SCAMP1 - SCAMP1

SCAMP1
Идентификаторы
Псевдонимы	SCAMP1, SCAMP, SCAMP37, белок секреторной мембраны-носителя 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606911 MGI: 1349480 ГомолоГен: 37975 Генные карты: SCAMP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q14.1 Начните 78,360,611 бп[1] Конец 78,480,739 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 C3 Начните 94,201,310 бп[2] Конец 94,285,857 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • мембрана • неотъемлемый компонент мембраны • эндосома • переработка мембраны эндосомы • сеть транс-Гольджи • аппарат Гольджи • синапс • мембрана синаптических везикул • мембрана из гранул зимогена • везикула, покрытая клатрином • клеточная мембрана • специфическая гранулярная мембрана • мембрана цитоплазматических везикул • Мембрана Гольджи • мембрана транс-сети Гольджи Биологический процесс • транспорт белка • пост-Гольджи-опосредованный везикулами транспорт • экзоцитоз • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9522	107767
Ансамбль	ENSG00000085365	ENSMUSG00000021687
UniProt	O15126	Q8K021
RefSeq (мРНК)	NM_001290229 NM_004866 NM_052822	NM_029153 NM_001346609
RefSeq (белок)	NP_001277158 NP_004857	NP_001333538 NP_083429
Расположение (UCSC)	Chr 5: 78.36 - 78.48 Мб	Chr 13: 94,2 - 94,29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Секреторный мембранный белок-носитель 1 это белок что у людей кодируется SCAMP1 ген.^[5][6]

Функция

Этот генный продукт принадлежит к семейству белков SCAMP, которые являются белками секреторной мембраны-носителя. Они функционируют как переносчики на клеточную поверхность в путях рециклинга после Гольджи. Различные члены семейства являются тесно связанными продуктами разных генов и обычно экспрессируются вместе. Эти находки предполагают, что SCAMPs могут функционировать в одном и том же месте во время везикулярного транспорта, а не отдельными путями.^[6]

Взаимодействия

SCAMP1 показал взаимодействовать с участием ITSN1^[7] и AP1GBP1.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000085365 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021687 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Синглтон DR, Wu TT, Castle JD (сентябрь 1997 г.). «Три SCAMP млекопитающих (секреторные мембранные белки-носители) являются высоко родственными продуктами разных генов, имеющих сходное субклеточное распределение». Журнал клеточной науки. 110. 110 (Pt 17): 2099–107. PMID  9378760.
6. «Ген Entrez: белок 1 секреторной мембраны-носителя SCAMP1».
7. Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (апрель 2000 г.). «Функция SCAMP1 в эндоцитозе». Журнал биологической химии. 275 (17): 12752–6. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID  10777571.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Бренд SH, Castle JD (октябрь 1993 г.). «SCAMP 37, новый маркер в общей системе переработки клеточной поверхности». Журнал EMBO. 12 (10): 3753–61. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb06053.x. ЧВК  413657. PMID  8404846.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Геномные исследования. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Wu TT, Castle JD (июль 1997 г.). «Доказательства колокализации и взаимодействия изоформ 37 и 39 кДа секреторных белков мембран-носителей (SCAMP)». Журнал клеточной науки. 110. 110 (Pt 13): 1533–41. PMID  9224770.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (Июль 1998 г.). «Идентификация генов, экспрессируемых в человеческих CD34 (+) гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках, с помощью тегов экспрессируемой последовательности и эффективного клонирования кДНК полной длины». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (14): 8175–80. Дои:10.1073 / пнас.95.14.8175. ЧВК  20949. PMID  9653160.
• У ТТ, Замок Джей Ди (июль 1998 г.). «Фосфорилирование тирозина выбранных белков секреторной мембраны-носителя, SCAMP1 и SCAMP3, и ассоциация с рецептором EGF». Молекулярная биология клетки. 9 (7): 1661–74. Дои:10.1091 / mbc.9.7.1661. ЧВК  25404. PMID  9658162.
• Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (апрель 2000 г.). «Функция SCAMP1 в эндоцитозе». Журнал биологической химии. 275 (17): 12752–6. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID  10777571.
• Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Bell AW, Ward MA, Blackstock WP, Freeman HN, Choudhary JS, Lewis AP, Chotai D, Fazel A, Gushue JN, Paiement J, Palcy S, Chevet E, Lafrenière-Roula M, Solari R, Thomas DY, Rowley A, Бержерон Дж. Дж. (Февраль 2001 г.). «Протеомическая характеристика обильных мембранных белков Гольджи». Журнал биологической химии. 276 (7): 5152–65. Дои:10.1074 / jbc.M006143200. PMID  11042173.
• Фернандес-Чакон Р., Зюдхоф ТЦ (ноябрь 2000 г.). «Новые SCAMP, лишенные повторов NPF: повсеместные и специфичные для синаптических везикул формы вовлекают SCAMP во множественные функции переноса через мембрану». Журнал неврологии. 20 (21): 7941–50. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-21-07941.2000. ЧВК  6772721. PMID  11050114.
• Го З., Лю Л., Кафисо Д., Замок Д. (сентябрь 2002 г.). «Нарушение очень поздней стадии регулируемого экзоцитоза пептидом, полученным из секреторного мембранного белка-носителя (SCAMP2)». Журнал биологической химии. 277 (38): 35357–63. Дои:10.1074 / jbc.M202259200. PMID  12124380.
• Лю Л., Го З, Тиеу Ц., Замок А, Замок D (декабрь 2002 г.). «Роль секреторного мембранного белка-носителя SCAMP2 в экзоцитозе гранул». Молекулярная биология клетки. 13 (12): 4266–78. Дои:10.1091 / mbc.E02-03-0136. ЧВК  138632. PMID  12475951.
• Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК». Геномная биология. 5 (2): R8. Дои:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. ЧВК  395752. PMID  14759258.
• Лин П.Дж., Уильямс В.П., Луу И., Молдей Р.С., Орловски Дж., Нумата М. (май 2005 г.). «Секреторные белки мембран-носителей взаимодействуют и регулируют перенос органелларного (Na +, K +) / H + обменника NHE7». Журнал клеточной науки. 118 (Pt 9): 1885–97. Дои:10.1242 / jcs.02315. PMID  15840657.