РИПК4 - RIPK4

РИПК4
Идентификаторы
Псевдонимы	РИПК4, ANKK2, ANKRD3, DIK, NKRD3, PKK, PPS2, RIP4, рецептор-взаимодействующая серин / треониновая киназа 4, CHANDS
Внешние идентификаторы	OMIM: 605706 MGI: 1919638 ГомолоГен: 10772 Генные карты: РИПК4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q22.3 Начинать 41,739,369 бп[1] Конец 41,767,089 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 C4 Начинать 97,741,933 бп[2] Конец 97,763,787 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность протеин-серин / треонинкиназы • Связывание АТФ • киназная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • трансферазная активность • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • мембрана • цитоплазма Биологический процесс • фосфорилирование белков • морфогенез эпителия • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • фосфорилирование Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	54101	72388
Ансамбль	ENSG00000183421	ENSMUSG00000005251
UniProt	P57078	Q9ERK0
RefSeq (мРНК)	NM_020639	NM_023663
RefSeq (белок)	н / д	NP_076152
Расположение (UCSC)	Chr 21: 41.74 - 41.77 Мб	Chr 16: 97.74 - 97.76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор-взаимодействующая серин / треонин-протеинкиназа 4 является фермент что у людей кодируется РИПК4 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой серин / треониновую протеинкиназу, которая взаимодействует с протеинкиназой C-дельта. Кодируемый белок также может активировать NFkappaB и необходим для дифференцировки кератиноцитов. Эта киназа подвергается аутофосфорилированию.^[6]

Взаимодействия

RIPK4 был показан взаимодействовать с PRKCB1.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183421 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005251 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д., Ватанабэ Х., Яда Т., Парк Х.С., Тойода А., Исии К., Тотоки Ю., Чой Д.К., Гронер И., Соеда Э, Оки М., Такаги Т., Сакаки Ю., Таудиен С., Блехшмидт К. , Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser J, Бек А., Клагес С., Хенниг С., Риссельманн Л., Даганд Е., Хааф Т., Вермейер С., Борзим К., Гардинер К., Низетич Д., Фрэнсис Ф., Лехрах Х., Рейнхард Р., Яспо М.Л. (июнь 2000 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека». Природа. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Натура.405..311H. Дои:10.1038/35012518. PMID  10830953.
6. «Ген Entrez: серин-треонинкиназа 4, взаимодействующая с рецептором RIPK4».
7. Чен, L; Haider K; Понда М; Cariappa A; Rowitch D; Pillai S (июнь 2001 г.). «Связанная с протеинкиназой С киназа (PKK), новая мембраносвязанная протеинкиназа, содержащая анкириновые повторы». J. Biol. Chem. 276 (24): 21737–44. Дои:10.1074 / jbc.M008069200. ISSN  0021-9258. PMID  11278382.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Bhr C, Rohwer A, Stempka L и др. (2000). «DIK, новая протеинкиназа, которая взаимодействует с протеинкиназой Cdelta. Клонирование, характеристика и анализ генов». J. Biol. Chem. 275 (46): 36350–7. Дои:10.1074 / jbc.M004771200. PMID  10948194.
• Чен Л., Хайдер К., Понда М. и др. (2001). «Протеинкиназа C-ассоциированная киназа (PKK), новая мембранно-ассоциированная протеинкиназа, содержащая анкириновые повторы». J. Biol. Chem. 276 (24): 21737–44. Дои:10.1074 / jbc.M008069200. PMID  11278382.
• Мейлан Э., Мартинон Ф., Том М. и др. (2003). «RIP4 (DIK / PKK), новый член семейства киназ RIP, активирует NF-κB и обрабатывается во время апоптоза». EMBO Rep. 3 (12): 1201–8. Дои:10.1093 / embo-reports / kvf236. ЧВК  1308326. PMID  12446564.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Моран С.Т., Хайдер К., Ой Й. и др. (2003). «Киназа, связанная с протеинкиназой С, может активировать NFkappaB как киназозависимым, так и киназно-независимым образом». J. Biol. Chem. 278 (24): 21526–33. Дои:10.1074 / jbc.M301575200. PMID  12676934.
• Scanlan MJ, Gout I, Gordon CM, et al. (2003). «Гуморальный иммунитет к раку груди человека: определение антигена и количественный анализ экспрессии мРНК». Иммунный против рака. 1: 4. PMID  12747765.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Адамс С., Панков С., Вернер С., Мунц Б. (2007). «Регулирование активности NF-kappaB и дифференцировки кератиноцитов с помощью белка RIP4: значение для заживления кожных ран». J. Invest. Дерматол. 127 (3): 538–44. Дои:10.1038 / sj.jid.5700588. PMID  17039240.

внешняя ссылка

• РИПК4 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• РИПК4 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.