RRBP1 - RRBP1

RRBP1
Идентификаторы
Псевдонимы	RRBP1, ES / 130, ES130, RRp, hES, белок, связывающий рибосомы 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601418 ГомолоГен: 136784 Генные карты: RRBP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p12.1 Начинать 17,613,678 бп[1] Конец 17,682,295 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание РНК • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • неотъемлемый компонент мембраны эндоплазматического ретикулума • рибосома • эндоплазматический ретикулум • мембрана • мембрана эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • транспорт белка • биосинтез белка • дифференцировка остеобластов • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6238	н / д
Ансамбль	ENSG00000125844	н / д
UniProt	Q9P2E9	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_004587 NM_001042576 NM_001365613	н / д
RefSeq (белок)	NP_001036041 NP_004578 NP_001352542	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 20: 17.61 - 17.68 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Белок, связывающий рибосомы 1, также называемый p180, это белок что у людей кодируется RRBP1 ген.^[3][4]

RRBP1 - это мембраносвязанный белок, обнаруженный в эндоплазматический ретикулум (ER). Первоначально он был идентифицирован как рецептор рибосом для ER,^[5] однако несколько групп позже продемонстрировали, что эта активность не ко-фракционировалась с RRBP1. ^{[6] [7]} а скорее с Sec61 (т.е. Translocon ).^[8][9] RRBP1 может усиливать ассоциацию определенных мРНК с эндоплазматическим ретикулумом способом, который не требует активности рибосом, вероятно, напрямую связывая фосфатный остов мРНК.^[10]. Кроме того, RRBP1 может способствовать ассоциации полисом с транслоконом. ^[11][12] и играют роль в морфологии ER.^[13] RRBP1 также может связываться с микротрубочки.^[14] Хотя изоформа p180 является наиболее распространенной, она может существовать в различных формах из-за удаления тандемных повторов путем частичного внутриэксонного сплайсинга. RRBP1 был исключен в качестве гена-кандидата в причину синдрома Алажиля.^[4]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125844 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Basson CT, MacRae CA, Schoenberg-Fejzo M, Morton CC, Spinner NB, Genin A, Krug E, Seidman JG, Seidman CE (декабрь 1996 г.). «Идентификация, характеристика и хромосомная локализация человеческого гомолога (hES) ES / 130». Геномика. 35 (3): 628–31. Дои:10.1006 / geno.1996.0413. PMID  8812507.
4. «Ген Entrez: RRBP1, гомолог связывающего рибосомы белка 1, 180 кДа (собака)».
5. Савиц, Адам Дж .; Мейер, Дэвид И. (1990). «Идентификация рецептора рибосомы в шероховатом эндоплазматическом ретикулуме». Природа. 346 (6284): 540–544. Дои:10.1038 / 346540a0. ISSN  0028-0836. PMID  2165568. S2CID  4353593.
6. Нуннари, Джоди М .; Zimmerman, Deborah L .; Ogg, Стивен С.; Уолтер, Питер (1991). «Характеристика активности связывания рибосом грубого эндоплазматического ретикулума». Природа. 352 (6336): 638–640. Дои:10.1038 / 352638a0. ISSN  0028-0836. PMID  1650916. S2CID  4364699.
7. Коллинз, П.Г .; Гилмор, Р. Л. (1991). «Связывание рибосом с эндоплазматическим ретикулумом: белок массой 180 кДа, идентифицированный путем сшивания с мембранными рибосомами, не требуется для активности связывания рибосом». Журнал клеточной биологии. 114 (4): 639–49. CiteSeerX  10.1.1.282.646. Дои:10.1083 / jcb.114.4.639. ЧВК  2289890. PMID  1869584.
8. Герлих, Дирк; Прен, Зигфрид; Хартманн, Энно; Калиес, Кай-Уве; Рапопорт, Том А. (1992). «Гомолог SEC61p и SECYp у млекопитающих связан с рибосомами и растущими полипептидами во время транслокации». Клетка. 71 (3): 489–503. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90517-Г. ISSN  0092-8674. PMID  1423609. S2CID  19078317.
9. Горлич, Д. (1993). «Транслокация белков в протеолипосомы, восстановленные из очищенных компонентов мембраны эндоплазматического ретикулума» (PDF). Клетка. 75 (4): 615–630. Дои:10.1016/0092-8674(93)90483-7. ISSN  0092-8674. PMID  8242738. S2CID  5476342.
10. Cui, Xianying A .; Чжан, Хуэй; Палаццо, Александр Ф. (2012). «p180 способствует независимой от рибосомы локализации субнабора мРНК в эндоплазматическом ретикулуме». PLOS Биология. 10 (5): e1001336. Дои:10.1371 / journal.pbio.1001336. ISSN  1545-7885. ЧВК  3362647. PMID  22679391.
11. Дейгаард, Курт; Феберж, Жан-Франсуа; Хит-Энгель, Ханна; Чевет, Эрик; Tremblay, Michel L .; Томас, Дэвид Ю. (2010). «Организация Sec61 Translocon, изученная с помощью нативного электрофореза высокого разрешения». Журнал протеомных исследований. 9 (4): 1763–1771. Дои:10.1021 / pr900900x. ISSN  1535-3893. PMID  20112977.
12. Уэно, Т .; Канеко, К .; Сел на.; Hattori, S .; Огава-Гото, К. (2011). «Регулирование сборки полисом в эндоплазматическом ретикулуме с помощью белка спиральной спирали, p180». Исследования нуклеиновых кислот. 40 (7): 3006–3017. Дои:10.1093 / нар / gkr1197. ISSN  0305-1048. ЧВК  3326322. PMID  22156060.
13. Шибата, Йоко; Шемеш, Том; Prinz, William A .; Палаццо, Александр Ф .; Козлов, Михаил М .; Рапопорт, Том А. (2010). «Механизмы, определяющие морфологию периферической ER». Клетка. 143 (5): 774–788. Дои:10.1016 / j.cell.2010.11.007. ISSN  0092-8674. ЧВК  3008339. PMID  21111237.
14. Огава-Гото К., Танака К., Уэно Т. и др. (2007). «p180 участвует во взаимодействии между эндоплазматической сетью и микротрубочками через новый домен связывания и связывания микротрубочек». Мол. Биол. Клетка. 18 (10): 3741–51. Дои:10.1091 / mbc.E06-12-1125. ЧВК  1995732. PMID  17634287.

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Савиц А.Дж., Мейер Д.И. (1990). «Идентификация рецептора рибосомы в шероховатом эндоплазматическом ретикулуме». Природа. 346 (6284): 540–4. Дои:10.1038 / 346540a0. PMID  2165568. S2CID  4353593.
• Лэнгли Р., Люнг Э., Моррис С. и др. (1998). «Идентификация множества форм рецептора рибосомы 180 кДа в клетках человека». ДНК клетки биол. 17 (5): 449–60. Дои:10.1089 / dna.1998.17.449. PMID  9628588.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID  10718198.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Дифенбах Р.Дж., Дифенбах Э., Дуглас М.В., Каннингем А.Л. (2004). «Рецептор рибосомы, p180, взаимодействует с тяжелой цепью кинезина, KIF5B». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 319 (3): 987–92. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.05.069. PMID  15184079.
• Колланд Ф., Жак Х, Троплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.