RBM39 - RBM39

RBM39
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2JRS, 2MHN, 4OO6, 4OZ0, 4OZ1, 4ЮД
Идентификаторы
Псевдонимы	RBM39, CAPER, CAPERalpha, FSAP59, HCC1, RNPC2, белок с РНК-связывающим мотивом 39
Внешние идентификаторы	OMIM: 604739 MGI: 2157953 ГомолоГен: 136465 Генные карты: RBM39
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.22 Начинать 35,701,347 бп[1] Конец 35,742,312 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 H1 Начинать 156,147,239 бп[2] Конец 156,180,238 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоскелет микротрубочек • ядро клетки • нуклеоплазма • центр организации микротрубочек • ядерное пятнышко • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • обработка мРНК • Обработка РНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • Сплайсинг РНК Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9584	170791
Ансамбль	ENSG00000131051	ENSMUSG00000027620
UniProt	Q14498 Q5QP23	Q8VH51
RefSeq (мРНК)	NM_001242599 NM_001242600 NM_004902 NM_184234 NM_184237 NM_184241 NM_184244 NM_001323422 NM_001323423 NM_001323424	NM_001291114 NM_001291115 NM_133242 NM_001362763 NM_001362764 NM_001362765 NM_001362766 NM_001362767 NM_001362768 NM_001362769
RefSeq (белок)	NP_001229528 NP_001229529 NP_001310351 NP_001310352 NP_001310353 NP_004893 NP_909122	NP_001278043 NP_001278044 NP_573505 NP_001349692 NP_001349693 NP_001349694 NP_001349695 NP_001349696 NP_001349697 NP_001349698
Расположение (UCSC)	Chr 20: 35,7 - 35,74 Мб	Chr 2: 156.15 - 156.18 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

РНК-связывающий белок 39 это белок что у людей кодируется RBM39 ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой связывающий РНК белок и возможный фактор сплайсинга. Кодируемый белок находится в ядре, где он колокализуется с ядерными сплайсосомными белками. Исследования мышиного белка с высоким сходством последовательностей с этим белком показывают, что этот белок может действовать как транскрипционный коактиватор для рецепторов JUN / AP-1 и эстрогена. Для этого гена наблюдались множественные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

RBM39 был показан взаимодействовать с Рецептор эстрогена альфа,^[7] Рецептор эстрогена бета^[7] и C-июн.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131051 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027620 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Имаи Х., Чан Е.К., Киёсава К., Фу XD, Тан Э.М. (декабрь 1993 г.). «Новый ядерный аутоантиген с мотивами факторов сплайсинга, идентифицированными с антителом от гепатоцеллюлярной карциномы». J Clin Invest. 92 (5): 2419–26. Дои:10.1172 / JCI116848. ЧВК  288425. PMID  8227358.
6. «Ген Entrez: белок 39 РНК-связывающего мотива RBM39».
7. Jung DJ, Na SY, Na DS, Lee JW (январь 2002 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика CAPER, нового коактиватора активации рецепторов белка-1 и эстрогена». J. Biol. Chem. 277 (2): 1229–34. Дои:10.1074 / jbc.M110417200. PMID  11704680.

дальнейшее чтение

• Юнг DJ, Na SY, Na DS, Ли JW (2002). «Молекулярное клонирование и характеристика CAPER, нового коактиватора активации рецепторов белка-1 и эстрогена». J. Biol. Chem. 277 (2): 1229–34. Дои:10.1074 / jbc.M110417200. PMID  11704680.
• Ленер Б., Семпл Д.И., Браун С.Е., Советник Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон С.М. (2004). «Анализ высокопроизводительной двугибридной дрожжевой системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID  14667819.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К., Онг С. Е., Лион CE, Ламонд А. И., Манн М. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Dowhan DH, Hong EP, Auboeuf D, Dennis AP, Wilson MM, Berget SM, O'Malley BW (2005). «Коактивация рецептора стероидного гормона и альтернативный сплайсинг РНК с помощью U2AF65-родственных белков CAPERalpha и CAPERbeta». Мол. Клетка. 17 (3): 429–39. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.12.025. PMID  15694343.
• Sun NN, Fastje CD, Wong SS, Sheppard PR, Macdonald SJ, Ridenour G, Hyde JD, Witten ML (2005). «Дозозависимые изменения транскриптома металлическими рудами на линии клеток острого лимфобластного лейкоза человека». Токсикология и промышленное здоровье. 19 (7–10): 157–63. Дои:10.1191 / 0748233703th185oa. PMID  15747776. S2CID  14394243.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.