RRP9 - RRP9

RRP9
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4J0W, 4JXM
Идентификаторы
Псевдонимы	RRP9, RNU3IP2, U3-55K, процессинг рибосомной РНК 9, компонент процессома малой субъединицы (SSU), гомолог (дрожжи), процессинг рибосомной РНК 9, связывающий белок малой ядрышковой РНК U3
Внешние идентификаторы	MGI: 2384313 ГомолоГен: 3452 Генные карты: RRP9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п21.2 Начинать 51,933,429 бп[1] Конец 51,941,904 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 F1 | 9 57,59 см Начинать 106,475,963 бп[2] Конец 106,485,424 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание U3 snoRNA • Связывание РНК • связывание snoRNA Сотовый компонент • процессом малых субъединиц • ядрышко • коробка C / D комплекс snoRNP • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • обработка рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9136	27966
Ансамбль	ENSG00000114767	ENSMUSG00000041506
UniProt	O43818	Q91WM3
RefSeq (мРНК)	NM_004704	NM_145620
RefSeq (белок)	NP_004695	NP_663595
Расположение (UCSC)	Chr 3: 51.93 - 51.94 Мб	Chr 9: 106,48 - 106,49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

U3 малый ядрышковый белок, взаимодействующий с РНК 2 это белок что у людей кодируется RRP9 ген.^[5][6][7]

Смотрите также

• Фибрилларин
• Малая ядрышковая РНК U3
• RCL1
• RRP9
• UTP6
• UTP11L
• UTP14A
• UTP15

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114767 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041506 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Плюк Х., Соффнер Дж., Лурманн Р., ван Венройдж В. Дж. (Январь 1998 г.). «Клонирование кДНК и характеристика белка 55 килодальтон, ассоциированного с малым ядром U3 человека, рибонуклеопротеинового комплекса». Mol Cell Biol. 18 (1): 488–98. Дои:10.1128 / mcb.18.1.488. ЧВК  121518. PMID  9418896.
6. Verheggen C, Lafontaine DL, Samarsky D, Mouaikel J, Blanchard JM, Bordonne R, Bertrand E (май 2002 г.). «U3 snoRNP млекопитающих и дрожжей созревают в специфических и родственных ядерных компартментах». EMBO J. 21 (11): 2736–45. Дои:10.1093 / emboj / 21.11.2736. ЧВК  126019. PMID  12032086.
7. «Ген Entrez: RRP9 RRP9, малая субъединица (SSU), компонент процессома, гомолог (дрожжи)».

дальнейшее чтение

• Луковяк А.А., Граннеман С., Маттокс С.А. и др. (2000). «Взаимодействие белка U3-55k с мяРНК U3 опосредуется мотивом Box B / C U3 и повторами WD U3-55k». Нуклеиновые кислоты Res. 28 (18): 3462–71. Дои:10.1093 / nar / 28.18.3462. ЧВК  110750. PMID  10982864.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Granneman S, Pruijn GJ, Horstman W и др. (2003). «Белку hU3-55K требуется связывание 15,5K с мотивом бокса B / C, а также фланкирующими элементами РНК для его ассоциации с малой ядрышковой РНК U3 in Vitro». J. Biol. Chem. 277 (50): 48490–500. Дои:10.1074 / jbc.M206631200. PMID  12381732.
• Scherl A, Couté Y, Déon C и др. (2003). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Уоткинс Н.Дж., Лемм И., Ингельфингер Д. и др. (2005). «Сборка и созревание U3 snoRNP в нуклеоплазме в большом динамическом мультипротеиновом комплексе». Мол. Клетка. 16 (5): 789–98. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.11.012. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-EB89-8. PMID  15574333.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153. S2CID  39457788.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого белка 2, взаимодействующего с малой ядрышковой РНК U3 (RRP9)