RGPD5 - RGPD5

RGPD5
Идентификаторы
Псевдонимы	RGPD5, BS-63, BS63, HEL161, RGP5, RANBP2-подобный и GRIP-домен, содержащий 5, RANBP2-подобный и GRIP-домен, содержащий 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 612708 MGI: 894323 ГомолоГен: 87808 Генные карты: RGPD5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2к13 Начинать 109,792,758 бп[1] Конец 109,857,705 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 B4 | 10 29,34 см Начинать 58,446,920 бп[2] Конец 58,494,356 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • Ran связывание GTPase Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • ядерная пора • центросома Биологический процесс • внутриклеточный транспорт • Импорт NLS-несущего белка в ядро • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84220	19386
Ансамбль	ENSG00000015568	ENSMUSG00000003226
UniProt	Q99666	Q9ERU9
RefSeq (мРНК)	NM_005054 NM_032260	NM_011240
RefSeq (белок)	NP_005045 NP_115636	NP_035370
Расположение (UCSC)	Chr 2: 109,79 - 109,86 Мб	Chr 10: 58.45 - 58.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

RANBP2-подобный белок 5, содержащий домен GRIP это белок что у людей кодируется RGPD5 ген.^[5][6][7]

RAN - это небольшой GTP-связывающий белок суперсемейства RAS, который связан с ядерной мембраной и, как полагают, контролирует множество клеточных функций посредством взаимодействия с другими белками. Этот ген имеет высокую степень идентичности последовательности с RANBP2, большим RAN-связывающим белком, локализованным на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор. Полагают, что этот член семейства гена RANBP2 возник в результате события дупликации на 3 мб дистальнее RANBP2. Для этого локуса наблюдался альтернативный сплайсинг, и описаны два варианта. Предлагается дополнительный сплайсинг, но полная последовательность для дальнейших транскриптов не определена.^[7]

Взаимодействия

RGPD5 был показан взаимодействовать с Транспорт в 1.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000015568 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000003226 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ciccarelli FD, фон Меринг C, Suyama M, Harrington ED, Izaurralde E, Bork P (март 2005 г.). «Сложные геномные перестройки приводят к новой функции генов приматов». Геномные исследования. 15 (3): 343–51. Дои:10.1101 / гр.3266405. ЧВК  551560. PMID  15710750.
6. Хиллер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С., Фултон Л.А., Пепин К.Х., Минкс П. и др. (Апрель 2005 г.). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005Натура.434..724H. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
7. «Ген Entrez: RGPD5 RANBP2-подобный и домен GRIP, содержащий 5».
8. Цай И, Мяо С.Ю., Ван Л.Ф. (октябрь 2001 г.). «[Определение сайта связывания семенников-специфического нуклеопорина BS-63 с транспортином (кароферин бета 2) и доказательство их комбинации in vitro]». Чжунго И Сюэ Кэ Сюэ Юань Сюэ Бао. Acta Academiae Medicinae Sinicae. 23 (5): 462–6. PMID  12905863.

дальнейшее чтение

• Цай И, Мяо С.Ю., Ван Л.Ф. (октябрь 2001 г.). «[Определение сайта связывания семенников-специфического нуклеопорина BS-63 с транспортином (кароферин бета 2) и доказательство их комбинации in vitro]». Чжунго И Сюэ Кэ Сюэ Юань Сюэ Бао. Acta Academiae Medicinae Sinicae. 23 (5): 462–6. PMID  12905863.
• Цай И, Гао И, Шэн Ц., Мяо С., Цуй Х, Ван Л., Цзун С., Коидэ С.С. (январь 2002 г.). «Характеристика и потенциальная функция нового семенников-специфического нуклеопорина BS-63». Молекулярное воспроизводство и развитие. 61 (1): 126–34. Дои:10.1002 / мрд.1139. PMID  11774384. S2CID  23631919.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Ван Л.Ф., Чжу HD, Мяо С.Ю., Цао Д.Ф., Ву Ю.В., Цзун С.Д., Коидэ СС (1999). «Молекулярное клонирование и характеристика нового ген-специфического нуклеопорина, специфичного для семенников». Архив андрологии. 42 (2): 71–84. Дои:10.1080/014850199262904. PMID  10101573.
• Нотванг Х.Г., Ренсинг С., Кюблер М., Дених Д., Брандл Б., Стубанус М., Хааф Т., Курнит Д., Хильдебрандт Ф. (февраль 1998 г.). «Идентификация нового гена, родственного Ran-связывающему белку 2 (RANBP2L1), и обнаружение кластера генов на хромосоме 2q11-q12 человека». Геномика. 47 (3): 383–92. Дои:10.1006 / geno.1997.5119. PMID  9480752.