RNF39 - RNF39

RNF39
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF39, HZF, HZFW, LIRF, белок безымянного пальца 39, FAP216
Внешние идентификаторы	OMIM: 607524 MGI: 2156378 ГомолоГен: 11891 Генные карты: RNF39
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.1 Начинать 30,070,266 бп[1] Конец 30,075,887 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов Сотовый компонент • цитоплазма • клеточный компонент Биологический процесс • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	80352	386454
Ансамбль	ENSG00000230467 ENSG00000206500 ENSG00000204618 ENSG00000237733 ENSG00000227171 ENSG00000235022 ENSG00000236967 ENSG00000230332	ENSMUSG00000036492
UniProt	Q9H2S5	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_170770 NM_025236 NM_170769	NM_001099632
RefSeq (белок)	NP_079512 NP_739575	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 6: 30.07 - 30.08 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кольцо пальца протеина 39 это белок что у людей кодируется RNF39 ген.^[4][5][6]

Этот ген находится внутри главный комплекс гистосовместимости регион I класса по хромосома 6. Исследования аналогичного крысиного белка предполагают, что этот ген кодирует белок, который играет роль в ранней фазе синаптическая пластичность. В результате альтернативного сплайсинга получается три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.^[6]

Рекомендации

1. ENSG00000206500, ENSG00000204618, ENSG00000237733, ENSG00000227171, ENSG00000235022, ENSG00000236967, ENSG00000230332 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000230467, ENSG00000206500, ENSG00000204618, ENSG00000237733, ENSG00000227171, ENSG00000235022, ENSG00000236967, ENSG00000230332 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Coriton O, Lepourcelet M, Hampe A, Galibert F, Mosser J (декабрь 2000 г.). «Транскрипционный анализ центромерной последовательности размером 69 т.п.н. по отношению к HLA-J: плотная и сложная структура из пяти генов». Геном мамм. 11 (12): 1127–31. Дои:10.1007 / s003350010213. PMID  11130983. S2CID  22881226.
5. Мацуо Р., Асада А., Фудзитани К., Инокучи К. (ноябрь 2001 г.). «LIRF, ген, индуцируемый во время долгосрочной потенциации гиппокампа как ранний ген, кодирует новый белок пальца RING». Biochem Biophys Res Commun. 289 (2): 479–84. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5975. PMID  11716498.
6. «Ген Entrez: белок 39 безымянного пальца RNF39».

дальнейшее чтение

• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Оримо А., Ямагиши Т., Томинага Н. и др. (2000). «Молекулярное клонирование белка пальца с большим количеством семенников / белка 23 безымянного пальца (RNF23), нового белка RING-B box-coiled-coil-B30.2 в области класса I MHC человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 276 (1): 45–51. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3380. PMID  11006080.
• Хидака М., Каруана Г., Стэнфорд В.Л. и др. (2000). «Улавливание двух новых генов, Hzf и Hhl, экспрессируемых в гемопоэтических клетках». Мех. Dev. 90 (1): 3–15. Дои:10.1016 / S0925-4773 (99) 00234-8. PMID  10585558. S2CID  673064.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.