RTN3 - RTN3

RTN3
Идентификаторы
Псевдонимы	RTN3, ASYIP, HAP, NSPL2, NSPLII, RTN3-A1, ретикулон 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 604249 MGI: 1339970 ГомолоГен: 24934 Генные карты: RTN3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.1 Начните 63,681,446 бп[1] Конец 63,759,891 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начните 7,425,901 бп[2] Конец 7,483,281 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • Мембрана Гольджи • аппарат Гольджи • эндоплазматический ретикулум • мембрана • мембрана эндоплазматического ретикулума • клеточная мембрана • внеклеточный • синапс Биологический процесс • организация трубчатой ​​сети эндоплазматического ретикулума • GO: 0022415 вирусный процесс • везикулярный транспорт • апоптотический процесс • формирование трубчатой ​​сети эндоплазматического ретикулума Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10313	20168
Ансамбль	ENSG00000133318	ENSMUSG00000024758
UniProt	O95197	Q9ES97
RefSeq (мРНК)	NM_001265589 NM_001265590 NM_001265591 NM_006054 NM_201428 NM_201429 NM_201430	NM_001003930 NM_001003933 NM_001003934 NM_001271486 NM_001271487 NM_053076
RefSeq (белок)	NP_001252518 NP_001252519 NP_001252520 NP_006045 NP_958831 NP_958832 NP_958833	NP_001003933 NP_001003934 NP_001258415 NP_001258416 NP_444306
Расположение (UCSC)	Chr 11: 63.68 - 63.76 Мб	Chr 19: 7,43 - 7,48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ретикулон-3 это белок что у людей кодируется RTN3 ген.^[5][6]

В сеточки представляют собой группу высококонсервативных генов с преимущественным выражение в нейроэндокринный ткани (см., например, RTN1; MIM 600865). [Поставляется OMIM]^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133318 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024758 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Морейра Э. Ф., Яворски С. Дж., Родригес И. Р. (июль 1999 г.). «Клонирование нового члена семейства генов ретикулонов (RTN3): структура гена и хромосомная локализация в 11q13». Геномика. 58 (1): 73–81. Дои:10.1006 / geno.1999.5807. PMID  10331947.
6. "Entrez Gene: RTN3 ретикулон 3".

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Цюй X, Qi Y, Qi B (2002). «Создание множественных транскриптов мРНК из нового человеческого гена, индуцирующего апоптоз, hap путем альтернативного использования полиаденилирования и функции активации трансляции 3'-нетранслируемой области». Arch. Biochem. Биофизы. 400 (2): 233–44. Дои:10.1016 / S0003-9861 (02) 00016-4. PMID  12054434.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Qi B, Qi Y, Watari A, et al. (2003). «Проапоптотический белок ASY / Nogo-B ассоциируется с ASYIP». J. Cell. Физиол. 196 (2): 312–8. Дои:10.1002 / jcp.10297. PMID  12811824. S2CID  7066102.
• Oertle T, Klinger M, Stuermer CA, Schwab ME (2003). «Ретикулярная рапсодия: филогенетическая эволюция и номенклатура генного семейства RTN / Nogo» (PDF). FASEB J. 17 (10): 1238–47. Дои:10.1096 / fj.02-1166hyp. PMID  12832288. S2CID  27903.
• Ди Сано Ф., Фази Б., Ситро Дж. И др. (2003). «Глюкозилцерамидсинтаза и ее функциональное взаимодействие с RTN-1C регулируют химиотерапевтический апоптоз в клетках нейроэпителиомы». Рак Res. 63 (14): 3860–5. PMID  12873973.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Хуанг Х, Ян Х, Чжоу И и др. (2004). «Сверхэкспрессия ретикулона 3 человека (hRTN3) в астроцитоме». Clin. Невропатол. 23 (1): 1–7. PMID  14986927.
• Hu Y, Fang X, Dunham SM, et al. (2004). «Рибосомная киназа S6 массой 90 кДа является прямой мишенью для рецептора ядерного фактора роста фибробластов 1 (FGFR1): роль в передаче сигналов FGFR1». J. Biol. Chem. 279 (28): 29325–35. Дои:10.1074 / jbc.M311144200. PMID  15117958.
• He W, Lu Y, Qahwash I, et al. (2004). «Члены семейства ретикулонов модулируют активность BACE1 и образование пептида бета-амилоида». Nat. Med. 10 (9): 959–65. Дои:10,1038 / нм 1088. PMID  15286784. S2CID  23570406.
• Ди Скала Ф., Дюпюи Л., Гайддон С. и др. (2005). «Тканевая специфичность и регуляция N-концевого разнообразия ретикулона 3». Biochem. J. 385 (Pt 1): 125–34. Дои:10.1042 / BJ20040458. ЧВК  1134680. PMID  15350194.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ган М., Ци И, Ван Кв и др. (2005). «Белок, индуцирующий апоптоз млекопитающих, HAP, вызывает гибель бактериальных клеток». Мол. Биол. Представитель. 31 (3): 159–64. Дои:10.1023 / B: MOLE.0000043551.84883.c8. PMID  15560370. S2CID  11901566.
• Куанг Э., Ван Ц., Ли Х и др. (2005). «Истощение ER Ca2 + запускает апоптотические сигналы для реакции перегрузки эндоплазматического ретикулума (ER), вызванной сверхэкспрессией ретикулона 3 (RTN3 / HAP)». J. Cell. Физиол. 204 (2): 549–59. Дои:10.1002 / jcp.20340. PMID  15799019. S2CID  30086875.
• Cai Y, Saiyin H, Lin Q и др. (2005). «Идентификация нового транскрипта RTN3, RTN3-A1, и его распространение в мозге взрослых мышей». Brain Res. Мол. Мозг Res. 138 (2): 236–43. Дои:10.1016 / j.molbrainres.2005.04.020. PMID  15946766.
• Вакана Ю., Кояма С., Накадзима К. и др. (2005). «Ретикулон 3 участвует в мембранном переносе между эндоплазматическим ретикулумом и Гольджи». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 334 (4): 1198–205. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.07.012. PMID  16054885.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секрецию или мембранные белки, из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Heath JE, Siedlak SL, Zhu X, Lee HG, Thakur A, Yan R, Perry G, Smith MA, Castellani RJ (2010). «Широкое распространение ретикулона-3 при различных нейродегенеративных заболеваниях». Невропатология. 30 (6): 574–9. Дои:10.1111 / j.1440-1789.2010.01107.x. ЧВК  2902651. PMID  20374499.

внешние ссылки

• RTN3 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• RTN3 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.