RDH13 - RDH13 - Wikipedia

RDH13
Идентификаторы
ПсевдонимыRDH13, SDR7C3, ретинолдегидрогеназа 13 (полностью транс / 9-цис), ретинолдегидрогеназа 13
Внешние идентификаторыMGI: 1918732 ГомолоГен: 121782 Генные карты: RDH13
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение RDH13
Геномное расположение RDH13
Группа19q13.42Начинать55,039,108 бп[1]
Конец55,071,291 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001145971
NM_138412

NM_001290409
NM_001290411
NM_175372

RefSeq (белок)

NP_001139443
NP_612421

NP_001277338
NP_001277340
NP_780581

Расположение (UCSC)Chr 19: 55.04 - 55.07 МбChr 7: 4.42 - 4.45 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ретинолдегидрогеназа 13 (все транс / 9-цис) это белок что у человека кодируется RDH13 ген. Этот ген кодирует митохондриальную короткоцепочечную дегидрогеназу / редуктазу, которая катализирует восстановление и окисление ретиноидов. Кодируемый фермент может действовать в производстве ретиноевой кислоты, а также может защищать митохондрии от окислительного стресса. Описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов.[5]

Ген

Ген RDH13 человека находится на 19-й хромосоме с его специфической локализацией 19q13.42. Всего ген содержит 12 экзонов.[5]

Структура

Анализ субмитохондриальной локализации RDH13 указывает на его ассоциацию с внутренней митохондриальной мембраной. Первичная структура RDH13 содержит два гидрофобных сегмента, 2–21 и 242–261, которые достаточно длинные, чтобы служить трансмембранными сегментами; однако, как показано в настоящем исследовании, щелочная экстракция полностью удаляет белок с мембраны, что указывает на то, что RDH13 является белком периферической мембраны.[6] Периферическая ассоциация RDH13 с мембраной дополнительно отличает этот белок от микросомальных ретинальдегидредуктаз, которые представляют собой интегральные мембранные белки, которые, по-видимому, закреплены в мембране через свои N-концевые гидрофобные сегменты.[7]

Функция

RDH13 наиболее близок к NADP + -зависимым микросомальным ферментам RDH11, RDH12 и RDH14.[8][9] Очищенный RDH13 действует на ретиноиды окислительно-восстановительным образом и в значительной степени предпочитает кофактор НАДФН над НАДН. Более того, RDH13 имеет гораздо более эффективную активность редуктазы, чем активность дегидрогеназы. RDH13 как ретинальдегидредуктаза значительно менее активен, чем родственный белок RDH11, в первую очередь из-за гораздо более высокого значения Km для ретинальдегида. Однако значение kcat RDH13 для снижения ретинальдегида. пахотный с таковым для RDH11, и значения Km двух ферментов для НАДФН также очень похожи. Таким образом, в соответствии со сходством своей последовательности с RDH11, RDH12 и RDH14, RDH13 действует как НАДФ + -зависимая ретинальдегидредуктаза.[10]

RDH13 локализуется в митохондриях, что отличается от других членов этого семейства, поскольку они локализуются в эндоплазматическом ретикулуме. Точная последовательность, нацеленная на RDH13 в митохондрии, еще не установлена.

Клиническое значение

RDH13 является частью подсемейства четырех ретинолдегидрогеназ, RDH11, RDH12, RDH13 и RDH14, которые проявляют двойную субстратную специфичность, уникально метаболизируя все транс- и цис-ретинолы со специфичностью C (15) pro-R. Метаболиты, участвующие в этих реакциях, известны как ретиноиды, которые представляют собой хромофоры, участвующие в зрении, регуляции транскрипции и дифференцировке клеток. RDH11-14 может участвовать на первом этапе производства полностью транс- и 9-цис-ретиноевой кислоты во многих тканях. RDH11-14 заполняет пробел в нашем понимании 11-цис-ретинальных и полностью транс-ретинальных трансформаций в фоторецепторных и пигментных эпителиальных клетках сетчатки. Двойная субстратная специфичность этого подсемейства объясняет минорный фенотип, связанный с мутациями в 11-цис-ретинолдегидрогеназе (RDH5), вызывающими альбипунктное глазное дно у людей.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000274418, ENSG00000276341, ENSG00000275474, ENSG00000274504, ENSG00000273944, ENSG00000276684, ENSG00000278149, ENSG00000276826, ENSG00000160439 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000278284, ENSG00000274418, ENSG00000276341, ENSG00000275474, ENSG00000274504, ENSG00000273944, ENSG00000276684, ENSG00000278149, ENSG00000276826, ENSG00000160439 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000008435 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Ген Entrez: ретинолдегидрогеназа 13 (все транс / 9-цис)».
  6. ^ Фуджики Ю., Хаббард А. Л., Фаулер С., Лазаров П. Б. (апрель 1982 г.). «Изоляция внутриклеточных мембран с помощью лечения карбонатом натрия: нанесение на эндоплазматический ретикулум». Журнал клеточной биологии. 93 (1): 97–102. Дои:10.1083 / jcb.93.1.97. ЧВК  2112113. PMID  7068762.
  7. ^ Беляева О.В., Коркина О.В., Стеценко А.В., Кедишвили Н.Ю. (янв 2008). «Человеческая ретинолдегидрогеназа 13 (RDH13) представляет собой митохондриальную короткоцепочечную дегидрогеназу / редуктазу с активностью ретинальдегидредуктазы». Журнал FEBS. 275 (1): 138–47. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2007.06184.x. ЧВК  2573044. PMID  18039331.
  8. ^ Кедишвили Н.Ю., Чумакова О.В., Четыркин С.В., Беляева О.В., Лапшина Е.А., Лин Д.В., Мацумура М., Нельсон П.С. (август 2002 г.). «Доказательства того, что человеческий ген короткоцепочечной дегидрогеназы / редуктазы простаты (PSDR1) кодирует новую ретинальную редуктазу (RalR1)». Журнал биологической химии. 277 (32): 28909–15. Дои:10.1074 / jbc.M202588200. PMID  12036956.
  9. ^ а б Haeseleer F, Jang GF, Imanishi Y, Driessen CA, Matsumura M, Nelson PS, Palczewski K (ноябрь 2002 г.). «Короткоцепочечные ретинолдегидрогеназы с двойной субстратной специфичностью из сетчатки позвоночных». Журнал биологической химии. 277 (47): 45537–46. Дои:10.1074 / jbc.M208882200. ЧВК  1435693. PMID  12226107.
  10. ^ Беляева О.В., Стеценко А.В., Нельсон П., Кедишвили Н.Ю. (декабрь 2003 г.). «Свойства короткоцепочечной дегидрогеназы / редуктазы RalR1: характеристика очищенного фермента, его ориентация в микросомальной мембране и распределение в тканях и клеточных линиях человека». Биохимия. 42 (50): 14838–45. Дои:10.1021 / bi035288u. PMID  14674758.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.