RNF216 - RNF216

RNF216
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF216, CAHH, TRIAD3, U7I1, UBCE7IP1, ZIN, белок безымянного пальца 216
Внешние идентификаторы	OMIM: 609948 MGI: 1344349 ГомолоГен: 19442 Генные карты: RNF216
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p22.1 Начните 5,620,047 бп[1] Конец 5,781,739 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G2 Начните 142,990,893 бп[2] Конец 143,112,994 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • Коллатераль Шаффера - синапс CA1 • постсинаптическая эндоцитарная зона • глутаматергический синапс Биологический процесс • убиквитинирование, связанное с белком K48 • отрицательная регуляция выработки интерферона I типа • GO: 0022415 вирусный процесс • регулирование выработки интерферона-бета • убиквитинирование белков • регулирование защитного ответа на вирус со стороны хозяина • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • апоптотический процесс • белковый катаболический процесс, модулирующий синаптическую передачу Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	54476	108086
Ансамбль	ENSG00000011275	ENSMUSG00000045078
UniProt	Q9NWF9	P58283
RefSeq (мРНК)	NM_019011 NM_207111 NM_207116 NM_001377156	NM_080561 NM_207110 NM_001359851
RefSeq (белок)	NP_996994 NP_996999 NP_001364085	NP_542128 NP_996993 NP_001346780
Расположение (UCSC)	Chr 7: 5.62 - 5.78 Мб	Chr 5: 142,99 - 143,11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза RNF216 является фермент что у людей кодируется RNF216 ген.^[5]

Этот ген кодирует цитоплазматический белок, который специфически колокализует и взаимодействует с серин / треониновой протеинкиназой, рецептор-взаимодействующим белком (RIP). Домены «цинковые пальцы» кодируемого белка необходимы для его взаимодействия с RIP и для ингибирования путей активации NF-каппа B, индуцированных TNF и IL1. Кодируемый белок также может функционировать как убиквитин-протеин-лигаза E3, которая принимает убиквитин от ферментов, конъюгирующих с убиквитином E2, и переносит его на субстраты. Для этого локуса описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но известна полноразмерная природа только некоторых.^[5]

Смотрите также

• RING finger домен

Взаимодействия

RNF216 был показан взаимодействовать с участием TLR9^[6] и РИПК1.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000011275 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000045078 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок TRIAD3 TRIAD3».
6. Чжуан, Цзун-Сянь; Улевич Ричард Дж (май 2004 г.). «Triad3A, убиквитин-протеинлигаза E3, регулирующая Toll-подобные рецепторы». Nat. Иммунол. 5 (5): 495–502. Дои:10.1038 / ni1066. ISSN  1529-2908. PMID  15107846. S2CID  39773935.
7. Чен, Даньинг; Ли Сяоянь; Чжай Чжунхэ; Шу Хун-Бин (Май 2002 г.). «Новый белок цинкового пальца взаимодействует с рецептором-взаимодействующим белком (RIP) и ингибирует фактор некроза опухоли (TNF) - и индуцированную IL1 активацию NF-kappa B». J. Biol. Chem. 277 (18): 15985–91. Дои:10.1074 / jbc.M108675200. ISSN  0021-9258. PMID  11854271.

дальнейшее чтение

• Lake JA, Carr J, Feng F и др. (2003). «Роль Vif во время ВИЧ-1 инфекции: взаимодействие с новыми клеточными факторами хозяина». J. Clin. Вирол. 26 (2): 143–52. Дои:10.1016 / S1386-6532 (02) 00113-0. PMID  12600646.
• Матоба Р., Окубо К., Хори Н. и др. (1994). «Добавление информации о 5'-кодировании в 3'-направленную библиотеку кДНК улучшает анализ экспрессии генов». Ген. 146 (2): 199–207. Дои:10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID  8076819.
• ван дер Рейден Б.А., Эрпелинк-Фершуерен КА, Лёвенберг Б., Янсен Дж. Х. (1999). «TRIADs: новый класс белков с новой сигнатурой, богатой цистеином». Белковая наука. 8 (7): 1557–61. Дои:10.1110 / пс. 8.7.1557. ЧВК  2144383. PMID  10422847.
• Ван Х, Столлар Б.Д. (1999). «Экспрессия гена иммуноглобулина VH при старении человека». Clin. Иммунол. 93 (2): 132–42. Дои:10.1006 / clim.1999.4781. PMID  10527689.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Чен Д., Ли Х, Чжай З., Шу Х. Б. (2002). «Новый белок цинкового пальца взаимодействует с рецептором-взаимодействующим белком (RIP) и ингибирует фактор некроза опухоли (TNF) - и индуцированную IL1 активацию NF-kappa B». J. Biol. Chem. 277 (18): 15985–91. Дои:10.1074 / jbc.M108675200. PMID  11854271.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Bibcode:2003Натура.424..157H. Дои:10.1038 / природа01782. PMID  12853948.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Чуанг TH, Улевич RJ (2004). «Triad3A, убиквитин-протеинлигаза E3, регулирующая Toll-подобные рецепторы». Nat. Иммунол. 5 (5): 495–502. Дои:10.1038 / ni1066. PMID  15107846. S2CID  39773935.
• Фен Ф., Дэвис А., Лейк Дж. А. и др. (2004). «Белок безымянного пальца ZIN взаимодействует с вирусом иммунодефицита человека типа 1 Vif». Дж. Вирол. 78 (19): 10574–81. Дои:10.1128 / JVI.78.19.10574-10581.2004. ЧВК  516435. PMID  15367624.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• О Дж. Х., Ян Дж., Хан И и др. (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Fearns C, Pan Q, Mathison JC, Chuang TH (2006). «Triad3A регулирует убиквитинирование и протеасомную деградацию RIP1 после разрушения связывания Hsp90». J. Biol. Chem. 281 (45): 34592–600. Дои:10.1074 / jbc.M604019200. PMID  16968706.

внешние ссылки

• RNF216 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)