RFC3 - RFC3

RFC3
Идентификаторы
Псевдонимы	RFC3, RFC38, субъединица 3 фактора репликации C
Внешние идентификаторы	OMIM: 600405 MGI: 1916513 ГомолоГен: 2188 Генные карты: RFC3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q13.2 Начните 33,818,069 бп[1] Конец 33,966,558 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G3 Начните 151,642,756 бп[2] Конец 151,651,242 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0043142 активность одноцепочечной ДНК-геликазы • АТФазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание ДНК • Активность загрузчика зажимов ДНК Сотовый компонент • Ctf18 RFC-подобный комплекс • нуклеоплазма • Комплекс фактора репликации ДНК С • ядро клетки Биологический процесс • Ответ на повреждение ДНК, обнаружение повреждения ДНК • эксцизионная репарация нуклеотидов, заполнение пробелов в ДНК • Синтез ДНК, участвующий в репарации ДНК • безошибочный транслезионный синтез • Удлинение цепи ДНК, участвующее в репликации ДНК • склонный к ошибкам транслезионный синтез • положительная регуляция ДНК-направленной активности ДНК-полимеразы • ответ на фосфорорганический • транслезионный синтез • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК • Репликация ДНК • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-очаг поражения • поддержание теломер посредством полуконсервативной репликации • ДНК-зависимая репликация ДНК • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5983	69263
Ансамбль	ENSG00000133119	ENSMUSG00000033970
UniProt	P40938	Q8R323
RefSeq (мРНК)	NM_002915 NM_181558	NM_027009
RefSeq (белок)	NP_002906 NP_853536	NP_081285
Расположение (UCSC)	Chr 13: 33,82 - 33,97 Мб	Chr 5: 151.64 - 151.65 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 3 фактора репликации C это белок что у людей кодируется RFC3 ген.^[5][6]

Функция

Удлинение грунтованный Шаблоны ДНК от ДНК-полимераза дельта и ДНК-полимераза эпсилон требует дополнительных белков ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) и фактор репликации C (RFC). RFC, также называемый активатором 1, представляет собой белковый комплекс, состоящий из пяти отдельных субъединиц 140, 40, 38, 37 и 36 кДа. Этот ген кодирует субъединицу 38 кДа. Эта субъединица важна для взаимодействия между субъединицей 140 кДа и основным комплексом, который состоит из субъединиц 36, 37 и 40 кДа. Альтернативно сращивание Были описаны варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.^[6]

Взаимодействия

RFC3 был показан взаимодействовать с участием:

• BRD4,^[7]
• CHTF18,^[8][9]
• PCNA,^[9][10]
• RFC1,^[11][12][13] и
• RFC4.^[11][12]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133119 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033970 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Окумура К., Ногами М., Тагучи Х., Дин Ф. Б., Чен М., Пан З. К., Гурвиц Дж., Ширатори А., Мураками Ю., Одзава К. (январь 1995 г.). «Присвоение генов субъединиц 36,5 кД (RFC5), 37 кД (RFC4), 38 кД (RFC3) и 40 кДа (RFC2) человеческого фактора репликации C полосам хромосом 12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13 и 7q11.23 ". Геномика. 25 (1): 274–8. Дои:10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID  7774928.
6. «Ген Entrez: фактор репликации RFC3 C (активатор 1) 3, 38 кДа».
7. Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6509–20. Дои:10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002. ЧВК  135621. PMID  12192049.
8. Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10237–42. Дои:10.1073 / pnas.1434308100. ЧВК  193545. PMID  12930902.
9. Меркл С.Дж., Карниц Л.М., Генри-Санчес Д.Т., Чен Дж. (Август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид». Журнал биологической химии. 278 (32): 30051–6. Дои:10.1074 / jbc.M211591200. PMID  12766176.
10. Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID  12171929.
11. Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой АТФазной активностью». Журнал биологической химии. 273 (10): 5979–87. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID  9488738.
12. Ульманн Ф., Цай Дж., Флорес-Розас Х., Дин Ф. Б., Финкельштейн Дж., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июнь 1996 г.). «Восстановление человеческого фактора репликации C из пяти субъединиц in vitro». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (13): 6521–6. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6521. ЧВК  39056. PMID  8692848.
13. Томида Дж, Масуда Й, Хироаки Х, Исикава Т, Сон I, Цуримото Т, Татейши С., Шиоми Т, Камей Й, Ким Дж, Камия К., Вазири С., Омори Х, Тодо Т (апрель 2008 г.). «Убиквитилирование субъединицы RFC2 комплекса фактора репликации С, вызванное повреждением ДНК». Журнал биологической химии. 283 (14): 9071–9. Дои:10.1074 / jbc.M709835200. ЧВК  2431014. PMID  18245774.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• О'Доннелл М., Онраст Р., Дин Ф. Б., Чен М., Гурвиц Дж. (Январь 1993 г.). «Гомология дополнительных белков репликативных полимераз - E. coli для человека». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (1): 1–3. Дои:10.1093 / nar / 21.1.1. ЧВК  309057. PMID  8441605.
• Ульманн Ф., Цай Дж., Флорес-Розас Х., Дин Ф. Б., Финкельштейн Дж., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июнь 1996 г.). «Восстановление человеческого фактора репликации C из пяти субъединиц in vitro». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (13): 6521–6. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6521. ЧВК  39056. PMID  8692848.
• Ульманн Ф., Цай Дж., Гиббс Э., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Апрель 1997 г.). «Делеционный анализ большой субъединицы p140 в человеческом факторе репликации C выявил области, необходимые для комплексообразования и репликационной активности». Журнал биологической химии. 272 (15): 10058–64. Дои:10.1074 / jbc.272.15.10058. PMID  9092549.
• Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (апрель 1997 г.). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с холоферментом РНК-полимеразы II». Молекулярная и клеточная биология. 17 (4): 1817–23. Дои:10.1128 / MCB.17.4.1817. ЧВК  232028. PMID  9121429.
• Цай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц фактора репликации C p40, p37 и p36 человека, является ДНК-зависимой АТФазой и промежуточным звеном в сборке холофермента». Журнал биологической химии. 272 (30): 18974–81. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18974. PMID  9228079.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Эллисон В., Стиллман Б. (март 1998 г.). «Восстановление рекомбинантного человеческого фактора репликации C (RFC) и идентификация субкомплекса RFC, обладающего ДНК-зависимой АТФазной активностью». Журнал биологической химии. 273 (10): 5979–87. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID  9488738.
• Чжан Г., Гиббс Э., Кельман З., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (Март 1999 г.). «Исследования взаимодействий между фактором репликации С человека и ядерным антигеном пролиферирующих клеток человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (5): 1869–74. Дои:10.1073 / pnas.96.5.1869. ЧВК  26703. PMID  10051561.
• Рауэн М., Буртелоу М.А., Дюфолт В.М., Карниц Л.М. (сентябрь 2000 г.). «Белок контрольной точки человека hRad17 взаимодействует с PCNA-подобными белками hRad1, hHus1 и hRad9». Журнал биологической химии. 275 (38): 29767–71. Дои:10.1074 / jbc.M005782200. PMID  10884395.
• Линдси-Больц Л.А., Бермудес В.П., Гурвиц Дж., Санкар А. (сентябрь 2001 г.). «Очистка и характеристика радиокомплексов контрольной точки повреждения ДНК человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (20): 11236–41. Дои:10.1073 / pnas.201373498. ЧВК  58713. PMID  11572977.
• Гриффит Дж. Д., Линдси-Больц Л. А., Санкар А. (май 2002 г.). «Структуры человеческого Rad17-фактора репликации C и контрольных точек Rad 9-1-1, визуализированные с помощью глицеринового спрея / микроскопии низкого напряжения». Журнал биологической химии. 277 (18): 15233–6. Дои:10.1074 / jbc.C200129200. PMID  11907025.
• Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID  12171929.
• Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Шортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Белок бромодомена млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Молекулярная и клеточная биология. 22 (18): 6509–20. Дои:10.1128 / MCB.22.18.6509-6520.2002. ЧВК  135621. PMID  12192049.
• Меркл С.Дж., Карниц Л.М., Генри-Санчес Д.Т., Чен Дж. (Август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении когезии сестринских хроматид». Журнал биологической химии. 278 (32): 30051–6. Дои:10.1074 / jbc.M211591200. PMID  12766176.
• Бермудес В.П., Манива Ю., Таппин И., Озато К., Йокомори К., Гурвиц Дж. (Сентябрь 2003 г.). «Альтернативный комплекс Ctf18-Dcc1-Ctf8-фактор репликации C, необходимый для когезии сестринских хроматид, загружает ядерный антиген пролиферирующих клеток на ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10237–42. Дои:10.1073 / pnas.1434308100. ЧВК  193545. PMID  12930902.
• Цзоу Л., Лю Д., Элледж С.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Репликационный белок А-опосредованный рекрутинг и активация комплексов Rad17». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (24): 13827–32. Дои:10.1073 / pnas.2336100100. ЧВК  283506. PMID  14605214.