RBM4 - RBM4

RBM4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DNQ
Идентификаторы
Псевдонимы	RBM4, LARK, RBM4A, ZCCHC21, ZCRB3A, РНК-связывающий мотив, белок 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 602571 MGI: 1100865 ГомолоГен: 82510 Генные карты: RBM4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.2 Начните 66,638,617 бп[1] Конец 66,668,374 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начните 4,784,293 бп[2] Конец 4,793,901 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • пре-мРНК интронное богатое пиримидином связывание • пре-мРНК интронное связывание • связывание miRNA • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • Связывание мРНК 3'-UTR • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты • связывание мРНК • связывание циклина Сотовый компонент • цитоплазма • ядерное пятнышко • нуклеоплазма • ядрышко • Гранула стресса • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • дифференциация клеток • регуляция ядерно-цитоплазматического транспорта • Обработка РНК • отрицательное регулирование перевода • негативная регуляция перевода в ответ на стресс • отрицательная регуляция инициации трансляции • положительное регулирование дифференцировки мышечных клеток • обработка мРНК • реакция на вещество, содержащее мышьяк • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы • cap-независимая инициация трансляции • циркадная регуляция трансляции • miRNA-опосредованное ингибирование трансляции • IRES-зависимая инициация трансляции линейной мРНК • Сплайсинг РНК • подавление гена с помощью РНК • увлечение циркадных часов фотопериодом • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5936	19653
Ансамбль	ENSG00000173933	ENSMUSG00000094936
UniProt	Q9BWF3	Q8C7Q4
RefSeq (мРНК)	NM_002896 NM_001198843 NM_001198844	NM_001290122 NM_001290123 NM_001290124 NM_001290125 NM_009032
RefSeq (белок)	NP_001185772 NP_001185773 NP_002887	NP_001277051 NP_001277052 NP_001277053 NP_001277054 NP_033058
Расположение (UCSC)	Chr 11: 66.64 - 66.67 Мб	Chr 19: 4.78 - 4.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

РНК-связывающий белок 4 это белок что у людей кодируется RBM4 ген.^[5][6][7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000173933 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000094936 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Джексон FR, Banfi S, Guffanti A, Rossi E (июль 1997 г.). «Новый содержащий цинковый палец РНК-связывающий белок, сохраненный от плодовых мух для людей». Геномика. 41 (3): 444–52. Дои:10.1006 / geno.1997.4704. PMID  9169144.
6. Lin JC, Tarn WY (ноябрь 2005 г.). «Отбор экзонов в мРНК альфа-тропомиозина регулируется антагонистическим действием RBM4 и PTB». Mol Cell Biol. 25 (22): 10111–21. Дои:10.1128 / MCB.25.22.10111-10121.2005. ЧВК  1280272. PMID  16260624.
7. «Ген Entrez: белок 4 РНК-связывающего мотива RBM4».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Бернерт Г., Фунтулакис М., Любец Г. (2003). «Многочисленное снижение уровня белка матрина 3, снижение моторного белка HMP и hlark в мозге плода с синдромом Дауна». Протеомика. 2 (12): 1752–7. Дои:10.1002 / 1615-9861 (200212) 2:12 <1752 :: AID-PROT1752> 3.0.CO; 2-Y. PMID  12469345.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Петерсен Х. Х., Хильперт Дж., Милитц Д. и др. (2003). «Функциональное взаимодействие мегалина с мегалинсвязывающим белком (MegBP), новой адаптерной молекулой, содержащей тетратрико-пептидный повтор». J. Cell Sci. 116 (Pt 3): 453–61. Дои:10.1242 / jcs.00243. PMID  12508107.
• Лай М.С., Куо Х.В., Чанг В.С., Тарн Вайоминг (2003). «Новый регулятор сплайсинга разделяет ядерный путь импорта с белками SR». EMBO J. 22 (6): 1359–69. Дои:10.1093 / emboj / cdg126. ЧВК  151058. PMID  12628928.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Diederichs S, Bäumer N, Ji P, et al. (2004). «Идентификация партнеров по взаимодействию и субстратов комплекса циклин A1-CDK2». J. Biol. Chem. 279 (32): 33727–41. Дои:10.1074 / jbc.M401708200. PMID  15159402.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Кар А., Хавлиоглу Н., Тарн В.Й., Ву Дж.Й. (2006). «RBM4 взаимодействует с интронным элементом и стимулирует включение экзона 10 тау». J. Biol. Chem. 281 (34): 24479–88. Дои:10.1074 / jbc.M603971200. ЧВК  2072872. PMID  16777844.
• Маркус М.А., Генрих Б., Райцкин О. и др. (2006). «WT1 взаимодействует с белком сплайсинга RBM4 и регулирует его способность модулировать альтернативный сплайсинг in vivo». Exp. Cell Res. 312 (17): 3379–88. Дои:10.1016 / j.yexcr.2006.07.008. PMID  16934801.
• Лин Дж. К., Сюй М., Тарн, Вайоминг (2007). «Клеточный стресс модулирует функцию сплайсинга регуляторного белка RBM4 в контроле трансляции». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (7): 2235–40. Дои:10.1073 / pnas.0611015104. ЧВК  1893002. PMID  17284590.