RILP (ген) - RILP (gene)

RILP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1YHN
Идентификаторы
Псевдонимы	RILP, PP10141, Rab взаимодействующий лизосомальный белок
Внешние идентификаторы	OMIM: 607848 MGI: 2144271 ГомолоГен: 19596 Генные карты: RILP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p13.3 Начните 1,646,145 бп[1] Конец 1,649,866 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B5 Начните 75,510,094 бп[2] Конец 75,513,168 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание Rab GTPase • связывание легкой промежуточной цепи динеина • GO: 0001948 связывание с белками • небольшое связывание GTPase • активность димеризации белков Сотовый компонент • эндосома • поздняя эндосома • мембрана фагоцитарных везикул • мембрана • мембрана поздней эндосомы • лизосомальная мембрана • лизосома • цитоплазматический пузырек • цитозоль • цилиарное базальное тело • макромолекулярный комплекс • цитоплазма Биологический процесс • положительная регуляция белкового катаболического процесса • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • транспорт эндосом через мультивезикулярный путь сортировки тел • отрицательная регуляция катаболического процесса белков • транспорт от эндосомы к лизосомам • транспорт от ранней эндосомы к поздней • образование внутрипросветных пузырьков • регулирование мультивезикулярных размеров тела • транспорт белка • морфогенез ресничек Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	83547	280408
Ансамбль	ENSG00000274145 ENSG00000167705	ENSMUSG00000038195
UniProt	Q96NA2	Q5ND29
RefSeq (мРНК)	NM_031430	NM_001029938
RefSeq (белок)	NP_113618	NP_001025109
Расположение (UCSC)	Chr 17: 1.65 - 1.65 Мб	Chr 11: 75,51 - 75,51 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Rab-взаимодействующий лизосомальный белок это белок что у людей кодируется RILP ген.^[5][6]

Функция

RILP, наряду с GTPase RAB7 (MIM 602298), контролирует поздний эндоцитозный транспорт. [Поставляется OMIM]^[6]

Взаимодействия

Было показано, что RILP (ген) взаимодействовать с RAB7A.^[5][7]

использованная литература

1. ENSG00000167705 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000274145, ENSG00000167705 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038195 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Канталупо Г., Алифано П., Роберти В., Бруни С.Б., Буччи С. (февраль 2001 г.). «Rab-взаимодействующий лизосомный белок (RILP): эффектор Rab7, необходимый для транспорта в лизосомы». EMBO J. 20 (4): 683–93. Дои:10.1093 / emboj / 20.4.683. ЧВК  145419. PMID  11179213.
6. «Ген Entrez: лизосомный белок, взаимодействующий с RILP Rab».
7. Каплан С., Хартнелл Л. М., Агилар Р. К., Наславский Н., Бонифачино Дж. С. (июль 2001 г.). «Человеческий Vam6p способствует кластеризации и слиянию лизосом in vivo». J. Cell Biol. 154 (1): 109–22. Дои:10.1083 / jcb.200102142. ЧВК  2196876. PMID  11448994.

дальнейшее чтение

• Буччи К., Де Грегорио Л., Бруни С.Б. (2001). «Анализ экспрессии и хромосомное определение генов PRA1 и RILP». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 286 (4): 815–9. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5466. PMID  11520070.
• Jordens I, Fernandez-Borja M, Marsman M, Dusseljee S, Janssen L, Calafat J, Janssen H, Wubbolts R, Neefjes J (2002). «Эффекторный белок Rab7 RILP контролирует лизосомный транспорт, индуцируя рекрутирование динеин-динактиновых моторов». Curr. Биол. 11 (21): 1680–5. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00531-0. PMID  11696325. S2CID  14642826.
• Ван Т, Хун В (2003). «Межорганелларная регуляция позиционирования лизосом с помощью аппарата Гольджи через взаимодействие Rab34 с Rab-взаимодействующим лизосомным белком». Мол. Биол. Ячейка. 13 (12): 4317–32. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0280. ЧВК  138636. PMID  12475955.
• Cardoso C, Leventer RJ, Ward HL, Toyo-Oka K, Chung J, Gross A, Martin CL, Allanson J, Pilz DT, Olney AH, Mutchinick OM, Hirotsune S, Wynshaw-Boris A, Dobyns WB, Ledbetter DH (2003 г. ). «Уточнение критической области размером 400 т.п.н. позволяет проводить генотипическую дифференциацию между изолированной лизэнцефалией, синдромом Миллера-Дикера и другими фенотипами, вторичными по отношению к делециям 17p13.3». Am. J. Hum. Genet. 72 (4): 918–30. Дои:10.1086/374320. ЧВК  1180354. PMID  12621583.
• Харрисон Р. Э., Буччи С., Виейра О. В., Шроер Т. А., Гринштейн С. (2003). «Фагосомы сливаются с поздними эндосомами и / или лизосомами за счет расширения мембранных выступов вдоль микротрубочек: роль Rab7 и RILP». Мол. Cell. Биол. 23 (18): 6494–506. Дои:10.1128 / MCB.23.18.6494-6506.2003. ЧВК  193691. PMID  12944476.
• Ван Т., Вонг К.К., Хонг В. (2004). «Уникальный участок RILP отличает его от родственных ему белков в регуляции морфологии лизосом и взаимодействии с Rab7 и Rab34». Мол. Биол. Ячейка. 15 (2): 815–26. Дои:10.1091 / mbc.E03-06-0413. ЧВК  329395. PMID  14668488.
• Ван Д, Гун И, Цинь В, Чжан П, Ли Дж, Вэй Л, Чжоу Х, Ли Х, Цю Х, Чжун Ф, Хэ Л, Ю Дж, Яо Г, Цзян Х, Цянь Л, Ю Й, Шу Х , Чен Х, Сюй Х, Го М, Пан З, Чен И, Ге С, Ян С., Гу Дж (2004). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (44): 15724–9. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.
• Ву М, Ван Т, Ло Э, Хонг В, Сон Х (2005). «Структурная основа рекрутирования RILP малой GTPase Rab7». EMBO J. 24 (8): 1491–501. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600643. ЧВК  1142575. PMID  15933719.
• Колуччи AM, Campana MC, Bellopede M, Bucci C (2005). «Лизосомный белок, взаимодействующий с Rab, эффектор Rab7 и Rab34, способен к самовзаимодействию». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 334 (1): 128–33. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.06.067. PMID  15996637.
• Симоджо М., Херш Л. Б. (2006). «Характеристика белка LIM, взаимодействующего с REST / NRSF (RILP): локализация и взаимодействие с REST / NRSF». J. Neurochem. 96 (4): 1130–8. Дои:10.1111 / j.1471-4159.2005.03608.x. PMID  16417580. S2CID  6893975.
• Marsman M, Jordens I, Rocha N, Kuijl C, Janssen L, Neefjes J (2006). «Вариант сплайсинга RILP индуцирует кластеризацию лизосом независимо от набора динеина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 344 (3): 747–56. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.03.178. PMID  16631113.
• Progida C, Spinosa MR, De Luca A, Bucci C (2006). «RILP взаимодействует с компонентом VPS22 комплекса ESCRT-II». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 347 (4): 1074–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.07.007. PMID  16857164.