RSF1 - RSF1 - Wikipedia

RSF1
Идентификаторы
Псевдонимы	RSF1, HBXAP, RSF-1, XAP8, p325, коэффициент ремоделирования и интервала 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 608522 MGI: 2682305 ГомолоГен: 41142 Генные карты: RSF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q14.1 Начинать 77,659,996 бп[1] Конец 77,821,017 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 E1 Начинать 97,579,889 бп[2] Конец 97,692,778 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гистонов • АТФазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • активность гистонацетилтрансферазы Сотовый компонент • RSF комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • гистонацетилтрансферазный комплекс • ядерный хроматин Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция связывания ДНК • ремоделирование хроматина • положительная регуляция вирусной транскрипции • позиционирование нуклеосом • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • CENP-A-содержащая сборка нуклеосом • транскрипция, ДНК-шаблон • ДНК-шаблонная транскрипция, инициация • сборка нуклеосом • организация хроматина • ацетилирование гистонов • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51773	233532
Ансамбль	ENSG00000048649	ENSMUSG00000035623
UniProt	Q96T23 Q05DG0	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_016578	NM_001081267
RefSeq (белок)	NP_057662 NP_057662.3	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 11: 77,66 - 77,82 Мб	Chr 7: 97,58 - 97,69 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Коэффициент ремоделирования и интервала 1 это белок что у людей кодируется RSF1 ген.^[5][6][7]

HBXAP участвует в транскрипция репрессия, коактивация транскрипции при сочетании с вирус гепатита В X белок (HBX) и хроматин ремоделирование и интервалы, связанные с SNF2H (MIM 603375). [предоставлено OMIM]^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000048649 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035623 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Shamay M, Barak O, Doitsh G, Ben-Dor I, Shaul Y (март 2002 г.). «Вирус гепатита B pX взаимодействует с HBXAP, пальцевым белком PHD, чтобы коактивировать транскрипцию». J Biol Chem. 277 (12): 9982–8. Дои:10.1074 / jbc.M111354200. PMID  11788598.
6. Лойола А., Хуанг Дж.Й., Лерой Дж., Ху С., Ван Й.Х., Доннелли Р.Дж., Лейн В.С., Ли С.К., Рейнберг Д. (сентябрь 2003 г.). «Функциональный анализ субъединиц фактора сборки хроматина RSF». Mol Cell Biol. 23 (19): 6759–68. Дои:10.1128 / MCB.23.19.6759-6768.2003. ЧВК  193931. PMID  12972596.
7. «Ген Энтреса: фактор ремоделирования RSF1 и интервала 1».

дальнейшее чтение

• Ли TH, Элледж SJ, Butel JS (1995). «Белок вируса гепатита B X взаимодействует с вероятным белком репарации клеточной ДНК». Дж. Вирол. 69 (2): 1107–14. Дои:10.1128 / JVI.69.2.1107-1114.1995. ЧВК  188683. PMID  7815490.
• Лерой Г., Орфанидес Г., Лейн В.С., Рейнберг Д. (1998). «Требование RSF и FACT для транскрипции матриц хроматина in vitro». Наука. 282 (5395): 1900–4. Дои:10.1126 / science.282.5395.1900. PMID  9836642.
• Шамай М, Барак О, Шауль Й (2002). «HBXAP, новый белок PHD-finger, обладает активностью репрессии транскрипции». Геномика. 79 (4): 523–9. Дои:10.1006 / geno.2002.6717. PMID  11944984.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Обусе С., Ян Х., Нозаки Н. и др. (2004). «Протеомный анализ центромерного комплекса из интерфазных клеток HeLa: поврежденный УФ излучением ДНК-связывающий белок 1 (DDB-1) является компонентом CEN-комплекса, в то время как BMI-1 временно совмещен с центромерной областью в интерфазе». Гены Клетки. 9 (2): 105–20. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2004.00705.x. PMID  15009096. S2CID  21813024.
• Хуанг Дж.Й., Шен Б.Дж., Цай У.Х., Ли СК. «Функциональное взаимодействие между HBXAP, ассоциированным с ядерным матриксом, и NF-kappaB». Exp. Cell Res. 298 (1): 133–43. Дои:10.1016 / j.yexcr.2004.04.019. PMID  15242768.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Shih IeM, Sheu JJ, Santillan A, et al. (2005). «Амплификация гена ремоделирования хроматина, Rsf-1 / HBXAP, при карциноме яичников». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (39): 14004–9. Дои:10.1073 / pnas.0504195102. ЧВК  1236547. PMID  16172393.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.