Рибопереключатель SAH - SAH riboswitch

Рибопереключатель S-аденозил-L-гомоцистеина
Вторичная структура рибосвитча SAH.jpg
Идентификаторы
СимволSAH_riboswitch
РфамRF01057
Прочие данные
РНК типСнг; рибопереключатель
Домен (ы)Бактерии
ТАКSO: 0005836
PDB структурыPDBe

Рибопереключатели SAH своего рода рибопереключатель это связывает S-аденозилгомоцистеин (САХ).[1] Когда коэнзим S-аденозилметионин (SAM) используется в метилирование реакции, SAH производится. Рибопереключатели SAH обычно активируют гены, участвующие в рециркуляции SAH, чтобы создать больше SAM (или метаболически связанных метионин ). Это особенно актуально для клеток, потому что высокие уровни SAH могут быть токсичными.[2] Первоначально идентифицированный биоинформатикой,[3] Рибопереключатели SAH обнаруживаются у многих видов бактерии, преимущественно определенные Протеобактерии и Актинобактерии. Трехмерная структура атомарного разрешения Рибопереключатель SAH решена с помощью рентгеновской кристаллографии.[4]

Консенсусная вторичная структура рибопереключателей SAH. Макет аналогичен тому, что используется в опубликованном изображении.[1] Три пары оснований в этой вторичной структуре были неверно предсказаны, в то время как дополнительная пара оснований отсутствует, что было выявлено с помощью третичной структуры с атомным разрешением.[4]

Рекомендации

  1. ^ а б Ван Дж. Х, Ли Э. Р., Моралес Д. Р., Лим Дж., Брейкер Р. Р. (2008). «Рибопереключатели, которые воспринимают S-аденозилгомоцистеин и активируют гены, участвующие в рециркуляции коферментов». Мол. Клетка. 29 (6): 691–702. Дои:10.1016 / j.molcel.2008.01.012. ЧВК  2712820. PMID  18374645.
  2. ^ Ueland PM (1982). «Фармакологические и биохимические аспекты S-аденозилгомоцистеина и S-аденозилгомоцистеин гидролазы». Pharmacol. Rev. 34 (3): 223–253. PMID  6760211.
  3. ^ Вайнберг З., Баррик Дж. Э., Яо З. и др. (2007). «Идентификация 22 кандидатных структурированных РНК в бактериях с использованием системы сравнительной геномики CMfinder». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (14): 4809–4819. Дои:10.1093 / нар / гкм487. ЧВК  1950547. PMID  17621584.
  4. ^ а б Эдвардс А.Л., Рейес Ф.Е., Эру А., Бати Р.Т. (сентябрь 2010 г.). «Структурные основы распознавания S-аденозилгомоцистеина рибопереключателями». РНК. 16 (11): 2144–2155. Дои:10.1261 / rna.2341610. ЧВК  2957054. PMID  20864509.

внешняя ссылка