RC3H1 - RC3H1 - Wikipedia

RC3H1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3X1O, 4QIK, 4QIL, 4ULW, 4YWQ
Идентификаторы
Псевдонимы	RC3H1, RNF198, ROQUIN, безымянный палец и домены типа CCCH 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 609424 MGI: 2685397 ГомолоГен: 19036 Генные карты: RC3H1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q25.1 Начинать 173,931,084 бп[1] Конец 174,022,357 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 H2.1 Начинать 160,906,418 бп[2] Конец 160,974,978 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • связывание ионов металлов • связывание мРНК • Связывание стебель-петля РНК • Связывание мРНК 3'-UTR • Связывание РНК • связывание двухцепочечной РНК • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов цинка • трансферазная активность • связывание miRNA Сотовый компонент • цитоплазма • П-боди • Гранула стресса Биологический процесс • регулирование пролиферации Т-клеток • регуляция активации Т-клеток • В-клеточный гомеостаз • развитие селезенки • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • Гомеостаз Т-клеток • Пролиферация Т-клеток • регуляция экспрессии генов • развитие лимфатических узлов • Дифференцировка Т-фолликулярных клеток-помощников • отрицательная регуляция дифференцировки Т-хелперных клеток • регуляция стабильности мРНК • положительная регуляция катаболического процесса мРНК • регуляция образования зародышевого центра • посттранскрипционная регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция образования зародышевого центра • отрицательная регуляция пролиферации В-клеток • клеточный ответ на интерлейкин-1 • убиквитинирование белков • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, зависимый от деаденилирования распад • сборка тела цитоплазматической мРНК • регуляция сигнального пути Т-клеточного рецептора • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК • отрицательная регуляция пролиферации активированных Т-клеток • 3'-UTR-опосредованная дестабилизация мРНК • полиубиквитинирование белков • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток • отрицательная регуляция дифференцировки Т-хелперов 17 клеток • регуляция метаболического процесса miRNA Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	149041	381305
Ансамбль	ENSG00000135870	ENSMUSG00000040423
UniProt	Q5TC82	Q4VGL6
RefSeq (мРНК)	NM_001300850 NM_001300851 NM_001300852 NM_172071	NM_001024952
RefSeq (белок)	NP_001287779 NP_001287780 NP_001287781 NP_742068 NP_001287779.1	NP_001020123
Расположение (UCSC)	Chr 1: 173.93 - 174.02 Мб	Chr 1: 160.91 - 160.97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Безымянный палец и домены типа CCCH 1, также известный как Рокин-1, это белок что у человека кодируется RC3H1 ген.^[5]

Функция

Консенсусная первичная последовательность и вторичная структура для сайта связывания Roquin-1 (RC3H1) (также называемого элементом конститутивного распада (CDE)).

Этот ген кодирует белок, содержащий RING-тип и C3H1-тип. цинковый палец мотивы. Кодируемый белок распознает и связывается с элементом конститутивного распада (CDE) в 3 'UTR мРНК, что приводит к мРНК деаденилирование и деградация. Альтернативная сварка приводит к нескольким варианты расшифровки. [предоставлено RefSeq, июль 2014 г.].

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135870 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040423 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: безымянный палец и домены типа CCCH 1".

дальнейшее чтение

• Бертосси А., Айхингер М., Сансонетти П., Лех М., Нефф Ф., Пал М., Вундерлих Ф. Т., Андерс Х. Дж., Кляйн Л., Шмидт-Супприан М. (август 2011 г.). «Потеря Roquin вызывает преждевременную смерть и дерегуляцию иммунитета, но не аутоиммунитет». Журнал экспериментальной медицины. 208 (9): 1749–56. Дои:10.1084 / jem.20110578. ЧВК  3171092. PMID  21844204.
• Леппек К., Шотт Дж., Рейтер С., Поэтц Ф., Хаммонд М.С., Стоклин Дж. (Май 2013 г.). «Роквин способствует конститутивному распаду мРНК через консервативный класс мотивов распознавания стебель-петля». Клетка. 153 (4): 869–81. Дои:10.1016 / j.cell.2013.04.016. PMID  23663784.
• Heissmeyer V, Vogel KU (май 2013 г.). «Молекулярный контроль дифференцировки Tfh-клеток с помощью белков семейства Roquin». Иммунологические обзоры. 253 (1): 273–89. Дои:10.1111 / imr.12056. PMID  23550652.
• Чанг П.П., Ли С.К., Ху Х, Дэйви Дж., Дуан Дж., Чо Дж. Х., Карупиа Дж., Спрент Дж., Хит В. Р., Бертрам Е. М., Винуэса К. Г. (июль 2012 г.). «Нарушение репрессии мРНК IFN-γ приводит к накоплению самореактивных эффекторных CD8 + Т-клеток». Журнал иммунологии. 189 (2): 701–10. Дои:10.4049 / jimmunol.1102432. PMID  22685317.
• Атанасопулос В., Баркер А., Ю Д., Тан А. Х., Шривастава М., Контрерас Н., Ван Дж., Лам К. П., Браун С.Х., Гуднау С.К., Диксон Н.Э., Лидман П.Дж., Сент-Р., Винуеса К.Г. (май 2010 г.). «Семейство белков ROQUIN локализуется в стрессовых гранулах через домен ROQ и связывает целевые мРНК». Журнал FEBS. 277 (9): 2109–27. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2010.07628.x. PMID  20412057.
• Ю.Д., Тан А.Х., Ху Х, Атанасопулос В., Симпсон Н., Сильва Д.Г., Хатлофф А., Джайлс К.М., Лидман П.Дж., Лам К.П., Гуднау С.К., Винуэса К.Г. (ноябрь 2007 г.). «Роквин подавляет аутоиммунитет, ограничивая индуцибельную РНК-мессенджер костимулятора Т-клеток». Природа. 450 (7167): 299–303. Дои:10.1038 / природа06253. PMID  18172933.
• Pratama A, Ramiscal RR, Silva DG, Das SK, Athanasopoulos V, Fitch J, Botelho NK, Chang PP, Hu X, Hogan JJ, Maña P, Bernal D, Korner H, Yu D, Goodnow CC, Cook MC, Vinuesa CG (Апрель 2013). «Роквин-2 разделяет функции со своим паралогом Роквин-1 в репрессии мРНК, контролирующих Т-фолликулярные хелперные клетки и системное воспаление». Иммунитет. 38 (4): 669–80. Дои:10.1016 / j.immuni.2013.01.011. PMID  23583642.
• Vinuesa CG, Cook MC, Angelucci C, Athanasopoulos V, Rui L, Hill KM, Yu D, Domaschenz H, Whittle B., Lambe T., Roberts IS, Copley RR, Bell JI, Cornall RJ, Goodnow CC (май 2005 г.). «Член семейства убиквитинлигаз RING-типа, необходимый для репрессии фолликулярных хелперных Т-клеток и аутоиммунитета». Природа. 435 (7041): 452–8. Дои:10.1038 / природа03555. PMID  15917799.
• Линтерман М.А., Ригби Р.Дж., Вонг Р., Сильва Д., Уизерс Д., Андерсон Г., Верма Н.К., Бринк Р., Хатлофф А., Гуднау С.К., Винуэса К.Г. (февраль 2009 г.). «Роквин дифференцирует специализированные функции дублированных генов костимулирующих рецепторов Т-клеток CD28 и ICOS». Иммунитет. 30 (2): 228–41. Дои:10.1016 / j.immuni.2008.12.015. PMID  19217324.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.