REXO2 - REXO2 - Wikipedia

REXO2
Идентификаторы
Псевдонимы	REXO2, REX2, RFN, SFN, CGI-114, экзонуклеаза 2 РНК
Внешние идентификаторы	OMIM: 607149 MGI: 1888981 ГомолоГен: 6447 Генные карты: REXO2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q23.2 Начинать 114,439,386 бп[1] Конец 114,450,279 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A5.3 Начинать 48,468,512 бп[2] Конец 48,480,623 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • нуклеазная активность • экзонуклеазная активность • гидролазная активность • 3'-5 'экзонуклеазная активность • связывание нуклеиновой кислоты • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • митохондриальный матрикс • митохондриальное межмембранное пространство • ядрышко • ядро клетки • очаговая адгезия • митохондрия Биологический процесс • метаболический процесс соединения, содержащего азотистые основания • процесс нуклеотидного обмена • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	25996	104444
Ансамбль	ENSG00000076043	ENSMUSG00000032026
UniProt	Q9Y3B8	Q9D8S4
RefSeq (мРНК)	NM_015523	NM_024233 NM_001357501 NM_001357503 NM_001357505
RefSeq (белок)	NP_056338	NP_077195 NP_001344430 NP_001344432 NP_001344434
Расположение (UCSC)	Chr 11: 114.44 - 114.45 Мб	Chr 9: 48.47 - 48.48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

REX2, гомолог экзонуклеазы 2 РНК (S. cerevisiae), также известный как REXO2, является фермент который у человека кодируется REXO2 ген.^[5][6][7]

Функция

Нуклеазы являются компонентами метаболизма ДНК и РНК, которые выполняют функции восстановления, репликации и рекомбинации ДНК, а также процессинга и деградации РНК. SFN является гомологом Orn, От 3 простых до 5 простых экзорибонуклеаза из Кишечная палочка который атакует свободную 3-первичную гидроксильную группу на одноцепочечной РНК, высвобождая 5-первичную моно-нуклеотиды последовательно.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000076043 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032026 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: REXO2 REX2, гомолог экзонуклеазы 2 РНК (S. cerevisiae)».
6. Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (май 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
7. Нгуен Л. Х., Эрцбергер Дж. П., Рут Дж., Уилсон Д. М. (август 2000 г.). «Человеческий гомолог Escherichia coli Orn расщепляет малые одноцепочечные РНК и олигомеры ДНК». J. Biol. Chem. 275 (34): 25900–6. Дои:10.1074 / jbc.M002672200. PMID  10851236.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY и др. (2000). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Нгуен Л. Х., Эрцбергер Дж. П., Рут Дж., Уилсон Д. М. (2000). «Человеческий гомолог Escherichia coli Orn расщепляет малые одноцепочечные РНК и олигомеры ДНК». J. Biol. Chem. 275 (34): 25900–6. Дои:10.1074 / jbc.M002672200. PMID  10851236.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ито С., Кита К., Чжай Л. и др. (2006). «Участие нуклеазы малых фрагментов человека в устойчивости человеческих клеток к УФ-С-индуцированной гибели клеток». Photochem. Фотобиол. 80 (2): 281–5. Дои:10.1562 / 2004-01-21-RA-051. PMID  15362935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.