RNF41 - RNF41

RNF41
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2FZP, 2GWF
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF41, FLRF, NRDP1, SBBI03, белок безымянного пальца 41
Внешние идентификаторы	MGI: 1914838 ГомолоГен: 4226 Генные карты: RNF41
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.3 Начинать 56,202,179 бп[1] Конец 56,221,933 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 D3 | 10 76,55 см Начинать 128,411,657 бп[2] Конец 128,441,441 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора интерлейкина-3 • связывание рецептора эритропоэтина • Связывание RAL GTPase • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • трансферазная активность • активность убиквитин-протеинтрансферазы • специфическое связывание белкового домена • связывание рецепторной тирозинкиназы • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы Сотовый компонент • цитозоль • перинуклеарная область цитоплазмы • сеть канальцев эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • регулирование каскада МАПК • внешний апоптотический сигнальный путь • положительная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • полиубиквитинирование белков • регулирование метаболического процесса активных форм кислорода • аутофагия • отрицательное регулирование миграции клеток • регуляция дифференцировки лимфоцитов • положительная регуляция метаболических процессов активных форм кислорода • убиквитинирование белков • регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • регуляция экспрессии генов • катаболический процесс протеасомного белка • регуляция дифференцировки миелоидных клеток • регулирование установления полярности клеток • отрицательное регулирование пролиферации клеток • аутоубиквитинирование белков • апоптотический процесс • отрицательная регуляция митофагии • положительная регуляция белкового катаболического процесса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10193	67588
Ансамбль	ENSG00000181852	ENSMUSG00000025373
UniProt	Q9H4P4	Q8BH75
RefSeq (мРНК)	NM_001242826 NM_005785 NM_194358 NM_194359	NM_001164237 NM_026259
RefSeq (белок)	NP_001229755 NP_005776 NP_919339 NP_919340	NP_001157709 NP_080535
Расположение (UCSC)	Chr 12: 56,2 - 56,22 Мб	Chr 10: 128,41 - 128,44 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза NRDP1 является фермент что у людей кодируется RNF41 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, содержит RING-палец, мотив, присутствующий во множестве функционально различных белков и, как известно, участвующий во взаимодействиях белок-белок и белок-ДНК. Специфическая функция этого белка еще не определена. Сообщалось о трех альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта, кодирующих две различные изоформы.^[5]

Взаимодействия

RNF41 был показан взаимодействовать с USP8.^[6]

Смотрите также

• RING finger домен

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000181852 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025373 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок безымянного пальца RNF41 41».
6. Wu X, Yen L, Irwin L, Sweeney C, Carraway KL (сентябрь 2004 г.). «Стабилизация убиквитинлигазы E3 Nrdp1 деубиквитинирующим ферментом USP8». Мол. Клетка. Биол. 24 (17): 7748–57. Дои:10.1128 / MCB.24.17.7748-7757.2004. ЧВК  506982. PMID  15314180.

дальнейшее чтение

• Цао З., Ву Х, Йен Л., Суини С., Каррауэй К.Л. (2007). «Индуцированное нейрегулином подавление активности ErbB3 опосредовано каскадом стабильности белка с участием убиквитинлигазы E3 Nrdp1». Мол. Клетка. Биол. 27 (6): 2180–8. Дои:10.1128 / MCB.01245-06. ЧВК  1820496. PMID  17210635.
• Аввакумов Г.В., Уокер Дж. Р., Сюэ С., Финерти П. Дж., Маккензи Ф., Ньюман Э. М., Де-Паганон С. (2006). «Аминоконцевая димеризация, взаимодействие NRDP1-роданезы и ингибирование конформации каталитического домена убиквитин-специфической протеазы 8 (USP8)». J. Biol. Chem. 281 (49): 38061–70. Дои:10.1074 / jbc.M606704200. PMID  17035239.
• Ву X, Йен Л., Ирвин Л., Суини С., Каррауэй К.Л. (2004). «Стабилизация убиквитинлигазы E3 Nrdp1 деубиквитинирующим ферментом USP8». Мол. Клетка. Биол. 24 (17): 7748–57. Дои:10.1128 / MCB.24.17.7748-7757.2004. ЧВК  506982. PMID  15314180.
• Цю XB, Markant SL, Юань Дж., Голдберг AL (2004). «Nrdp1-опосредованная деградация гигантского IAP, BRUCE, представляет собой новый путь запуска апоптоза». EMBO J. 23 (4): 800–10. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600075. ЧВК  380992. PMID  14765125.
• Браженович М., Джоберти Г., Кюстер Б., Бауместер Т., Древес Г. (2004). «Всесторонний протеомный анализ человеческих белковых комплексов Par показывает взаимосвязанную белковую сеть». J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. Дои:10.1074 / jbc.M312171200. PMID  14676191.
• Цю XB, Голдберг AL (2002). «Nrdp1 / FLRF представляет собой убиквитинлигазу, способствующую убиквитинизации и деградации члена семейства рецепторов эпидермального фактора роста, ErbB3». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (23): 14843–8. Дои:10.1073 / pnas.232580999. ЧВК  137506. PMID  12411582.
• Диамонти А.Дж., Гай П.М., Иваноф С., Вонг К., Суини С., Карравей К.Л. (2002). «Белок RBCC, участвующий в поддержании стабильного уровня рецепторов нейрегулина». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (5): 2866–71. Дои:10.1073 / pnas.052709799. ЧВК  122439. PMID  11867753.
• Абдулла Дж. М., Ли Х, Нахтман Р. Г., Юречич Р. (2001). «FLRF, новый эволюционно законсервированный ген пальца RING, по-разному экспрессируется в эмбриональных и взрослых гемопоэтических стволовых клетках и предшественниках мыши». Blood Cells Mol. Дис. 27 (1): 320–33. Дои:10.1006 / bcmd.2001.0390. PMID  11358394.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Ю. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.

внешняя ссылка

• RNF41 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• RNF41 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• RNF41 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.