RDH13 - RDH13 - Wikipedia

RDH13
Идентификаторы
Псевдонимы	RDH13, SDR7C3, ретинолдегидрогеназа 13 (полностью транс / 9-цис), ретинолдегидрогеназа 13
Внешние идентификаторы	MGI: 1918732 ГомолоГен: 121782 Генные карты: RDH13
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.42 Начинать 55,039,108 бп[1] Конец 55,071,291 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 A1 Начинать 4,424,770 бп[2] Конец 4,445,649 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • НАДФ-ретинолдегидрогеназная активность • оксидоредуктазная активность Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • митохондрия • мембрана Биологический процесс • реакция на высокую интенсивность света • формирование слоя сетчатки • развитие фоторецепторных клеток глаза • окислительно-восстановительный процесс • метаболический процесс ретинола • метаболический процесс сетчатки Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	112724	108841
Ансамбль	ENSG00000278284 ENSG00000274418 ENSG00000276341 ENSG00000275474 ENSG00000274504 ENSG00000273944 ENSG00000276684 ENSG00000278149 ENSG00000276826 ENSG00000160439	ENSMUSG00000008435
UniProt	Q8NBN7	Q8CEE7
RefSeq (мРНК)	NM_001145971 NM_138412	NM_001290409 NM_001290411 NM_175372
RefSeq (белок)	NP_001139443 NP_612421	NP_001277338 NP_001277340 NP_780581
Расположение (UCSC)	Chr 19: 55.04 - 55.07 Мб	Chr 7: 4.42 - 4.45 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ретинолдегидрогеназа 13 (все транс / 9-цис) это белок что у человека кодируется RDH13 ген. Этот ген кодирует митохондриальную короткоцепочечную дегидрогеназу / редуктазу, которая катализирует восстановление и окисление ретиноидов. Кодируемый фермент может действовать в производстве ретиноевой кислоты, а также может защищать митохондрии от окислительного стресса. Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов.^[5]

Ген

Ген RDH13 человека находится на 19-й хромосоме с его специфической локализацией 19q13.42. Всего ген содержит 12 экзонов.^[5]

Структура

Анализ субмитохондриальной локализации RDH13 указывает на его ассоциацию с внутренней митохондриальной мембраной. Первичная структура RDH13 содержит два гидрофобных сегмента, 2–21 и 242–261, которые достаточно длинные, чтобы служить трансмембранными сегментами; однако, как показано в настоящем исследовании, щелочная экстракция полностью удаляет белок с мембраны, что указывает на то, что RDH13 является белком периферической мембраны.^[6] Периферическая ассоциация RDH13 с мембраной дополнительно отличает этот белок от микросомальных ретинальдегидредуктаз, которые представляют собой интегральные мембранные белки, которые, по-видимому, закреплены в мембране через свои N-концевые гидрофобные сегменты.^[7]

Функция

RDH13 наиболее близок к NADP + -зависимым микросомальным ферментам RDH11, RDH12 и RDH14.^[8][9] Очищенный RDH13 действует на ретиноиды окислительно-восстановительным образом и в значительной степени предпочитает кофактор НАДФН над НАДН. Более того, RDH13 имеет гораздо более эффективную активность редуктазы, чем активность дегидрогеназы. RDH13 как ретинальдегидредуктаза значительно менее активен, чем родственный белок RDH11, в первую очередь из-за гораздо более высокого значения Km для ретинальдегида. Однако значение kcat RDH13 для снижения ретинальдегида. пахотный с таковым для RDH11, и значения Km двух ферментов для НАДФН также очень похожи. Таким образом, в соответствии со сходством своей последовательности с RDH11, RDH12 и RDH14, RDH13 действует как НАДФ + -зависимая ретинальдегидредуктаза.^[10]

RDH13 локализуется в митохондриях, что отличается от других членов этого семейства, поскольку они локализуются в эндоплазматическом ретикулуме. Точная последовательность, нацеленная на RDH13 в митохондрии, еще не установлена.

Клиническое значение

RDH13 является частью подсемейства четырех ретинолдегидрогеназ, RDH11, RDH12, RDH13 и RDH14, которые проявляют двойную субстратную специфичность, уникально метаболизируя все транс- и цис-ретинолы со специфичностью C (15) pro-R. Метаболиты, участвующие в этих реакциях, известны как ретиноиды, которые представляют собой хромофоры, участвующие в зрении, регуляции транскрипции и дифференцировке клеток. RDH11-14 может участвовать на первом этапе производства полностью транс- и 9-цис-ретиноевой кислоты во многих тканях. RDH11-14 заполняет пробел в нашем понимании 11-цис-ретинальных и полностью транс-ретинальных трансформаций в фоторецепторных и пигментных эпителиальных клетках сетчатки. Двойная субстратная специфичность этого подсемейства объясняет минорный фенотип, связанный с мутациями в 11-цис-ретинолдегидрогеназе (RDH5), вызывающими альбипунктное глазное дно у людей.^[9]

Рекомендации

1. ENSG00000274418, ENSG00000276341, ENSG00000275474, ENSG00000274504, ENSG00000273944, ENSG00000276684, ENSG00000278149, ENSG00000276826, ENSG00000160439 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000278284, ENSG00000274418, ENSG00000276341, ENSG00000275474, ENSG00000274504, ENSG00000273944, ENSG00000276684, ENSG00000278149, ENSG00000276826, ENSG00000160439 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000008435 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: ретинолдегидрогеназа 13 (все транс / 9-цис)».
6. Фуджики Ю., Хаббард А. Л., Фаулер С., Лазаров П. Б. (апрель 1982 г.). «Изоляция внутриклеточных мембран с помощью лечения карбонатом натрия: нанесение на эндоплазматический ретикулум». Журнал клеточной биологии. 93 (1): 97–102. Дои:10.1083 / jcb.93.1.97. ЧВК  2112113. PMID  7068762.
7. Беляева О.В., Коркина О.В., Стеценко А.В., Кедишвили Н.Ю. (янв 2008). «Человеческая ретинолдегидрогеназа 13 (RDH13) представляет собой митохондриальную короткоцепочечную дегидрогеназу / редуктазу с активностью ретинальдегидредуктазы». Журнал FEBS. 275 (1): 138–47. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2007.06184.x. ЧВК  2573044. PMID  18039331.
8. Кедишвили Н.Ю., Чумакова О.В., Четыркин С.В., Беляева О.В., Лапшина Е.А., Лин Д.В., Мацумура М., Нельсон П.С. (август 2002 г.). «Доказательства того, что человеческий ген короткоцепочечной дегидрогеназы / редуктазы простаты (PSDR1) кодирует новую ретинальную редуктазу (RalR1)». Журнал биологической химии. 277 (32): 28909–15. Дои:10.1074 / jbc.M202588200. PMID  12036956.
9. Haeseleer F, Jang GF, Imanishi Y, Driessen CA, Matsumura M, Nelson PS, Palczewski K (ноябрь 2002 г.). «Короткоцепочечные ретинолдегидрогеназы с двойной субстратной специфичностью из сетчатки позвоночных». Журнал биологической химии. 277 (47): 45537–46. Дои:10.1074 / jbc.M208882200. ЧВК  1435693. PMID  12226107.
10. Беляева О.В., Стеценко А.В., Нельсон П., Кедишвили Н.Ю. (декабрь 2003 г.). «Свойства короткоцепочечной дегидрогеназы / редуктазы RalR1: характеристика очищенного фермента, его ориентация в микросомальной мембране и распределение в тканях и клеточных линиях человека». Биохимия. 42 (50): 14838–45. Дои:10.1021 / bi035288u. PMID  14674758.

дальнейшее чтение

• Перссон Б., Каллберг И., Брей Дж. Э., Бруфорд Е., Деллапорта С. Л., Фавиа А. Д., Дуарте Р. Г., Йорнвалл Х., Кавана К. Л., Кедишвили Н., Кисиела М., Мазер Е., Минднич Р., Орчард С., Пеннинг TM, Торнтон Д. М., Адамски Дж. , Oppermann U (март 2009 г.). «Инициатива по номенклатуре SDR (короткоцепочечная дегидрогеназа / редуктаза и родственные ферменты)». Химико-биологические взаимодействия. 178 (1–3): 94–8. Дои:10.1016 / j.cbi.2008.10.040. ЧВК  2896744. PMID  19027726.
• Беляева О.В., Коркина О.В., Стеценко А.В., Кедишвили Н.Ю. (янв 2008). «Человеческая ретинолдегидрогеназа 13 (RDH13) представляет собой митохондриальную короткоцепочечную дегидрогеназу / редуктазу с активностью ретинальдегидредуктазы». Журнал FEBS. 275 (1): 138–47. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2007.06184.x. ЧВК  2573044. PMID  18039331.
• Алхая А.К., Янс Д.К., Николов М., Вукотич М., Литовченко О., Людвиг Ф., Шлибс В., Ридель Д., Урлауб Х., Якобс С., Декерс М. (январь 2012 г.). «MINOS1 является консервативным компонентом комплексов митофилина и необходим для митохондриальной функции и организации крист». Молекулярная биология клетки. 23 (2): 247–57. Дои:10.1091 / mbc.E11-09-0774. ЧВК  3258170. PMID  22114354.
• Haeseleer F, Jang GF, Imanishi Y, Driessen CA, Matsumura M, Nelson PS, Palczewski K (ноябрь 2002 г.). «Короткоцепочечные ретинолдегидрогеназы с двойной субстратной специфичностью из сетчатки позвоночных». Журнал биологической химии. 277 (47): 45537–46. Дои:10.1074 / jbc.M208882200. ЧВК  1435693. PMID  12226107.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.