RAPGEF2 - RAPGEF2

RAPGEF2
Идентификаторы
Псевдонимы	RAPGEF2, CNrasGEF, NRAPGEP, PDZ-GEF1, PDZGEF1, RA-GEF, RA-GEF-1, Rap-GEP, nRap GEP, Rap фактор обмена гуаниновых нуклеотидов 2, RAGEF
Внешние идентификаторы	OMIM: 609530 MGI: 2659071 ГомолоГен: 35477 Генные карты: RAPGEF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q32.1 Начинать 159,103,013 бп[1] Конец 159,360,174 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 E3 Начинать 79,062,516 бп[2] Конец 79,286,517 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание диацилглицерина • активность преобразователя сигнала • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • Связывание домена WW • связывание фосфатидной кислоты • Связывание домена PDZ • связывание цАМФ • привязка cGMP • связывание бета-1-адренорецепторов • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rap • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • межклеточное соединение • эндоцитарный пузырек • синапс • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • апикальная плазматическая мембрана • двухклеточное плотное соединение • эндосома • соединение клеток • проекция нейрона • тело нейрональной клетки • цитоплазма • цитозоль • поздняя эндосома • мембрана • клеточная мембрана • перинуклеарная область цитоплазмы • макромолекулярный комплекс • внутриклеточный Биологический процесс • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • сигнальный путь рецептора нейротрофического фактора головного мозга • клеточный ответ на цГМФ • развитие желудочковой системы • положительное регулирование связывания белков • развитие нейронов переднего мозга • регулировка сборки узловых соединений • локализация белка на плазматической мембране • положительная регуляция развития проекции нейронов • аденилатциклаза-активирующий сигнальный путь адренергических рецепторов • развитие нервной системы • миграция нейронов • нейропептидный сигнальный путь • развитие многоклеточного организма • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • отрицательная регуляция процесса биосинтеза меланина • клеточный ответ на стимул фактора роста нервов • дифференциация клеток • положительная регуляция передачи сигналов с помощью цАМФ • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • клеточный ответ на цАМФ • сигнальный путь фактора роста нервов • регулирование пролиферации клеток • Передача сигнала Rap-белка • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • отрицательное регулирование пролиферации клеток • развитие кровеносных сосудов • положительная регуляция процесса апоптоза дендритных клеток • положительная регуляция васкулогенеза • сборка микроворсинок • отрицательная регуляция морфогенеза дендритов • регуляция синаптической пластичности • развитие проекции нейрона • установление эндотелиального кишечного барьера • положительная регуляция активности цАМФ-зависимой протеинкиназы • положительная регуляция миграции нейронов • положительная регуляция активности протеинкиназы • установление эндотелиального барьера • преобразование сигнала • Каскад MAPK • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • цАМФ-опосредованная передача сигналов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9693	76089
Ансамбль	ENSG00000109756	ENSMUSG00000062232
UniProt	Q9Y4G8	Q8CHG7
RefSeq (мРНК)	NM_014247 NM_001351724 NM_001351725 NM_001351726 NM_001351727 NM_001351728	NM_001099624 NM_001310536
RefSeq (белок)	NP_055062 NP_001338653 NP_001338654 NP_001338655 NP_001338656 NP_001338657	NP_001093094 NP_001297465
Расположение (UCSC)	Chr 4: 159.1 - 159.36 Мб	Chr 3: 79.06 - 79.29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор обмена рап-гуаниновых нуклеотидов 2 это белок что у людей кодируется RAPGEF2 ген.^[5][6][7]

RAPGEF2 - это циклический AMP связывающий белок.^[8][9]

Функция

Члены Подсемейство RAS из GTPases функционируют в передаче сигнала как переключатели, регулируемые GTP / GDP, которые циклически переключаются между неактивными ВВП - и активный GTP -связанные состояния. Факторы обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF), такие как RAPGEF2, служат активаторами RAS, способствуя приобретению GTP для поддержания активного GTP-связанного состояния, и являются ключевым звеном между рецепторами клеточной поверхности и активацией RAS.^[6]

Взаимодействия

RAPGEF2 был показан взаимодействовать с RAP1A^[6] и RALGDS.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109756 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062232 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (сентябрь 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / днарес / 4.2.141. PMID  9205841.
6. Ребхун Дж. Ф., Кастро А. Ф., Куиллиам Л. А. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация факторов обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для Rap1 GTPase. Регулирование MR-GEF посредством взаимодействия M-Ras-GTP». J Biol Chem. 275 (45): 34901–8. Дои:10.1074 / jbc.M005327200. PMID  10934204.
7. «Ген Entrez: RAPGEF2 Фактор обмена рап-гуаниновых нуклеотидов (GEF) 2».
8. Pham N, Cheglakov I, Koch CA, de Hoog CL, Moran MF, Rotin D (май 2000 г.). «Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов CNrasGEF активирует ras в ответ на цАМФ и цГМФ». Curr. Биол. 10 (9): 555–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00473-5. PMID  10801446. S2CID  16896523.
9. Эмери А.С., Эйден М.В., Мустафа Т., Эйден Л.Е. (2013). «Rapgef2 связывает GPCR-опосредованные сигналы цАМФ с активацией ERK в нейрональных и эндокринных клетках». Научный сигнал. 6 (281): ra51. Дои:10.1126 / scisignal.2003993. ЧВК  3932028. PMID  23800469.
10. Спаргарен М., Бишофф-младший (декабрь 1994 г.). "Идентификация стимулятора диссоциации гуаниновых нуклеотидов для Ral как предполагаемой эффекторной молекулы R-ras, H-ras, K-ras и Rap". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (26): 12609–13. Дои:10.1073 / пнас.91.26.12609. ЧВК  45488. PMID  7809086.

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Оцука Т., Хата Й, Ид Н и др. (1999). «nRap GEP: новый нейронный GDP / GTP-обменный белок для малого G-белка rap1, который взаимодействует с молекулой синаптического каркаса (S-SCAM)». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 265 (1): 38–44. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1619. PMID  10548487.
• Liao Y, Kariya K, Hu CD, et al. (2000). «RA-GEF, новый фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rap1A, содержащий Ras / Rap1A-ассоциированный домен, сохраняется между нематодами и людьми». J. Biol. Chem. 274 (53): 37815–20. Дои:10.1074 / jbc.274.53.37815. PMID  10608844.
• de Rooij J, Boenink NM, van Triest M, et al. (2000). «PDZ-GEF1, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов, специфичный для Rap1 и Rap2». J. Biol. Chem. 274 (53): 38125–30. Дои:10.1074 / jbc.274.53.38125. PMID  10608883.
• Чикуми Х., Фукухара С., Гуткинд Дж. С. (2002). «Регулирование факторов обмена гуаниновых нуклеотидов, связанных с G-белком, для Rho, PDZ-RhoGEF и LARG посредством фосфорилирования тирозина: доказательства роли киназы фокальной адгезии». J. Biol. Chem. 277 (14): 12463–73. Дои:10.1074 / jbc.M108504200. PMID  11799111.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемых последовательностей хрусталика взрослого человека для проекта NEIBank: более 2000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 171–84. PMID  12107413.
• Аурандт Дж., Викис Х.Г., Гуткинд Дж. С. и др. (2002). «Рецептор семафорина плексин-B1 передает сигналы посредством прямого взаимодействия с Rho-специфическим фактором обмена нуклеотидов, LARG». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (19): 12085–90. Дои:10.1073 / pnas.142433199. ЧВК  129402. PMID  12196628.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Хисата С., Сакисака Т., Баба Т. и др. (2007). «Rap1-PDZ-GEF1 взаимодействует с рецептором нейротрофина в поздних эндосомах, что приводит к устойчивой активации Rap1 и ERK и росту нейритов». J. Cell Biol. 178 (5): 843–60. Дои:10.1083 / jcb.200610073. ЧВК  2064548. PMID  17724123.