RASGRP1 - RASGRP1

RASGRP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4Л9М, 4L9U
Идентификаторы
Псевдонимы	RASGRP1, CALDAG-GEFI, CALDAG-GEFII, RASGRP, hRasGRP1, гуанил-высвобождающий белок 1 RAS, IMD64
Внешние идентификаторы	OMIM: 603962 MGI: 1314635 ГомолоГен: 4195 Генные карты: RASGRP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q14 Начинать 38,488,103 бп[1] Конец 38,565,575 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 E5 | 2 59,19 см Начинать 117,279,993 бп[2] Конец 117,343,001 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • активность гомодимеризации белков • связывание фосфатидилхолина • связывание ионов цинка • связывание фосфатидилсерина • связывание ионов металлов • связывание диацилглицерина • связывание липидов • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • цитоплазма • аппарат Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • гранула тучных клеток • Мембрана Гольджи • эндоплазматический ретикулум • цитозоль • клеточная мембрана • внутриклеточный Биологический процесс • дифференциация клеток • положительная регуляция фосфорилирования белков • положительная регуляция дифференцировки Т-клеток в тимусе • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция активности фосфолипазы C • положительная регуляция активности киназы MAP • положительная регуляция естественной дифференцировки клеток-киллеров • воспалительный ответ на антигенный раздражитель • транспорт везикул по микротрубочкам • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 активация активности GTPase • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • производство цитокинов • положительная регуляция передачи сигнала белка Ras • положительное регулирование активации естественных клеток-киллеров • положительное регулирование каскада JNK • локализация секреторной гранулы • Каскад MAPK • регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • положительное регулирование выработки колониестимулирующего фактора макрофагов гранулоцитов • олигомеризация белков • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • регуляция каскада ERK1 и ERK2 • положительное регулирование выработки фактора некроза опухоли • Передача сигнала Ras-белка • дегрануляция тучных клеток • регулирование каскада p38MAPK • положительное регулирование цитотоксичности, опосредованной естественными клетками-киллерами • преобразование сигнала • передача сигнала, опосредованная малой GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10125	19419
Ансамбль	ENSG00000172575	ENSMUSG00000027347
UniProt	O95267	Q9Z1S3
RefSeq (мРНК)	NM_001128602 NM_001306086 NM_005739	NM_011246
RefSeq (белок)	NP_001122074 NP_001293015 NP_005730	NP_035376
Расположение (UCSC)	Chr 15: 38,49 - 38,57 Мб	Chr 2: 117,28 - 117,34 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

РАС гуанил-высвобождающий белок 1 это белок что у людей кодируется RASGRP1 ген.^[5][6][7]

Функция

Гуаниловый нуклеотид-высвобождающий белок RAS (RASGRP) является членом семейства генов, характеризующихся наличием фактора обмена гуаниновых нуклеотидов надсемейства Ras (ГЭФ ) домен. Он действует как диацилглицерин (DAG ) -регулируемый фактор обмена нуклеотидов, специфически активирующий Ras посредством обмена связанными ВВП за GTP. Он активирует Каскад киназ Erk / MAP и регулирует Т-клетки и В-клетки развитие, гомеостаз и дифференциация.^[7]

Ген

Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы. Соответствующий крысиный ген rbc7, в котором отсутствует 5-элементный экзон, представляет собой усеченную с 5-ти и 3-х первичными усеченными версиями более крупного нормального транскрипта крысы, который кодирует предсказанный белок массой 90 кДа. Этот более короткий транскрипт не был обнаружен у людей.^[7]

Клиническое значение

В ноябре 2016 года 12-летний пациент был госпитализирован с повторными инфекциями. Ученые предположили, что причиной может быть генетическая проблема. Более конкретно, генетическая причина - это дефект гена RASGRP1, который делает его неактивным. .

RASGRP1 играет роль в функциях динеинов естественных клеток-киллеров. Поскольку динеины являются моторными белками, их функция заключается в циркуляции элементов внутри клеток. Лабораторные исследования доктора Оранджа установили функциональную связь между дефектами естественных клеток-киллеров и динеинами, что в сочетании с другими наблюдениями заставило врачей попробовать лекарство леналидоммид для лечения пациента. Препарат смог обратить вспять некоторые эффекты мутации RASGRP1.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172575 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027347 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ботторфф Д., Эбину Дж., Стоун Дж. К. (май 1999 г.). «RasGRP, активатор Ras: последовательности кДНК мыши и человека и положения в хромосомах». Геном мамм. 10 (4): 358–61. Дои:10.1007 / s003359901001. PMID  10087292.
6. Кавасаки Х., Спрингетт Дж. М., Токи С., Каналес Дж. Дж., Харлан П., Блуменштиель Дж. П., Чен Е. Дж., Бани И. А., Мочизуки Н., Ашбахер А., Мацуда М., Хаусман Д. Е., Грейбил А. М. (ноябрь 1998 г.). «Фактор обмена нуклеотидов Rap-гуанина, сильно обогащенный в базальных ганглиях». Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (22): 13278–83. Дои:10.1073 / пнас.95.22.13278. ЧВК  23782. PMID  9789079.
7. «Ген Entrez: RASGRP1 RAS, высвобождающий гуанил-белок 1 (регулируемый кальцием и DAG)».

дальнейшее чтение

• Dower NA, Stang SL, Bottorff DA, Ebinu JO, Dickie P, Ostergaard HJ, Stone JC (2000). «RasGRP необходим для дифференцировки тимоцитов мышей и передачи сигналов TCR». Иммунология природы. 1 (4): 317–21. Дои:10.1038/79766. PMID  11017103.
• Приатель Дж. Дж., Тех С. Дж., Дауэр Н. А., Стоун Дж. С. и др. (2002). «RasGRP1 преобразовывает сигналы TCR низкой степени, которые имеют решающее значение для развития, гомеостаза и дифференциации Т-клеток». Иммунитет. 17 (5): 617–27. Дои:10.1016 / S1074-7613 (02) 00451-X. PMID  12433368.
• Приатель Дж.Дж., Чен Х, Зеневич Л.А., Шен Х., Хардер К.В., Хорвиц М.С. и др. (2007). «Хронический иммунодефицит у мышей, лишенных RasGRP1, приводит к активации и истощению Т-лимфоцитов CD4». J. Immunol. 179 (4): 2143–52. Дои:10.4049 / jimmunol.179.4.2143. PMID  17675473.
• Приатель Дж. Дж., Чен Х, Дханджи С., Абрахам Н. и др. (2006). «RasGRP1 передает сигналы про-дифференцировки TCR, которые имеют решающее значение для развития Т-лимфоцитов CD4». J. Immunol. 177 (3): 1470–80. Дои:10.4049 / jimmunol.177.3.1470. PMID  16849453.
• Приатель Дж. Дж., Чен Х, Хуанг Ю. Х., Чоу М. Т., Зеневич Л. А., Кафлин Дж. Дж., Шен Х., Стоун Дж. К., Тан Р. и др. (2010). «RasGRP1 регулирует антиген-индуцированное программирование развития наивными CD8 Т-клетками». J. Immunol. 184 (2): 666–76. Дои:10.4049 / jimmunol.0803521. PMID  20007535.
• Эбину Дж.О., Ботторфф Д.А., Чан Е.Ю. и др. (1998). «RasGRP, белок, высвобождающий гуанил-нуклеотид Ras с кальций- и диацилглицерин-связывающими мотивами». Наука. 280 (5366): 1082–6. Дои:10.1126 / science.280.5366.1082. PMID  9582122.
• Топхэм МК, Прескотт С.М. (2001). «Диацилглицеринкиназа дзета регулирует активацию Ras с помощью нового механизма». J. Cell Biol. 152 (6): 1135–43. Дои:10.1083 / jcb.152.6.1135. ЧВК  2199204. PMID  11257115.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Бивона Т.Г., Перес де Кастро I, Ахерн И.М. и др. (2003). «Фосфолипаза Cgamma активирует Ras на аппарате Гольджи посредством RasGRP1». Природа. 424 (6949): 694–8. Дои:10.1038 / природа01806. PMID  12845332.
• Мадани С., Хичами А., Черкауи-Малки М. и др. (2004). «Диацилглицерины, содержащие жирные кислоты Омега 3 и Омега 6, связываются с RasGRP и модулируют активацию киназы MAP». J. Biol. Chem. 279 (2): 1176–83. Дои:10.1074 / jbc.M306252200. PMID  14583629.
• Клингер МБ, Гильбо Б., Гулдинг Р. Э., Кей Р. Дж. (2005). «Дерегулированная экспрессия RasGRP1 инициирует лимфомагенез тимуса независимо от Т-клеточных рецепторов». Онкоген. 24 (16): 2695–704. Дои:10.1038 / sj.onc.1208334. PMID  15829980.
• Лю Ю., Чжу М., Нишида К. и др. (2007). «Важная роль RasGRP1 в функции тучных клеток и IgE-опосредованной аллергической реакции». J. Exp. Med. 204 (1): 93–103. Дои:10.1084 / jem.20061598. ЧВК  2118421. PMID  17190838.
• Руз Дж. П., Молленауэр М., Хо М. и др. (2007). «Необычное взаимодействие двух типов активаторов Ras, RasGRP и SOS, обеспечивает чувствительную и надежную активацию Ras в лимфоцитах». Мол. Клетка. Биол. 27 (7): 2732–45. Дои:10.1128 / MCB.01882-06. ЧВК  1899892. PMID  17283063.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Пасвольский Р., Фейгельсон С.В., Килич С.С. и др. (2007). «Синдром LAD-III связан с дефектной экспрессией активатора Rap-1 CalDAG-GEFI в лимфоцитах, нейтрофилах и тромбоцитах». J. Exp. Med. 204 (7): 1571–82. Дои:10.1084 / jem.20070058. ЧВК  2118641. PMID  17576779.
• Коско К.А., Чериньоли Ф., Уильямс С. и др. (2007). «SKAP55 модулирует активацию пути Ras-Erk-AP1, индуцированную рецептором Т-клеточного антигена, путем связывания RasGRP1». Мол. Иммунол. 45 (2): 510–22. Дои:10.1016 / j.molimm.2007.05.024. PMID  17658605.
• Ясуда С., Стивенс Р.Л., Терада Т. и др. (2007). «Нарушение экспрессии Ras-гуанил-высвобождающего нуклеотид белка 1 в подгруппе пациентов с системной красной волчанкой». J. Immunol. 179 (7): 4890–900. Дои:10.4049 / jimmunol.179.7.4890. PMID  17878389.

внешняя ссылка

• RASGRP1 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• RASGRP1 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.