассоциированный белок, имеющий повторы плеч и фосфорилированный тирозинкиназой Src". J. Biol. Chem. 271 (43): 27013–7. Дои:10.1074 / jbc.271.43.27013. PMID  8900189.
• Викис Х.Г., Стюарт С., Гуань К.Л. (2002). «SmgGDS демонстрирует дифференциальную активность связывания и обмена в отношении различных изоформ Ras». Онкоген. 21 (15): 2425–32. Дои:10.1038 / sj.onc.1205306. PMID  11948427.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• de Bruyn KM, Zwartkruis FJ, de Rooij J, et al. (2003). «Малая GTPase Rap1 активируется турбулентностью и участвует в опосредованной интегрином α IIb β 3 клеточной адгезии в мегакариоцитах человека». J. Biol. Chem. 278 (25): 22412–7. Дои:10.1074 / jbc.M212036200. PMID  12690117.
• Tiwari S, Felekkis K, Moon EY и др. (2004). «Среди циркулирующих гемопоэтических клеток B-CLL уникально экспрессирует функциональный EPAC1, но EPAC1-опосредованная активация Rap1 не учитывает апоптоз, индуцированный ингибитором PDE4». Кровь. 103 (7): 2661–7. Дои:10.1182 / кровь-2003-06-2154. PMID  14615375.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.